Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

Søren Lykke-Andersen

  1. 2018
  2. Udgivet

    Box C/D snoRNP Autoregulation by a cis-Acting snoRNA in the NOP56 Pre-mRNA. / Lykke-Andersen, Søren; Ardal, Britt Kidmose; Hollensen, Anne Kruse; Damgaard, Christian Kroun; Jensen, Torben Heick.

    I: Molecular Cell, Bind 72, Nr. 1, 04.10.2018, s. 99-111.e1-e5.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. Udgivet

    Investigation of RNA Synthesis Using 5-Bromouridine Labelling and Immunoprecipitation. / Kofoed, Rikke H; Betzer, Cristine; Lykke-Andersen, Søren; Molska, Ewa; Jensen, Poul H.

    I: Journal of Visualized Experiments, Nr. 135, 03.05.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  4. Udgivet

    Characterising cis-regulatory variation in the transcriptome of histologically normal and tumour-derived pancreatic tissues. / Zhang, Mingfeng; Lykke-Andersen, Soren; Zhu, Bin; Xiao, Wenming; Hoskins, Jason W; Zhang, Xijun; Rost, Lauren M; Collins, Irene; Bunt, Martijn van de; Jia, Jinping; Parikh, Hemang; Zhang, Tongwu; Song, Lei; Jermusyk, Ashley; Chung, Charles C; Zhu, Bin; Zhou, Weiyin; Matters, Gail L; Kurtz, Robert C; Yeager, Meredith; Jensen, Torben Heick; Brown, Kevin M; Ongen, Halit; Bamlet, William R; Murray, Bradley A; McCarthy, Mark I.; Chanock, Stephen J; Chatterjee, Nilanjan; Wolpin, Brian M; Smith, Jill P; Olson, Sara H; Petersen, Gloria M; Shi, Jianxin; Amundadottir, Laufey.

    I: Gut, Bind 67, Nr. 3, 01.03.2018, s. 521-533.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. 2017
  6. Udgivet

    Polo-like kinase 2 modulates α-synuclein protein levels by regulating its mRNA production. / Kofoed, Rikke H; Zheng, Jin; Ferreira, Nelson; Lykke-Andersen, Søren; Salvi, Mauro; Betzer, Cristine; Reimer, Lasse; Jensen, Torben Heick; Fog, Karina; Jensen, Poul Henning.

    I: Neurobiology of Disease, Bind 106, 17.10.2017, s. 49-62.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  7. 2016
  8. Udgivet

    Structure of the RBM7-ZCCHC8 core of the NEXT complex reveals connections to splicing factors. / Falk, Sebastian; Finogenova, Ksenia; Sørensen, Mireille Melko; Benda, Christian; Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick; Conti, Elena.

    I: Nature Communications, Bind 7, 13573, 01.12.2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  9. Udgivet

    Identification of a Nuclear Exosome Decay Pathway for Processed Transcripts. / Meola, Nicola; Domanski, Michal; Karadoulama, Evdoxia; Chen, Yun; Gentil, Coline; Pultz, Dennis; Vitting-Seerup, Kristoffer; Lykke-Andersen, Søren; Andersen, Jens S; Sandelin, Albin; Jensen, Torben Heick.

    I: Molecular Cell, Bind 64, Nr. 3, 03.11.2016, s. 520-533.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  10. Udgivet

    Relationships between PROMPT and gene expression. / Llinares, Marta Lloret; Mapendano, Christophe Kamungu; Martlev, Lasse Hynkemejer; Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: RNA Biology, Bind 13, Nr. 1, 02.01.2016, s. 6-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. 2015
  12. Udgivet

    Nonsense-mediated mRNA decay : an intricate machinery that shapes transcriptomes. / Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology, Bind 16, 11.2015, s. 665-677.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. 2014
  14. Udgivet

    Human nonsense-mediated RNA decay initiates widely by endonucleolysis and targets snoRNA host genes. / Lykke-Andersen, Søren; Chen, Yun; Ardal, Britt; Lilje, Berit; Waage, Johannes Eichler; Sandelin, Albin Gustav; Jensen, Torben Heick.

    I: Genes & Development, Bind 28, Nr. 22, 15.11.2014, s. 2498-2517.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  15. 2013
  16. Udgivet

    Making ends meet: Coordination between RNA 3'end processing and transcription initiation. / Andersen, Pia Kjølhede; Jensen, Torben Heick; Lykke-Andersen, Søren.

    I: Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA, Bind 4, Nr. 3, 2013, s. 233-246.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  17. 2012
  18. Udgivet

    Promoter proximal polyadenylation sites reduce transcription activity. / Andersen, Pia Kjølhede; Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: Genes & Development, Bind 26, 01.10.2012, s. 2169-2179.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  19. Udgivet

    Stable Cell Lines with Splicing Reporters. / Damgaard, Christian Kroun; Lykke-Andersen, Søren; Kjems, Jørgen.

    Alternative pre-mRNA Splicing: Theory and Protocols. red. / Stefan Stamm; Christopher W. J. Smith; Reinhard Luhrmann. 1. udg. Wiley-VCH, 2012. s. 408-414.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskning

  20. 2011
  21. Udgivet

    The Nuclear EXosome Targeting (NEXT) complex - a new player in RNA surveillance in human cells. / Lubas, Michal Szymon; Christensen, Marianne Skovgaard; Kristiansen, Maiken Søndergaard; Falkenby, Lasse; Domanski, Michal; Lykke-Andersen, Søren; Andersen, Jens; Dziembowski, Andzej; Jensen, Torben Heick.

    2011. Abstract fra RNA 2011, Kyoto, Japan.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  22. Udgivet

    The Putative Non-canonical Human Poly(A) polymerase hTrf4-2 is Found in Nuclear Exosome Preparations and interacts with RNA Splicing and snoRNA processing factors. / Christensen, Marianne Skovgaard; Lubas, Michal Szymon; Kristiansen, Maiken Søndergaard; Falkenby, Lasse; Domanski, Michal; Lykke-Andersen, Søren; Andersen, Jens S.; Dziembowski, Andrzej; Jensen, Torben Heick.

    2011. Abstract fra RNA 2011, Kyoto, Japan.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  23. Udgivet

    Identification of novel RNA degradation pathways in human cells. RNA 2011 meeting, Kyoto, Japan 14-18 June. / Lubas, Michal Szymon; Christensen, Marianne Skovgaard; Falkenby , L; Domanski, Michal; Lykke-Andersen, Søren; Andersen, J; Dziembowski, A; Jensen, Torben Heick.

    2011.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  24. Udgivet

    An ending is a new beginning: Transcription termination supports re-initiation. / Lykke-Andersen, Søren; Mapendano, Christophe K; Jensen, Torben Heick.

    I: Cell Cycle, Bind 10, Nr. 6, 15.03.2011, s. 863-865.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  25. Udgivet

    The eukaryotic RNA exosome: Same scaffold but variable catalytic subunits. / Lykke-Andersen, Søren; Tomecki, Rafal; Jensen, Torben Heick; Dziembowski, Andrzej.

    I: RNA Biology, Bind 8, Nr. 1, 01.01.2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  26. Udgivet

    Interaction Profiling Identifies the Human Nuclear Exosome Targeting Complex. / Lubas, Michal Szymon; Christensen, Marianne Skovgaard; Kristiansen, Maiken Søndergaard; Domanski, Michal; Falkenby, Lasse G.; Lykke-Andersen, Søren; Andersen, Jens S.; Dziembowski, Andrzej; Jensen, Torben Heick.

    I: Molecular Cell, 2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  27. 2010
  28. Udgivet

    Crosstalk between mRNA 3’ end processing and transcription initiation. / Mapendano, Christophe Kamungu; Lykke-Andersen, Søren; Kjems, Jørgen; Bertrand, Edouard; Jensen, Torben Heick.

    I: Molecular Cell, Bind 40, 2010, s. 410-422.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  29. Udgivet

    The human core exosome associates with differentially localized processive ribonucleases: hDIS3 and hDIS3L. / Tomecki, Rafal; Kristiansen, Maiken Søndergaard; Lykke-Andersen, Søren; Chlebowski, Aleksander; Larsen, Katja Malene; Szczesny, Roman J; Drazkowska, Karolina; Pastula, Agnieszka; Andersen, Jens S.; Stepien, Piotr P; Dziembowski, Andrzej; Jensen, Torben Heick.

    I: E M B O Journal, Bind 29, Nr. 14, 2010, s. 2342-2357.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  30. 2009
  31. Udgivet

    SMG6 promotes endonucleolytic cleavage of nonsense mRNA in human cells. / Eberle, Andrea; Lykke-Andersen, Søren; Mühlemann, Oliver; Jensen, Torben Heick.

    I: Nature Structural and Molecular Biology, Bind 16, Nr. 1, 16.01.2009, s. 49-55.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Assembly of an export-competent mRNP is needed for efficient release of the 3' end processing complex after polyadenylation. / Qu, X; Lykke-Andersen, Søren; Nasser, Tommy; Saguez, Cyril; Bertrand, Edouard; Jensen, Torben Heick; Moore, Claire.

    I: Molecular and Cellular Biology, Bind 29, Nr. 19, 2009.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    Origins and activities of the eukaryotic exosome. / Lykke-Andersen, Søren; Brodersen, Ditlev Egeskov; Jensen, Torben Heick.

    I: Journal of Cell Science, Bind 122, Nr. 10, 2009, s. 1487-94.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskning

  34. 2008
  35. Udgivet

    RNA Exosome Depletion Reveals Transcription Upstream of Active Human Promoters. / Preker, Pascal; Nielsen, Jesper; Kammler, Susanne; Lykke-Andersen, Søren; Christensen, Marianne S; Mapendano, Christophe K; Schierup, Mikkel Heide; Jensen, Torben Heick.

    I: Science, Bind 322, Nr. 5909, 19.12.2008, s. 1851-1854.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  36. Udgivet

    A 5' splice site enhances the recruitment of basal transcription initiation factors in vivo. / Damgaard, Christian Kroun; Kahns, Søren; Lykke-Andersen, Søren; Nielsen, Anders Lade; Jensen, Torben Heick; Kjems, Jørgen.

    I: Molecular Cell, Bind 29, Nr. 2, 02.2008, s. 271-278.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  37. Udgivet

    The RNA exosome componenty hRrp6 is a target for 5-fluorouracil in human cells. / Kammler, Susanne; Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: Molecular Cancer Research, Bind 6, Nr. 6, 2008, s. 990-995.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  38. 2007
  39. Udgivet

    Alternative splicing of the ADAR1 transcript in a region that functions either as a 5'-UTR or an ORF. / Lykke-Andersen, Søren; Piñol-Roma, Serafín; Kjems, Jørgen.

    I: RNA, Bind 13, Nr. 10, 2007, s. 1732-1744.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  40. Udgivet

    Overlapping pathways dictate termination of RNA polymerase II transcription : RNA polymerase II termination. / Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: Biochimie, Bind 89, Nr. 10, 2007, s. 1177-1182.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  41. Udgivet

    Regulatory mechanisms for 3'-end alternative splicing and polyadenylation of the Glial Fibrillary Acidic Protein, GFAP, transcript. / Blechingberg, Jenny; Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick; Jørgensen, Arne Lund; Nielsen, Anders Lade.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 35, Nr. 22, 2007, s. 7636-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  42. Udgivet

    The human ADAR1 transcripts contain an alternative retained intron within a region that functions both as a 5'UTR and an ORF. / Lykke-Andersen, Søren; Piñol-Roma, S.; Kjems, Jørgen.

    I: RNA, Bind 89, Nr. 10, 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  43. 2006
  44. Udgivet

    Cut it out - silencing of noise in the transcriptome. / Lykke-Andersen, Søren; Jensen, Torben Heick.

    I: Nature Structural and Molecular Biology, Bind 13, Nr. 10, 2006, s. 860-861.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskning

  45. 2005
  46. Udgivet

    Regulation of ADAR1 expression. / Lykke-Andersen, Søren.

    University of Aarhus, 2005. 100 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  47. 2003
  48. Udgivet

    Ratjadones inhibit nuclear export by blocking CRM1/exportin 1. / Köster, Mario; Lykke-Andersen, Søren; Elnakady, Yasser A; Gerth, Klaus; Washausen, Peter; Höfle, Gerhard; Sasse, Florenz; Kjems, Jørgen; Hauser, Hansjörg.

    I: Experimental Cell Research, Bind 286, Nr. 2, 2003, s. 321-331.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review