Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

Thomas Mailund

  1. 2019
  2. E-pub ahead of print

    Breaking Free: the Genomics of Allopolyploidy-facilitated Niche Expansion in White Clover. / Griffiths, Andrew G; Moraga, Roger; Tausen, Marni; Gupta, Vikas; Bilton, Timothy P; Campbell, Matthew A; Ashby, Rachael Louise; Nagy, Istvan; Khan, Anar; Larking, Anna; Anderson, Craig; Franzmayr, Benjamin; Hancock, Kerry; Scott, Alicia; Ellison, Nick W; Cox, Murray; Asp, Torben; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H; Andersen, Stig U.

    I: The Plant Cell, 25.04.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. Udgivet

    Direct estimation of mutations in great apes reconciles phylogenetic dating. / Besenbacher, Søren; Hvilsom, Christina; Marques-Bonet, Tomas; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Nature Ecology and Evolution, Bind 3, Nr. 2, 01.02.2019, s. 286-292.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  4. Udgivet

    The comparative genomics and complex population history of Papio baboons. / Baboon Genome Analysis Consortium.

    I: Science Advances, Bind 5, Nr. 1, eaau6947, 30.01.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. Udgivet

    The Joys of Hashing: Hash Table Programming with C. / Mailund, Thomas.

    2019.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisningpeer review

  6. 2018
  7. Udgivet

    A comprehensive genomic history of extinct and living elephants. / Palkopoulou, Eleftheria; Lipson, Mark; Mallick, Swapan; Nielsen, Svend; Rohland, Nadin; Baleka, Sina; Karpinski, Emil; Ivancevic, Atma M; To, Thu-Hien; Kortschak, R Daniel; Raison, Joy M; Qu, Zhipeng; Chin, Tat-Jun; Alt, Kurt W; Claesson, Stefan; Dalén, Love; MacPhee, Ross D E; Meller, Harald; Roca, Alfred L; Ryder, Oliver A; Heiman, David; Young, Sarah; Breen, Matthew; Williams, Christina; Aken, Bronwen L; Ruffier, Magali; Karlsson, Elinor; Johnson, Jeremy; Di Palma, Federica; Alfoldi, Jessica; Adelson, David L; Mailund, Thomas; Munch, Kasper; Lindblad-Toh, Kerstin; Hofreiter, Michael; Poinar, Hendrik; Reich, David.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 115, Nr. 11, 03.2018, s. E2566-E2574.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  8. Udgivet

    Domain-Specific Languages in R: Advanced Statistical Programming. / Mailund, Thomas.

    Apress, 2018. 268 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisningpeer review

  9. 2017
  10. Udgivet

    Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population. / Jensen, Jacob Malte; Villesen, Palle; Friborg, Rune M; Mailund, Thomas; Besenbacher, Søren; Schierup, Mikkel H; Danish Pan-Genome Consortium (Jakob Grove, member of -).

    I: Genome Research, 09.2017, s. 1597-1607.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. Udgivet

    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference. / Maretty, Lasse; Jensen, Jacob Malte; Petersen, Bent; Sibbesen, Jonas Andreas; Liu, Siyang; Villesen, Palle; Skov, Laurits; Belling, Kirstine Christensen; Theil Have, Christian; Izarzugaza, José M G; Grosjean, Marie; Bork-Jensen, Jette; Grove, Jakob; Als, Thomas D; Huang, Shujia; Chang, Yuqi; Xu, Ruiqi; Ye, Weijian; Rao, Junhua; Guo, Xiaosen; Sun, Jihua; Cao, Hongzhi; Ye, Chen; van Beusekom, Johan; Espeseth, Thomas; Flindt, Esben Nørgaard; Friborg, Rune M; Halager, Anders E; Le Hellard, Stephanie; Hultman, Christina M; Lescai, Francesco; Li, Shengting; Lund, Ole; Løngren, Peter; Mailund, Thomas; Matey-Hernandez, Maria Luisa; Mors, Ole; Pedersen, Christian N S; Sicheritz-Ponten, Thomas; Sullivan, Patrick F; Syed, Ali; Westergaard, David; Yadav, Rachita; Li, Ning; Xu, Xun; Hansen, Torben; Krogh, Anders; Bolund, Lars; Sørensen, Thorkild I A; Pedersen, Oluf; Gupta, Ramneek; Rasmussen, Simon; Besenbacher, Søren; Børglum, Anders D; Wang, Jun; Eiberg, Hans; Kristiansen, Karsten; Brunak, Søren; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Nature, Bind 548, 03.08.2017, s. 87-91.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  12. Udgivet

    Fast admixture analysis and population tree estimation for SNP and NGS data. / Cheng, Jade Yu; Mailund, Thomas; Nielsen, Rasmus.

    I: Bioinformatics (Online), Bind 33, Nr. 14, 15.07.2017, s. 2148–2155.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. Udgivet

    admixturegraph : an R package for admixture graph manipulation and fitting. / Leppälä, Kalle; Nielsen, Svend; Mailund, Thomas.

    I: Bioinformatics (Online), Bind 33, Nr. 11, 01.06.2017, s. 1738-1740.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  14. Udgivet

    Evidence that the rate of strong selective sweeps increases with population size in the great apes. / Nam, Kiwoong; Munch, Kasper; Mailund, Thomas; Nater, Alexander; Greminger, Maja Patricia; Krützen, Michael; Marquès-Bonet, Tomàs; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 114, Nr. 7, 02.2017, s. 1613-1618.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  15. Udgivet

    The ecological niche and distribution of Neanderthals during the Last Interglacial. / Benito, Blas M.; Svenning, Jens-Christian; Kellberg-Nielsen, Trine; Riede, Felix; Gil-Romera, Graciela; Mailund, Thomas; Kjaergaard, Peter C.; Sandel, Brody S.

    I: Journal of Biogeography, Bind 44, Nr. 1, 01.2017, s. 51–61.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  16. Udgivet

    Advanced Object-Oriented Programming in R : Statistical Programming for Data Science, Analysis, and Finance . / Mailund, Thomas.

    Apress, 2017. 110 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisning

  17. Udgivet

    Beginning Data Science in R : Data Analysis, Visualization, and Modelling for the Data Scientist. / Mailund, Thomas.

    Apress, 2017. 352 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisning

  18. Udgivet

    Functional Programming in R : Advanced Statistical Programming for Data Science, Analysis and Finance . / Mailund, Thomas.

    Apress, 2017. 104 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisning

  19. Udgivet

    Functional data structures in R : advanced statistical programming in R. / Mailund, Thomas.

    Berkeley, CA : Apress, 2017.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningpeer review

  20. Udgivet

    Metaprogramming in R : Advanced Statistical Programming for Data Science, Analysis and Finance . / Mailund, Thomas.

    Apress, 2017. 103 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisning

  21. 2016
  22. Udgivet

    Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx. / Abascal, Federico; Corvelo, André; Cruz, Fernando; Villanueva-Cañas, José L; Vlasova, Anna; Marcet-Houben, Marina; Martínez-Cruz, Begoña; Cheng, Jade Yu; Prieto, Pablo; Quesada, Víctor; Quilez, Javier; Li, Gang; García, Francisca; Rubio-Camarillo, Miriam; Frias, Leonor; Ribeca, Paolo; Capella-Gutiérrez, Salvador; Rodríguez, José M; Câmara, Francisco; Lowy, Ernesto; Cozzuto, Luca; Erb, Ionas; Tress, Michael L; Rodriguez-Ales, Jose L; Ruiz-Orera, Jorge; Reverter, Ferran; Casas-Marce, Mireia; Soriano, Laura; Arango, Javier R; Derdak, Sophia; Galán, Beatriz; Blanc, Julie; Gut, Marta; Lorente-Galdos, Belen; Andrés-Nieto, Marta; López-Otín, Carlos; Valencia, Alfonso; Gut, Ivo; García, José L; Guigó, Roderic; Murphy, William J; Ruiz-Herrera, Aurora; Marques-Bonet, Tomas; Roma, Guglielmo; Notredame, Cedric; Mailund, Thomas; Albà, M Mar; Gabaldón, Toni; Alioto, Tyler; Godoy, José A.

    I: Genome Biology (Online), Bind 17, Nr. 1, 14.12.2016, s. 251.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  23. Udgivet

    Selective sweeps across twenty millions years of primate evolution. / Munch, Kasper; Nam, Kiwoong; Schierup, Mikkel Heide; Mailund, Thomas.

    I: Molecular Biology and Evolution, Bind 33, Nr. 12, 22.09.2016, s. 3065-3074.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  24. Udgivet

    Nationwide Genomic Study in Denmark Reveals Remarkable Population Homogeneity. / Athanasiadis, Georgios; Cheng, Jade Y; Vilhjálmsson, Bjarni J; Jørgensen, Frank G; Als, Thomas D; Le Hellard, Stephanie; Espeseth, Thomas; Sullivan, Patrick F; Hultman, Christina M; Kjærgaard, Peter C; Schierup, Mikkel H; Mailund, Thomas.

    I: Genetics, Bind 204, Nr. 2, 17.08.2016, s. 711-722.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  25. Udgivet

    A genomic history of Aboriginal Australia. / Malaspinas, Anna-Sapfo; Westaway, Michael C; Muller, Craig; Sousa, Vitor C; Lao, Oscar; Alves, Isabel; Athanasiadis, Georgios; Cheng, Jade Y; Crawford, Jacob E; Heupink, Tim H; Macholdt, Enrico; Peischl, Stephan; Schiffels, Stephan; Subramanian, Sankar; Wright, Joanne L; Albrechtsen, Anders; Barbieri, Chiara; Dupanloup, Isabelle; Eriksson, Anders; Margaryan, Ashot; Moltke, Ida; Pugach, Irina; Korneliussen, Thorfinn S; Levkivskyi, Ivan P; Moreno-Mayar, J Víctor; Ni, Shengyu; Racimo, Fernando; Sikora, Martin; Xue, Yali; Aghakhanian, Farhang A; Brucato, Nicolas; Brunak, Søren; Campos, Paula F; Clark, Warren; Ellingvåg, Sturla; Fourmile, Gudjugudju; Gerbault, Pascale; Injie, Darren; Koki, George; Leavesley, Matthew; Logan, Betty; Lynch, Aubrey; Matisoo-Smith, Elizabeth A; McAllister, Peter J; Mentzer, Alexander J; Metspalu, Mait; Migliano, Andrea B; Murgha, Les; Phipps, Maude E; Pomat, William; Reynolds, Doc; Ricaut, Francois-Xavier; Siba, Peter; Thomas, Mark G; Wales, Thomas; Wall, Colleen Ma'run; Oppenheimer, Stephen J; Tyler-Smith, Chris; Durbin, Richard; Dortch, Joe; Manica, Andrea; Schierup, Mikkel H; Foley, Robert A; Lahr, Marta Mirazón; Bowern, Claire; Wall, Jeffrey D; Mailund, Thomas; Stoneking, Mark; Sandhu, Manjinder S; Excoffier, Laurent; Lambert, David M; Willerslev, Eske.

    I: Nature, Bind 538, Nr. 7624, 2016, s. 207-214.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  26. Udgivet

    Measurement units in R. / Pebesma, Edzer; Mailund, Thomas; Hiebert, James.

    I: The R Journal, Bind 8, Nr. 2, 2016, s. 486-494.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  27. Udgivet

    Spitting for Science : Danish High School Students Commit to a Large-Scale Self-Reported Genetic Study. / Athanasiadis, Georgios; Jorgensen, Frank G.; Cheng, Jade Y.; Kjaergaard, Peter C.; Schierup, Mikkel H.; Mailund, Thomas.

    I: P L o S One, Bind 11, Nr. 8, e0161822, 2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  28. 2015
  29. Udgivet

    Ancestral population genomics using coalescence hidden Markov models and heuristic optimisation algorithms. / Cheng, Jade Yu; Mailund, Thomas.

    I: Computational Biology and Chemistry, Bind 57, 08.2015, s. 80-92.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  30. Udgivet

    Strong Selective Sweeps on the X Chromosome in the Human-Chimpanzee Ancestor Explain Its Low Divergence. / Dutheil, Julien Y; Munch, Kasper; Nam, Kiwoong; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H.

    I: P L o S Genetics, Bind 11, Nr. 8, 08.2015, s. e1005451.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet

    Extreme selective sweeps independently targeted the X chromosomes of the great apes. / Nam, Kiwoong; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Dutheil, Julien Yann; Veeramah, Krishna R; Woerner, August E; Hammer, Michael F; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Great Ape Genome Diversity Project.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 112, Nr. 20, 04.05.2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Inference of purifying and positive selection in three subspecies of chimpanzees (Pan troglodytes) from exome sequencing. / Bataillon, Thomas; Duan, Jinjie; Hvilsom, Christina; Jin, Xin; Li, Yingrui; Skov, Laurits; Glemin, Sylvain; Munch, Kasper; Jiang, Tao; Qian, Yu; Hobolth, Asger; Wang, Jun; Mailund, Thomas; Siegismund, Hans R; Schierup, Mikkel H.

    I: Genome Biology and Evolution, Bind 7, Nr. 4, 04.2015, s. 1122-32.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    Novel variation and de novo mutation rates in population-wide de novo assembled Danish trios. / Besenbacher, Søren; Liu, Siyang; Izarzugaza, José M G; Grove, Jakob; Belling, Kirstine; Bork-Jensen, Jette; Huang, Shujia; Als, Thomas D; Li, Shengting; Yadav, Rachita; Rubio-García, Arcadio; Lescai, Francesco; Demontis, Ditte; Rao, Junhua; Ye, Weijian; Mailund, Thomas; Møllegaard Friborg, Rune; Pedersen, Christian N S; Xu, Ruiqi; Sun, Jihua; Liu, Hao; Wang, Ou; Cheng, Xiaofang; Flores, David; Rydza, Emil; Rapacki, Kristoffer; Damm Sørensen, John; Chmura, Piotr; Westergaard, David; Dworzynski, Piotr; Sørensen, Thorkild I A; Lund, Ole; Hansen, Torben; Xu, Xun; Li, Ning; Bolund, Lars; Pedersen, Oluf; Eiberg, Hans; Krogh, Anders; Børglum, Anders D; Brunak, Søren; Kristiansen, Karsten; Schierup, Mikkel H; Wang, Jun; Gupta, Ramneek; Villesen, Palle; Rasmussen, Simon.

    I: Nature Communications, Bind 6, 5969, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  34. 2014
  35. Udgivet

    Unraveling recombination rate evolution using ancestral recombination maps. / Munch, Kasper; Schierup, Mikkel H; Mailund, Thomas.

    I: BioEssays, Bind 36, Nr. 9, 14.07.2014, s. 892-900.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  36. Udgivet

    Strong selective sweeps associated with ampliconic regions in great ape X chromosomes. / Nam, Kiwoong; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Y. Dutheil, Julien; Veeramah, Krishna; Woerner, August; F. Hammer, Michael; Ape Genome Diversity Project, Great; Mailund, Thomas; H. Schierup, Mikkel.

    I: arXiv, 24.02.2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskning

  37. Udgivet

    Lineage sorting in apes. / Mailund, Thomas; Munch, Kasper; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Annual Review of Genetics, Bind 48, 01.01.2014, s. 519-535.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  38. Udgivet

    A fine-scale recombination map of the human-chimpanzee ancestor reveals faster change in humans than in chimpanzees and a strong impact of GC-biased gene conversion. / Munch, Kasper; Mailund, Thomas; Dutheil, Julien Y; Schierup, Mikkel H.

    I: Genome Research, 2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  39. Udgivet

    Efficient computation in the IM model. / Andersen, Lars Nørvang; Mailund, Thomas; Hobolth, Asger.

    I: Journal of Mathematical Biology, Bind 68, Nr. 6, 2014, s. 1423-1451.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  40. Udgivet

    Identifying disease associated genes by network propagation. / Qian, Yu; Besenbacher, Soren; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    I: B M C Systems Biology, Bind 8, Nr. Suppl 1, 2014, s. S6.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  41. Udgivet

    Inferring the Process of Human–Chimpanzee Speciation. / Mailund, Thomas; Munch, Kasper; Schierup, Mikkel Heide.

    Encyclopedia of Life Sciences. Wiley, 2014.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingReviewForskning

  42. Udgivet

    tqDist: A Library for Computing the Quartet and Triplet Distances Between Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens; Brodal, Gerth Stølting; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 30, Nr. 4, 2014, s. 2079-2080.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  43. 2013
  44. Udgivet

    zipHMMlib: a highly optimised HMM library exploiting repetitions in the input to speed up the forward algorithm. / Sand, Andreas; Kristiansen, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas.

    I: BMC Bioinformatics , Bind 14, Nr. 339, 12.2013, s. 339-348.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  45. Udgivet

    Algorithms for Hidden Markov Models Restricted to Occurrences of Regular Expressions. / Tataru, Paula; Sand, Andreas; Hobolth, Asger; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 08.11.2013, s. 1282-1295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  46. Udgivet

    Hvor kommer du fra? En undersøgelse af danskernes genetiske historie. / Jørgensen, Frank Grønlund; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Kjærgaard, Peter C.

    I: Biofag, Bind 3, 08.2013, s. 18-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelFormidling

  47. Udgivet

    A practical O(n log2 n) time algorithm for computing the triplet distance on binary trees. / Sand, Andreas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 14, Nr. Suppl 2, 2013, s. S18.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  48. Udgivet

    Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distances for Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Brodal, Gerth Stølting; Mailund, Thomas.

    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 2013, s. 1189-1209.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  49. Udgivet

    Efficient Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degree. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Sand, Andreas.

    I: The Annual A C M - S I A M Symposium on Discrete Algorithms. Proceedings, Bind 24, 2013, s. 1814-1832.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  50. Udgivet

    Great ape genetic diversity and population history. / Prado-Martinez, Javier; Sudmant, Peter H; Kidd, Jeffrey M; Li, Heng; Kelley, Joanna L; Lorente-Galdos, Belen; Veeramah, Krishna R; Woerner, August E; O'Connor, Timothy D; Santpere, Gabriel; Cagan, Alexander; Theunert, Christoph; Casals, Ferran; Laayouni, Hafid; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Halager, Anders E; Malig, Maika; Hernandez-Rodriguez, Jessica; Hernando-Herraez, Irene; Prüfer, Kay; Pybus, Marc; Johnstone, Laurel; Lachmann, Michael; Alkan, Can; Twigg, Dorina; Petit, Natalia; Baker, Carl; Hormozdiari, Fereydoun; Fernandez-Callejo, Marcos; Dabad, Marc; Wilson, Michael L; Stevison, Laurie; Camprubí, Cristina; Carvalho, Tiago; Ruiz-Herrera, Aurora; Vives, Laura; Mele, Marta; Abello, Teresa; Kondova, Ivanela; Bontrop, Ronald E; Pusey, Anne; Lankester, Felix; Kiyang, John A; Bergl, Richard A; Lonsdorf, Elizabeth; Myers, Simon; Ventura, Mario; Gagneux, Pascal; Comas, David; Siegismund, Hans; Blanc, Julie; Agueda-Calpena, Lidia; Gut, Marta; Fulton, Lucinda; Tishkoff, Sarah A; Mullikin, James C; Wilson, Richard K; Gut, Ivo G; Gonder, Mary Katherine; Ryder, Oliver A; Hahn, Beatrice H; Navarro, Arcadi; Akey, Joshua M; Bertranpetit, Jaume; Reich, David; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H; Hvilsom, Christina; Andrés, Aida M; Wall, Jeffrey D; Bustamante, Carlos D; Hammer, Michael F; Eichler, Evan E; Marques-Bonet, Tomas.

    I: Nature, Bind 499, 2013, s. 471–475.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  51. 2012
  52. Udgivet

    Using colored Petri nets to construct coalescent hidden markov models : Automatic translation from demographic specifications to efficient inference methods. / Mailund, Thomas; Halager, A.E.; Westergaard, M.

    I: Lecture Notes in Computer Science, Bind 7347, 01.01.2012, s. 32-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  53. Udgivet

    A New Isolation with Migration Model along Complete Genomes Infers Very Different Divergence Processes among Closely Related Great Ape Species. / Mailund, Thomas; Halager, Anders E; Westergaard, Michael; Dutheil, Julien Y; Munch, Kasper; Andersen, Lars N; Lunter, Gerton; Prüfer, Kay; Scally, Aylwyn; Hobolth, Asger; Schierup, Mikkel H.

    I: P L o S Genetics, Bind 8, Nr. 12, 2012, s. e1003125.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  54. Udgivet

    An effort to use human-based exome capture methods to analyze chimpanzee and macaque exomes. / Jin, Xin; He, Mingze; Ferguson, Betsy; Meng, Yuhuan; Ouyang, Limei; Ren, Jingjing; Mailund, Thomas; Sun, Fei; Sun, Liangdan; Shen, Juan; Zhuo, Min; Song, Li; Wang, Jufang; Ling, Fei; Zhu, Yuqi; Hvilsom, Christina; Siegismund, Hans; Liu, Xiaoming; Gong, Zhuolin; Ji, Fang; Wang, Xinzhong; Liu, Boqing; Zhang, Yu; Hou, Jianguo; Wang, Jing; Zhao, Hua; Wang, Yanyi; Fang, Xiaodong; Zhang, Guojie; Wang, Jian; Zhang, Xuejun; Schierup, Mikkel H; Du, Hongli; Wang, Jun; Wang, Xiaoning.

    I: P L o S One, Bind 7, Nr. 7, 2012, s. e40637.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  55. Udgivet

    Association mapping and disease : evolutionary perspectives. / Besenbacher, Søren; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H.

    I: Methods in Molecular Biology, Bind 856, 2012, s. 275-91.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  56. Udgivet

    Cultural phylogenetics of the tupi language family in lowland South america. / Walker, Robert S; Wichmann, Søren; Mailund, Thomas; Atkisson, Curtis J.

    I: P L o S One, Bind 7, Nr. 4, 2012, s. e35025.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  57. Udgivet

    Extensive X-linked adaptive evolution in central chimpanzees. / Hvilsom, Christina; Qian, Yu; Bataillon, Thomas; Li, Yingrui; Mailund, Thomas; Sallé, Bettina; Carlsen, Frands; Li, Ruiqiang; Zheng, Hancheng; Jiang, Tao; Jiang, Hui; Jin, Xin; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Siegismund, Hans R; Wang, Jun; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  58. Udgivet

    Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence. / Scally, Aylwyn; Dutheil, Julien Y; Hillier, LaDeana W; Jordan, Gregory E; Goodhead, Ian; Herrero, Javier; Hobolth, Asger; Lappalainen, Tuuli; Mailund, Thomas; Marques-Bonet, Tomas; McCarthy, Shane; Montgomery, Stephen H; Schwalie, Petra C; Tang, Y Amy; Ward, Michelle C; Xue, Yali; Yngvadottir, Bryndis; Alkan, Can; Andersen, Lars N; Ayub, Qasim; Ball, Edward V; Beal, Kathryn; Bradley, Brenda J; Chen, Yuan; Clee, Chris M; Fitzgerald, Stephen; Graves, Tina A; Gu, Yong; Heath, Paul; Heger, Andreas; Karakoc, Emre; Kolb-Kokocinski, Anja; Laird, Gavin K; Lunter, Gerton; Meader, Stephen; Mort, Matthew; Mullikin, James C; Munch, Kasper; O'Connor, Timothy D; Phillips, Andrew D; Prado-Martinez, Javier; Rogers, Anthony S; Sajjadian, Saba; Schmidt, Dominic; Shaw, Katy; Simpson, Jared T; Stenson, Peter D; Turner, Daniel J; Vigilant, Linda; Vilella, Albert J; Whitener, Weldon; Zhu, Baoli; Cooper, David N; de Jong, Pieter; Dermitzakis, Emmanouil T; Eichler, Evan E; Flicek, Paul; Goldman, Nick; Mundy, Nicholas I; Ning, Zemin; Odom, Duncan T; Ponting, Chris P; Quail, Michael A; Ryder, Oliver A; Searle, Stephen M; Warren, Wesley C; Wilson, Richard K; Schierup, Mikkel H; Rogers, Jane; Tyler-Smith, Chris; Durbin, Richard.

    I: Nature, Bind 483, Nr. 7388, 2012, s. 169-75.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  59. Udgivet

    Polar and brown bear genomes reveal ancient admixture and demographic footprints of past climate change. / Miller, Webb; Schuster, Stephan C; Welch, Andreanna J; Ratan, Aakrosh; Bedoya-Reina, Oscar C; Zhao, Fangqing; Kim, Hie Lim; Burhans, Richard C; Drautz, Daniela I; Wittekindt, Nicola E; Tomsho, Lynn P; Ibarra-Laclette, Enrique; Herrera-Estrella, Luis; Peacock, Elizabeth; Farley, Sean; Sage, George K; Rode, Karyn; Obbard, Martyn; Montiel, Rafael; Bachmann, Lutz; Ingólfsson, Olafur; Aars, Jon; Mailund, Thomas; Wiig, Oystein; Talbot, Sandra L; Lindqvist, Charlotte.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  60. Udgivet

    The bonobo genome compared with the chimpanzee and human genomes. / Prüfer, Kay; Munch, Kasper; Hellmann, Ines; Akagi, Keiko; Miller, Jason R; Walenz, Brian; Koren, Sergey; Sutton, Granger; Kodira, Chinnappa; Winer, Roger; Knight, James R; Mullikin, James C; Meader, Stephen J; Ponting, Chris P; Lunter, Gerton; Higashino, Saneyuki; Hobolth, Asger; Dutheil, Julien; Karakoç, Emre; Alkan, Can; Sajjadian, Saba; Catacchio, Claudia Rita; Ventura, Mario; Marques-Bonet, Tomas; Eichler, Evan E; André, Claudine; Atencia, Rebeca; Mugisha, Lawrence; Junhold, Jörg; Patterson, Nick; Siebauer, Michael; Good, Jeffrey M; Fischer, Anne; Ptak, Susan E; Lachmann, Michael; Symer, David E; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H; Andrés, Aida M; Kelso, Janet; Pääbo, Svante.

    I: Nature, Bind 486, Nr. 7404, 2012, s. 527-31.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  61. Udgivet

    The sweep-line state space exploration method. / Jensen, Kurt; Kristensen, Lars M.; Mailund, Thomas.

    I: Theoretical Computer Science, Bind 429, 2012, s. 169–179.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  62. 2011
  63. Udgivet

    Local Genealogies in a Linear Mixed Model for Genome-wide Association Mapping in Complex Pedigreed Populations. / Sahana, Goutam; Mailund, Thomas; Lund, Mogens Sandø; Guldbrandtsen, Bernt.

    I: P L o S One, Bind 6, Nr. 11, 11.2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  64. Udgivet

    A sub-cubic time algorithm for computing the quartet distance between two general trees. / Nielsen, Jesper; Kristensen, Anders Kabell; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 6, Nr. 15, 03.06.2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  65. Udgivet

    Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes. / Locke, Devin P.; Hillier, LaDeana W.; Warren, Wesley C.; Yang, Shiaw-Pyng; Wang, Zhengyuan; Chinwalla, Asif T.; Minx, Pat; Mitreva, Makedonka; Cook, Lisa; Delehaunty, Kim D.; Fronick, Catrina; Schmidt, Heather; Fulton, Lucinda A.; Fulton, Robert S.; Nelson, Joanne O.; Magrini, Vincent; Pohl, Craig; Graves, Tina A.; Markovic, Chris; Weinstock, George M.; Mardis, Elaine R.; Wilson, Richard K.; Worley, Kim C.; Nazareth, Lynne V.; Muzny, Donna M.; Cree, Andy; Dinh, Huyen H.; Hume, Jennifer; Kovar, Christie L.; Fowler, Gerald R.; Rogers, Jeffrey; Gibbs, Richard A.; Lunter, Gerton; Meader, Stephen; Heger, Andreas; Ponting, Chris P.; Marques-Bonet, Tomas; Alkan, Can; Cheng, Lin; Cheng, Ze; Kidd, Jeffrey M.; Eichler, Evan E.; Faria, Rui; Fernando, Olga; Darré, Fleur; Farré, Domèmec; Gazave, Elodie; Oliva, Meritxell; Navarro, Arcadi; White, Simon; Searle, Stephen; Vilella, Albert J.; Chen, Yuan; Flicek, Paul; Herrero, Javier; Ma, Jian; Raney, Brian; Suh, Bernard; Haussler, David; Burhans, Richard; Ratan, Aakrosh; Harris, Robert S.; Miller, Webb; Roberto, Roberta; Capozzi, Oronzo; Archidiacono, Nicoletta; Rocchi, Mariano; Della Valle, Giuliano; Purgato, Stefania; Konkel, Miriam K.; Walker, Jerilyn A.; Batzer, Mark A.; Ullmer, Brygg; Smit, Adrian F. A.; Hubley, Robert; Casola, Claudio; Schrider, Daniel R.; Hahn, Matthew W.; Quesada, Victor; Puente, Xose S.; Ordoñez, Gonzalo R.; López-Otín, Carlos; Vinar, Tomas; Brejova, Brona; Kosiol, Carolin; Lawson, Heather A.; Taliwal, Vikas; Martins, André L.; Siepel, Adam; Ma, Xin; Degenhardt, Jeremiah; RoyChoudhury, Arindam; Bustamante, Carlos D.; Gutenkunst, Ryan N.; Mailund, Thomas; Dutheil, Julien; Hobolth, Asger; Schierup, Mikkel Heide; Ryder, Oliver A.; Yoshinaga, Yuko; de Jong, Pieter J.

    I: Nature, Bind 469, 2011, s. 529-533.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  66. Udgivet

    Estimating Divergence Time and Ancestral Effective Population Size of Bornean and Sumatran Orangutan Subspecies Using a Coalescent Hidden Markov Model. / Mailund, Thomas; Dutheil, Julien; Hobolth, Asger; Lunter, Gerton; Schierup, Mikkel Heide.

    I: P L o S Genetics, Bind 7, Nr. 3, 2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  67. Udgivet

    Incomplete lineage sorting patterns among human, chimpanzee and orangutan suggest recent orangutan speciation and widespread selection. / Hobolth, Asger; Dutheil, Julien; Hawks, John; Schierup, Mikkel Heide; Mailund, Thomas.

    I: Genome Research, Bind 21, Nr. 3, 2011, s. 349-356.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  68. Udgivet

    Inference of Large Phylogenies Using Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bind 127, Nr. 5, 2011, s. 334-344.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  69. Udgivet

    On computing the coalescence time density in an isolation-with-migration model with few samples. / Hobolth, Asger; Andersen, Lars Nørvang; Mailund, Thomas.

    I: Genetics, Bind 187, 2011, s. 1242-1243.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisLetterForskningpeer review

  70. 2010
  71. Udgivet

    Using the Power of Modern Processors in Bioformatics. / Simonsen, Martin; Sand, Andreas; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    2010. Poster session præsenteret ved Conference on IT research at AU, Århus, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  72. Udgivet

    A new powerful method for genome-wide association mapping using local phylogenies in a mixed model. / Sahana, Goutam; Lund, Mogens Sandø; Mailund, Thomas; Guldbrandtsen, Bernt.

    2010. Paper præsenteret ved 9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Leipzig, Tyskland.

    Publikation: KonferencebidragPaperForskningpeer review

  73. Udgivet

    Building Very Large Neighbour-Joining Trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    BIOINFORMATICS 2010: Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics (part of the 3rd International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2010). red. / Ana Fred; Joaquim Filipe; Hugo Gamboa. Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication, 2010. s. 26.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  74. Udgivet

    HMMlib: A C++ Library for General Hidden Markov Models Exploiting Modern CPUs. / Sand, Andreas; Brask, Asbjørn Tølbøl; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brask, Asbjørn Tølbøl.

    2010 Ninth International Workshop on Parallel and Distributed Methods in Verification and Second International Workshop on High Performance Computational Systems Biology. IEEE, 2010. s. 126 - 134 .

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  75. 2009
  76. Udgivet

    A Quadratic Time Algorithm for Computing the Quartet Distance between Two General Trees. / Mailund, Thomas; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Storm.

    Proceedings of IJCBS 2009. IEEE Computer Society Press, 2009. s. 565-568.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  77. Udgivet

    A fast algorithm for genome wide haplotype pattern mining. / Besenbacher, Søren; Pedersen, Christian Storm; Mailund, Thomas.

    I: B M C Bioinformatics, Nr. suppl. 1, 2009, s. 772.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  78. Udgivet

    Ancestral population genomics : the coalescent hidden Markov model approach. / Dutheil, Julien; Ganapathy, Ganesh; Hobolth, Asger; Mailund, Thomas; Uyenoyama, Marcy; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Genetics, Bind 183, Nr. 1, 2009, s. 259–274.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  79. Udgivet

    Building very large neighbour-joining trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  80. Udgivet

    Haplotype frequencies in a sub-region of chromosome 19q13.3, related to risk and prognosis of cancer, differ dramatically between ethnic groups. / Schierup, Mikkel H; Mailund, Thomas; Li, Heng; Wang, Jun; Tjønneland, Anne; Vogel, Ulla; Bolund, Lars; Nexø, Bjørn A.

    I: B M C Medical Genetics, Bind 10, 2009, s. 20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  81. Udgivet

    Local phylogeny mapping of quantitative traits: Higher accuracy and better ranking than single marker association in genomewide scans. / Besenbacher, Søren; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Genetics, Bind 181, 2009, s. 747-753.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  82. Udgivet

    Using biological networks to search for interacting loci in genomewide association studies. / Emily, Mathieu; Mailund, Thomas; Hein, Jotun; Schauser, Leif; Schierup, Mikkel Heide.

    I: European Journal of Human Genetics, 2009.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  83. 2008
  84. Udgivet

    SNPFile - A software library and file format for large scale association mapping and population genetics studies. / Nielsen, Jesper; Mailund, Thomas.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 9, Nr. 526, 08.12.2008, s. 1-11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  85. Udgivet

    Computing the all-pairs quartet distance on a set of evolutionary trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    I: Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Bind 6, Nr. 1, 2008, s. 37-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  86. Udgivet

    Efficient Whole-Genome Association Mapping using Local Phylogenies for Unphased Genome Data. / Ding, Zhihong; Mailund, Thomas; Song, Yun.

    I: Bioinformatics, 2008, s. 2215-2221.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  87. Udgivet

    Investigating Selection on Viruses: A Statistical Alignment Approach. / de Groot, Saskia; Mailund, Thomas; Lunter, Gerton; Hein, Jotun.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 9, Nr. 308, 2008.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  88. Udgivet

    Local Phylogeny Mapping of Quantitative Traits: Higher Accuracy and Better Ranking Than Single Marker Association in Genomewide Scans. / Besenbacher, Søren; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H.

    I: Genetics, 2008.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  89. Udgivet

    Rapid Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.

    Proceedings of the 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2008. s. 113-122.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  90. 2007
  91. Udgivet

    Annotation of selection strengths in viral genomes. / McCauley, Stephen; de Groot, Saskia; Mailund, Thomas; Hein, Jotun.

    I: Bioinformatics, Bind 23, Nr. 22, 2007, s. 2978-2986.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  92. Udgivet

    Comparative Annotation of Viral Genomes with Non-Conserved Gene Structure. / de Groot, Saskia; Mailund, Thomas; Hein, Jotun.

    I: Bioinformatics, Bind 23, Nr. 9, 2007, s. 1080-1089.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  93. Udgivet

    Computing the All-Pairs Quartet Distance on a Set of Evolutionary Trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 91-100.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  94. Udgivet

    Computing the Quartet Distance between Evolutionary Trees of Bounded Degree. / Stissing, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brodal, Gerth Stølting.

    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 101-110.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  95. Udgivet

    Experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas; Vinter, Brian; Karlsen, Henrik.

    I: Future Generation Computer Systems - The International Journal of eScience, Bind 23, 2007, s. 580-586.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  96. Udgivet

    Genomic Relationships and Speciation Times of Human, Chimpanzee and Gorilla inferred from a Coalescent Hidden Markov Model. / Hobolth, Asger; Christensen, Ole Fredslund; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    2007. Poster session præsenteret ved Beyond the HapMap, Boston, USA.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  97. Udgivet

    Genomic relationships and speciation times of human, chimpanzee and gorilla inferred from a coalescent hidden Markov model. / Hobolth, Asger; Christensen, Ole Fredslund; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    I: P L o S Genetics, Bind 3, Nr. 2, 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  98. Udgivet

    On Recombination-Induced Multiple and Simultaneous Coalescent Events. / Davies, Joanna; Simancik, Frantisek; Lyngsø, Rune; Mailund, Thomas; Hein, Jotun.

    I: Genetics, Bind 177, 2007, s. 2151-2160.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  99. 2006
  100. Udgivet

    Analysing Infinite-State Systems by Combining Equivalence Reduction and the Sweep-Line Method. / Mailund.

    Proceedings of International Conference on Application and Theory of Petri Nets (ICATPN 2002). 2006. s. 314-333.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskning

  101. Udgivet

    CoaSim Guile Manual — Using the Guile-based CoaSim Simulator. / Mailund, T.

    2006.

    Publikation: Working paperForskning

  102. Udgivet

    Fast Calculation of the Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degrees. / Christiansen, Chris; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Randers, Martin; Stissing, Martin.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 1, Nr. 16, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  103. Udgivet
  104. Udgivet

    GeneRecon—A coalescent based tool for fine-scale association mapping. / Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Madsen, Jesper Nymann; Hein, Jotun; Schauser, Leif.

    I: Bioinformatics, Bind 22, Nr. 18, 2006, s. 2317–2318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  105. Udgivet

    Getting Started with Blossoc. / Mailund, Thomas.

    2006.

    Publikation: Working paperForskning

  106. Udgivet
  107. Udgivet
  108. Udgivet

    Recrafting the Neighbor-Joining Method. / Mailund, ; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Phillips, Derek.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 7, Nr. 29, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  109. Udgivet

    The effective size of the Icelandic population and the prospects for LD mapping: inference from unphased microsatellite markers. / Bataillon, Thomas; Mailund, Thomas; Thorlacius, Steinunn; Steingrimsson, Eirikur; Rafnar, Thorunn; Halldorsson, Magnus; Calian, Violeta; Schierup, Mikkel Heide.

    I: European Journal of Human Genetics, Bind 14, 2006, s. 1044–1053.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  110. Udgivet

    Whole genome association mapping by incompatibilities and local perfect phylogenies. / Mailund, Thomas; Besenbacher, Søren; Schierup, Mikkel Heide.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 7, Nr. 454, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  111. 2005
  112. Udgivet

    CoaSim: A Flexible Environment for Simulating Genetic Data under Coalescent Models. / Mailund, ; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mechlenborg, Peter; Madsen, Jesper N; Schauser, Leif.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 6, Nr. 252, 2005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  113. Udgivet

    Computing the Quartet Distance between Trees of Arbitrary Degree. / Christiansen, Chris; Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Randers, Martin.

    Proceedings of the 5th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2005. s. 77-88.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  114. Udgivet
  115. Udgivet

    Initial experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas; Vinter, Brian; Karlsen, Henrik H.

    Proceedings of The 2005 International Conference on Grid Computing and Applications (GCA). 2005.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

Forrige 1 2 Næste