Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

English

Du er her: AU » Om AU » Organisation » Thomas Birkballe Hansen » Publikationer

Om AU

Thomas Birkballe Hansen

1 - 40 ud af 40Pr. side: 100
RSS feed af denne liste
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2021
  2. Udgivet

    The RNA-binding protein SFPQ preserves long-intron splicing and regulates circRNA biogenesis in mammals. / Stagsted, Lotte Victoria Winther; O'Leary, Eoghan Thomas; Ebbesen, Karoline Kragh; Hansen, Thomas Birkballe.

    I: eLife, Bind 10, 21.01.2021.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  3. 2020
  4. Udgivet

    Spatial expression analyses of the putative oncogene ciRS-7 in cancer reshape the microRNA sponge theory. / Kristensen, Lasse S.; Ebbesen, Karoline K.; Sokol, Martin; Jakobsen, Theresa; Korsgaard, Ulrik; Eriksen, Ann C.; Hansen, Thomas B.; Kjems, Jørgen; Hager, Henrik.

    I: Nature Communications, Bind 11, 4551, 12.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  5. Udgivet

    circZNF827 nucleates a transcription inhibitory complex to balance neuronal differentiation. / Hollensen, Anne Kruse; Thomsen, Henriette Sylvain; Lloret-Llinares, Marta; Kamstrup, Andreas Bjerregaard; Jensen, Jacob Malte; Luckmann, Majbritt; Birkmose, Nanna; Palmfeldt, Johan; Jensen, Torben Heick; Hansen, Thomas B; Damgaard, Christian Kroun.

    I: eLife, Bind 9, e58478, 11.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  6. Udgivet

    RNA-Seq profiling of leukocytes reveals a sex-dependent global circular RNA upregulation in multiple sclerosis and 6 candidate biomarkers. / Iparraguirre, Leire; Alberro, Ainhoa; Sepúlveda, Lucía; Osorio-Querejeta, Iñaki; Moles, Laura; Castillo-Triviño, Tamara; Hansen, Thomas B.; Muñoz-Culla, Maider; Otaegui, David.

    I: Human Molecular Genetics, Bind 29, Nr. 20, 10.2020, s. 3361-3372.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  7. Udgivet

    Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-wide Interspersed Repeats. / Yoshimoto, Rei; Rahimi, Karim; Hansen, Thomas B.; Kjems, Jørgen; Mayeda, Akila.

    I: iScience, Bind 23, Nr. 7, 101345, 07.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  8. 2019
  9. Udgivet

    High-throughput RNA sequencing from paired lesional- and non-lesional skin reveals major alterations in the psoriasis circRNAome. / Moldovan, Liviu-Ionut; Hansen, Thomas Birkballe; Venø, Morten Trillingsgaard; Okholm, Trine Line Hauge; Andersen, Thomas Levin; Hager, Henrik; Iversen, Lars; Kjems, Jørgen; Johansen, Claus; Kristensen, Lasse Sommer.

    I: BMC Medical Genomics, Bind 12, Nr. 1, 174, 27.11.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  10. Udgivet

    The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs. / Kristensen, Lasse Sommer; Schertz Andersen, Maria; Stagsted, Lotte Victoria Winther; Ebbesen, Karoline; Hansen, Thomas Birkballe; Kjems, Jørgen.

    I: Nature Reviews. Genetics, Bind 20, Nr. 11, 11.2019, s. 675-691.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review

  11. Udgivet

    Noncoding AUG circRNAs constitute an abundant and conserved subclass of circles. / Stagsted, Lotte Vw; Nielsen, Katrine; Daugaard, Iben; Hansen, Thomas B.

    I: Life science alliance, Bind 2, Nr. 3, e201900398, 06.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  12. Udgivet

    CircSMARCA5 regulates VEGFA mRNA splicing and angiogenesis in glioblastoma multiforme through the binding of SRSF1. / Barbagallo, Davide; Caponnetto, Angela; Brex, Duilia; Mirabella, Federica; Barbagallo, Cristina; Lauretta, Giovanni; Morrone, Antonio; Certo, Francesco; Broggi, Giuseppe; Caltabiano, Rosario; Barbagallo, Giuseppe M.; Spina-Purrello, Vittoria; Ragusa, Marco; Di Pietro, Cinzia; Hansen, Thomas B.; Purrello, Michele.

    I: Cancers, Bind 11, Nr. 2, 194, 01.02.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  13. 2018
  14. Udgivet

    Enhanced Tailored MicroRNA Sponge Activity of RNA Pol II-Transcribed TuD Hairpins Relative to Ectopically Expressed ciRS7-Derived circRNAs. / Hollensen, Anne Kruse; Andersen, Sofie; Hjorth, Karina; Bak, Rasmus O; Hansen, Thomas B; Kjems, Jørgen; Aagaard, Lars; Damgaard, Christian Kroun; Mikkelsen, Jacob Giehm.

    I: Molecular Therapy - Nucleic Acids, Bind 13, 07.12.2018, s. 365-375.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  15. Udgivet

    Improved circRNA identification by combining prediction algorithms. / Hansen, Thomas B.

    I: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Bind 6, Nr. MAR, 20, 05.03.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  16. Udgivet

    CircSMARCA5 inhibits migration of glioblastoma multiforme cells by regulating a molecular axis involving splicing factors SRSF1/SRSF3/PTB. / Barbagallo, Davide; Caponnetto, Angela; Cirnigliaro, Matilde; Brex, Duilia; Barbagallo, Cristina; D’Angeli, Floriana; Morrone, Antonio; Caltabiano, Rosario; Barbagallo, Giuseppe Maria; Ragusa, Marco; Di Pietro, Cinzia; Hansen, Thomas Birkballe; Purrello, Michele.

    I: International Journal of Molecular Sciences, Bind 19, Nr. 2, 480, 06.02.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  17. Udgivet

    Circular RNAs in cancer : opportunities and challenges in the field. / Kristensen, L S; Hansen, T B; Venø, M T; Kjems, J.

    I: Oncogene, Bind 37, 01.02.2018, s. 555–565.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review

  18. Udgivet

    Characterization of circular RNA concatemers. / Hansen, Thomas B.

    Circular RNAs : Methods and Protocols. red. / C. Dietrerich; A. Papantonis. Bind 1724 New York : Humana Press, 2018. s. 143-157 (Methods in Molecular Biology, Bind 1724).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  19. Udgivet

    Detecting Agotrons in Ago CLIPseq Data. / Hansen, Thomas B.

    miRNA Biogenesis: Methods in Molecular Biology. red. / U. Ørum. Bind 1823 New York : Springer, 2018. s. 221-232 (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  20. Udgivet

    Enzyme-free digital counting of endogenous circular RNA molecules in B-cell malignancies. / Dahl, Mette; Daugaard, Iben; Andersen, Maria Schertz; Hansen, Thomas Birkballe; Grønbæk, Kirsten; Kjems, Jørgen; Kristensen, Lasse Sommer.

    I: Laboratory Investigation, Bind 98, 2018, s. 1657–1669.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  21. 2017
  22. Udgivet

    Circular RNA expression is abundant and correlated to aggressiveness in early-stage bladder cancer. / Okholm, Trine Line Hauge; Nielsen, Morten Muhlig; Hamilton, Mark; Christensen, Lise-Lotte; Vang, Søren; Hedegaard, Jakob; Hansen, Thomas Birkballe; Kjems, Jørgen; Dyrskjøt, Lars; Pedersen, Jakob Skou.

    I: npj Genomic Medicine, Bind 2, 36, 28.11.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  23. Udgivet

    The invasion of circRNAs. / Hansen, Thomas B.; Kjems, Jørgen.

    I: RNA Biology, Bind 14, Nr. 8, 06.10.2017, s. 973-974.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Leder › peer review

  24. Udgivet

    CircCCDC66: the colorectal oncogene. / Nielsen, Katrine; Hansen, Thomas Birkballe.

    I: Non-coding RNA Investigation, 08.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Formidling

  25. Udgivet

    The agotrons: Gene regulators or Argonaute protectors? / Stagsted, Lotte V W; Daugaard, Iben; Hansen, Thomas B.

    I: BioEssays, Bind 39, Nr. 4, 07.03.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  26. Udgivet

    Biogenesis and Function of Ago-Associated RNAs. / Daugaard, Iben; Hansen, Thomas Birkballe.

    I: Trends in Genetics, Bind 33, Nr. 3, 03.2017, s. 208-219.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  27. Udgivet

    Insights into circular RNA biology. / Ebbesen, Karoline K; Hansen, Thomas B; Kjems, Jørgen.

    I: RNA Biology, Bind 14, Nr. 8, 20.01.2017, s. 1035-1045.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  28. Udgivet

    Comparative analysis of 12 different kits for bisulfite conversion of circulating cell-free DNA. / Ørntoft, Mai-Britt Worm; Jensen, Sarah Østrup; Hansen, Thomas Birkballe; Bramsen, Jesper Bertram; Andersen, Claus Lindbjerg.

    I: Epigenetics, Bind 12, Nr. 8, 2017, s. 626-636.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  29. 2016
  30. Udgivet

    Effects of litter provision during early rearing and environmental enrichment during the production phase on feather pecking and feather damage in laying hens. / Tahamtani, F. M.; Brantsæter, M.; Nordgreen, J.; Sandberg, E.; Hansen, T. B.; Nødtvedt, A.; Rodenburg, T. B.; Moe, R. O.; Janczak, A. M.

    I: Poultry Science, Bind 95, Nr. 12, 01.01.2016, s. 2747-2756.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  31. Udgivet

    Argonaute-associated short introns are a novel class of gene regulators. / Hansen, Thomas B; Venø, Morten T; Jensen, Trine I; Schaefer, Anne; Damgaard, Christian K; Kjems, Jørgen.

    I: Nature Communications, Bind 7, 11538, 2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  32. Udgivet

    Circular RNAs : Identification, biogenesis and function. / Ebbesen, Karoline K; Kjems, Jørgen; Hansen, Thomas B.

    I: BBA General Subjects, Bind 1859, Nr. 1, 2016, s. 163-168.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  33. 2015
  34. Udgivet

    Comparison of circular RNA prediction tools. / Hansen, Thomas B; Venø, Morten T; Damgaard, Christian K; Kjems, Jørgen.

    I: Nucleic Acids Research, 10.12.2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  35. Udgivet

    Circular RNAs: Identification, biogenesis and function. / Ebbesen, Karoline; Kjems, Jørgen; Hansen, Thomas Birkballe.

    I: Biochimica et Biophysica Acta, Gene Structure and Expression, 11.07.2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  36. Udgivet

    Spatio-temporal regulation of circular RNA expression during porcine embryonic brain development. / Venø, Morten T; Hansen, Thomas B; Venø, Susanne T; Clausen, Bettina H; Grebing, Manuela; Finsen, Bente; Holm, Ida E; Kjems, Jørgen.

    I: Genome Biology, Bind 16, 16:245, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  37. 2014
  38. Udgivet

    miRdentify : high stringency miRNA predictor identifies several novel animal miRNAs. / Hansen, Thomas B; Venø, Morten T; Kjems, Jørgen; Damgaard, Christian Kroun.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 42, Nr. 16, e124, 22.07.2014, s. 1-11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  39. 2013
  40. Udgivet

    Circular RNA and miR-7 in Cancer. / Hansen, Thomas Birkballe; Kjems, Jørgen; Damgaard, Christian Kroun.

    I: Cancer Research, Bind 73, Nr. 18, 15.09.2013, s. 5609-5612.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  41. Udgivet

    Natural RNA circles function as efficient microRNA sponges. / Hansen, Thomas Birkballe; Jensen, Trine I; Clausen, Bettina Hjelm; Bramsen, Jesper B; Finsen, Bente; Damgaard, Christian K; Kjems, Jørgen.

    I: Nature, Bind 495, 27.02.2013, s. 384-388.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  42. 2012
  43. Udgivet

    The miR-143/-145 cluster regulates plasminogen activator inhibitor-1 in bladder cancer. / Villadsen, S B; Bramsen, Jesper Bertram; Ostenfeld, M S; Wiklund, E D; Fristrup, N; Gao, S; Hansen, Thomas Birkballe; Jensen, T I; Borre, M; Orntoft, T F; Dyrskjøt, Lars ; Kjems, J.

    I: B J C, Bind 106, Nr. 2, 17.01.2012, s. 366-374.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  44. 2011
  45. Udgivet

    miRNA-dependent gene silencing involving Ago2-mediated cleavage of a circular antisense RNA. / Hansen, Thomas Birkballe; Wiklund, Erik D; Bramsen, Jesper Bertram; Villadsen, Sune B; Statham, Aaron L; Clark, Susan J; Kjems, Jørgen.

    I: E M B O Journal, Bind 30, Nr. 21, 30.09.2011, s. 4414-4422.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  46. Udgivet

    Enhancing miRNA annotation confidence in miRBase by continuous cross dataset analysis. / Hansen, Thomas Birkballe; Kjems, Jørgen; Bramsen, Jesper B.

    I: RNA Biology, Bind 8, Nr. 3, 06.2011, s. 378-383.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  47. Udgivet

    Coordinated epigenetic repression of the miR-200 family and miR-205 in invasive bladder cancer. / Wiklund, Erik D; Bramsen, Jesper B; Hulf, Toby; Andersen, Lars Dyrskjøt; Ramanathan, Ramshanker; Hansen, Thomas B; Villadsen, Sune B; Gao, Shan; Ostenfeld, Marie S; Borre, Michael; Peter, Marcus E; Ørntoft, Torben F; Kjems, Jørgen; Clark, Susan J.

    I: International Journal of Cancer, Bind 128, Nr. 6, 15.03.2011, s. 1327-1334.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  48. 2010
  49. Udgivet

    Re-inspection of small RNA sequence datasets reveals several novel human miRNA genes. / Hansen, Thomas Birkballe; Bramsen, Jesper Bertram; Kjems, Jørgen.

    I: P L o S One, Bind 5, Nr. 6, 04.06.2010, s. e10961.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  50. Udgivet

    A screen of chemical modifications identifies position-specific modification by UNA to most potently reduce siRNA off-target effects. / Bramsen, Jesper Bertram; Pakula, Malgorzata M; Hansen, Thomas B; Bus, Claus; Langkjær, Niels; Odadzic, Dalibor; Smicius, Romualdas; Wengel, Suzy L; Chattopadhyaya, Jyoti; Engels, Joachim W; Herdewijn, Piet; Wengel, Jesper; Kjems, Jørgen.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 38, Nr. 17, 2010, s. 5761-5773.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  51. Udgivet

    Non-canonical miRNA-mediated regulation of gene expression. / Hansen, Thomas Birkballe.

    2010.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling

  52. 2009
  53. Udgivet

    A large-scale chemical modification screen identifies design rules to generate siRNAs with high activity, high stability and low toxicity. / Bramsen, Jesper B; Laursen, Maria Bach; Nielsen, Anne F; Hansen, Thomas B; Bus, Claus; Langkjær, Niels; Babu, Bolle Ravindra; Højland, Torben; Abramov, Mikhail; Van Aerschot, Arthur; Odadzic, Dalibor; Smicius, Romualdas; Haas, Jens; Andree, Cordula; Barman, Jharna; Wenska, Malgorzata; Srivastava, Puneet; Zhou, Chuanzheng; Honcharenko, Dmytro; Hess, Simone; Müller, Elke; Bobkov, Georgii V; Mikhailov, Sergey N; Fava, Eugenio; Meyer, Thomas F; Chattopadhyaya, Jyoti; Zerial, Marino; Engels, Joachim W; Herdewijn, Piet; Wengel, Jesper; Kjems, Jørgen.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 37, Nr. 9, 2009, s. 2867-81.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review