Mikkel Heide Schierup

2024

A region of suppressed recombination misleads neoavian phylogenomics

Mirarab, S., Rivas-González, I., Feng, S., Stiller, J., Fang, Q., Mai, U., Hickey, G., Chen, G., Brajuka, N., Fedrigo, O., Formenti, G., Wolf, J. B. W., Howe, K., Antunes, A., Schierup, M. H., Paten, B., Jarvis, E. D., Zhang, G. & Braun, E. L., apr. 2024, I: Proceedings of the National Academy of Sciences. 121, 15, 10 s., e2319506121.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Biographical sketch: Freddy Bugge Christiansen

Loeschcke, V. & Schierup, M. H., apr. 2024, I: Theoretical Population Biology. 156, s. 130 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A.-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G. & Gao, R. & 32 flere, Zhou, C., Xie, Y., Huang, Z., Cao, Z., Yan, Z., Ogilvie, H. A., Nakhleh, L., Lindow, B., Morel, B., Fjeldså, J., Hosner, P. A., da Fonseca, R. R., Petersen, B., Tobias, J. A., Székely, T., Kennedy, J. D., Reeve, A. H., Liker, A., Stervander, M., Antunes, A., Tietze, D. T., Bertelsen, M., Lei, F., Rahbek, C., Graves, G. R., Schierup, M. H., Warnow, T., Braun, E. L., Gilbert, M. T. P., Jarvis, E. D., Mirarab, S. & Zhang, G., 23 maj 2024, I: Nature. 629, 8013, s. 851-860 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Harnessing cold adaptation for postglacial colonisation: Galactinol synthase expression and raffinose accumulation in a polyploid and its progenitors

Fechete, L. I., Larking, A. C., Heslop, A., Hannaford, R., Anderson, C. B., Hong, W., Prakash, S., Mace, W., Alikhani, S., Hofmann, R. W., Tausen, M., Schierup, M. H., Andersen, S. U. & Griffiths, A. G., 14 jun. 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant, Cell & Environment.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A. & Bergman, J. & 72 flere, Rouselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., Zhang, G., Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Karakikes, I., Wang, K. C., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Siepel, A., Kundaje, A., Paten, B., Lindblad-Toh, K., Rogers, J., Marques Bonet, T. & Farh, K. K. H., 25 jan. 2024, I: Nature. 625, 7996, s. 735-742 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Trails: Tree reconstruction of ancestry using incomplete lineage sorting

Rivas-González, I., Schierup, M. H., Wakeley, J. & Hobolth, A., feb. 2024, I: PLOS Genetics. 20, 2, 21 s., e1010836.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2023

A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species

Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A. & Chuma, I. S. & 55 flere, Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., Zhang, G., Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Rogers, J., Farh, K. K. H. & Bonet, T. M., jun. 2023, I: Science. 380, 6648, s. 906-913 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Characterizing the evolution and phenotypic impact of ampliconic Y chromosome regions

Lucotte, E. A., Guðmundsdóttir, V. B., Jensen, J. M., Skov, L., Macià, M. C., Almstrup, K., Schierup, M. H., Helgason, A. & Stefansson, K., jul. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3990.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Comparative genomics reveals the hybrid origin of a macaque group

Zhang, B. L., Chen, W., Wang, Z., Pang, W., Luo, M. T., Wang, S., Shao, Y., He, W. Q., Deng, Y., Zhou, L., Chen, J., Yang, M. M., Wu, Y., Wang, L., Fernández-Bellon, H., Molloy, S., Meunier, H., Wanert, F., Kuderna, L. & Marques-Bonet, T. & 10 flere, Roos, C., Qi, X. G., Li, M., Liu, Z., Schierup, M. H., Cooper, D. N., Liu, J., Zheng, Y. T., Zhang, G. & Wu, D. D., jun. 2023, I: Science Advances. 9, 22, eadd3580.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

De Novo Mutation Rates in Sticklebacks

Zhang, C., Reid, K., Sands, A. F., Fraimout, A., Schierup, M. H. & Merilä, J., sep. 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, msad192.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Eighty million years of rapid evolution of the primate Y chromosome

Zhou, Y., Zhan, X., Jin, J., Zhou, L., Bergman, J., Li, X., Rousselle, M. M. C., Belles, M. R., Zhao, L., Fang, M., Chen, J., Fang, Q., Kuderna, L., Marques-Bonet, T., Kitayama, H., Hayakawa, T., Yao, Y. G., Yang, H., Cooper, D. N. & Qi, X. & 3 flere, Wu, D. D., Schierup, M. H. & Zhang, G., jul. 2023, I: Nature Ecology & Evolution. 7, 7, s. 1114-1130 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Evolution of the germline mutation rate across vertebrates

Bergeron, L. A., Besenbacher, S., Zheng, J., Li, P., Bertelsen, M. F., Quintard, B., Hoffman, J. I., Li, Z., St. Leger, J., Shao, C., Stiller, J., Gilbert, M. T. P., Schierup, M. H. & Zhang, G., 9 mar. 2023, I: Nature. 615, 7951, s. 285-291 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Extraordinary selection on the human X chromosome associated with archaic admixture

Skov, L., Coll Macià, M., Lucotte, E. A., Cavassim, M. I. A., Castellano, D., Schierup, M. H. & Munch, K., mar. 2023, I: Cell Genomics. 3, 3, 16 s., 100274.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Genome-wide coancestry reveals details of ancient and recent male-driven reticulation in baboons

Sørensen, E. F., Harris, R. A., Zhang, L., Raveendran, M., Kuderna, L. F. K., Walker, J. A., Storer, J. M., Kuhlwilm, M., Fontsere, C., Seshadri, L., Bergey, C. M., Burrell, A. S., Bergman, J., Phillips-Conroy, J. E., Shiferaw, F., Chiou, K. L., Chuma, I. S., Keyyu, J. D., Fischer, J. & Gingras, M. C. & 12 flere, Salvi, S., Doddapaneni, H., Schierup, M. H., Batzer, M. A., Jolly, C. J., Knauf, S., Zinner, D., Farh, K. K. H., Marques-Bonet, T., Munch, K., Roos, C. & Rogers, J., jun. 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, eabn8153.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates

Rivas-González, I., Rousselle, M., Li, F., Zhou, L., Dutheil, J. Y., Munch, K., Shao, Y., Wu, D., Schierup, M. H. & Zhang, G., jun. 2023, I: Science. 380, 6648, s. eabn4409 10 s., eabn4409.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Phylogenomic analyses provide insights into primate evolution

Shao, Y., Zhou, L., Li, F., Zhao, L., Zhang, B. L., Shao, F., Chen, J. W., Chen, C. Y., Bi, X., Zhuang, X. L., Zhu, H. L., Hu, J., Sun, Z., Li, X., Wang, D., Rivas-González, I., Wang, S., Wang, Y. M., Chen, W. & Li, G. & 23 flere, Lu, H. M., Liu, Y., Kuderna, L. F. K., Farh, K. K. H., Fan, P. F., Yu, L., Li, M., Liu, Z. J., Tiley, G. P., Yoder, A. D., Roos, C., Hayakawa, T., Marques-Bonet, T., Rogers, J., Stenson, P. D., Cooper, D. N., Schierup, M. H., Yao, Y. G., Zhang, Y. P., Wang, W., Qi, X. G., Zhang, G. & Wu, D. D., jun. 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 913-924 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

1 Citationer (Scopus)

Single-cell analysis identifies genes facilitating rhizobium infection in Lotus japonicus

Frank, M., Fechete, L. I., Tedeschi, F., Nadzieja, M., Nørgaard, M. M. M., Montiel, J., Andersen, K. R., Schierup, M. H., Reid, D. & Andersen, S. U., dec. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 7171.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

The landscape of tolerated genetic variation in humans and primates

Gao, H., Hamp, T., Ede, J., Schraiber, J. G., McRae, J., Singer-Berk, M., Yang, Y., Dietrich, A. S. D., Fiziev, P. P., Kuderna, L. F. K., Sundaram, L., Wu, Y., Adhikari, A., Field, Y., Chen, C., Batzoglou, S., Aguet, F., Lemire, G., Reimers, R. & Balick, D. & 77 flere, Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., do Amaral, J. V., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., Zhang, G., Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Bataillon, T., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Lek, M., Sunyaev, S., O'Donnell-Luria, A., Rehm, H. L., Xu, J., Rogers, J., Marques-Bonet, T. & Farh, K. K. H., jun. 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, abn8197.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The molecular evolution of spermatogenesis across mammals

Murat, F., Mbengue, N., Winge, S. B., Trefzer, T., Leushkin, E., Sepp, M., Cardoso-Moreira, M., Schmidt, J., Schneider, C., Mößinger, K., Brüning, T., Lamanna, F., Riera Belles, M., Conrad, C., Kondova, I., Bontrop, R., Behr, R., Khaitovich, P., Pääbo, S. & Marques-Bonet, T. & 4 flere, Grützner, F., Almstrup, K., Schierup, M. H. & Kaessmann, H., jan. 2023, I: Nature. 613, 7943, s. 308-316 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Worldwide Late Pleistocene and Early Holocene population declines in extant megafauna are associated with Homo sapiens expansion rather than climate change

Bergman, J., Pedersen, R., Lundgren, E. J., Lemoine, R. T., Monsarrat, S., Pearce, E. A., Schierup, M. H. & Svenning, J. C., 24 nov. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 7679.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2022

Evolutionary dynamics of pseudoautosomal region 1 in humans and great apes

Bergman, J. & Schierup, M. H., okt. 2022, I: Genome Biology. 23, 215.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Incomplete lineage sorting and phenotypic evolution in marsupials

Feng, S., Bai, M., Rivas-González, I., Li, C., Liu, S., Tong, Y., Yang, H., Chen, G., Xie, D., Sears, K. E., Franco, L. M., Gaitan-Espitia, J. D., Nespolo, R. F., Johnson, W. E., Yang, H., Brandies, P. A., Hogg, C. J., Belov, K., Renfree, M. B. & Helgen, K. M. & 3 flere, Boomsma, J. J., Schierup, M. H. & Zhang, G., maj 2022, I: Cell. 185, 10, s. 1646-1660.e18 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

PRDM9 losses in vertebrates are coupled to those of paralogs ZCWPW1 and ZCWPW2

Cavassim, M. I. A., Baker, Z., Hoge, C., Schierup, M. H., Schumer, M. & Przeworski, M., feb. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences. 119, 9, e2114401119.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

24 Downloads (Pure)

The mutationathon highlights the importance of reaching standardization in estimates of pedigree-based germline mutation rates

Bergeron, L. A., Besenbacher, S., Turner, T. N., Versoza, C. J., Wang, R. J., Price, A. L., Armstrong, E., Riera, M., Carlson, J., Chen, H. Y., Hahn, M. W., Harris, K., Kleppe, A. S., López-Nandam, E. H., Moorjani, P., Pfeifer, S. P., Tiley, G. P., Yoder, A. D., Zhang, G. & Schierup, M. H., jan. 2022, I: eLife. 11, e73577.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2021

Different historical generation intervals in human populations inferred from Neanderthal fragment lengths and mutation signatures

Coll Macià, M., Skov, L., Peter, B. M. & Schierup, M. H., dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 5317.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Different historical generation intervals in human populations inferred from Neanderthal fragment lengths and patterns of mutation accumulation

Coll Macià, M., Skov, L., Peter, B. M. & Schierup, M. H., feb. 2021, bioRxiv.

Publikation: Working paper/Preprint › Preprint

Åben adgang

Evaluating genetic causes of azoospermia: What can we learn from a complex cellular structure and single-cell transcriptomics of the human testis?

Soraggi, S., Riera Belles, M., Rajpert-De Meyts, E., Schierup, M. H. & Almstrup, K., jan. 2021, I: Human Genetics. 140, 1, s. 183-201 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review

Evolutionary and biomedical insights from a marmoset diploid genome assembly

Yang, C., Zhou, Y., Marcus, S., Formenti, G., Bergeron, L. A., Song, Z., Bi, X., Bergman, J., Rousselle, M. M. C., Zhou, C., Zhou, L., Deng, Y., Fang, M., Xie, D., Zhu, Y., Tan, S., Mountcastle, J., Haase, B., Balacco, J. & Wood, J. & 13 flere, Chow, W., Rhie, A., Pippel, M., Fabiszak, M. M., Koren, S., Fedrigo, O., Freiwald, W. A., Howe, K., Yang, H., Phillippy, A. M., Schierup, M. H., Jarvis, E. D. & Zhang, G., jun. 2021, I: Nature. 594, 7862, s. 227-233 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

75 Downloads (Pure)

Recombination facilitates adaptive evolution in rhizobial soil bacteria

Cavassim, M. I. A., Andersen, S. U., Bataillon, T. & Schierup, M. H., dec. 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 12, s. 5480-5490 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Small RNAs in Seminal Plasma as Novel Biomarkers for Germ Cell Tumors

Mørup, N., Stakaitis, R., Golubickaite, I., Riera, M., Dalgaard, M. D., Schierup, M. H., Jørgensen, N., Daugaard, G., Juul, A. & Almstrup, K., maj 2021, I: Cancers. 13, 10, 2346.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

1 Citationer (Scopus)

Studying mutation rate evolution in primates-a need for systematic comparison of computational pipelines

Bergeron, L. A., Besenbacher, S., Schierup, M. H. & Zhang, G., okt. 2021, I: GigaScience. 10, 10, giab072.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review

Åben adgang

1 Citationer (Scopus)

The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating

Bergeron, L. A., Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Pacheco, G., Sinding, M. H. S., Kamilari, M., Gilbert, M. T. P., Schierup, M. H. & Zhang, G., maj 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2 Citationer (Scopus)

2020

Extreme genetic signatures of local adaptation during Lotus japonicus colonization of Japan

Shah, N., Wakabayashi, T., Kawamura, Y., Skovbjerg, C. K., Wang, M.-Z., Mustamin, Y., Isomura, Y., Gupta, V., Jin, H., Mun, T., Sandal, N., Azuma, F., Fukai, E., Seren, Ü., Kusakabe, S., Kikuchi, Y., Nitanda, S., Kumaki, T., Hashiguchi, M. & Tanaka, H. & 10 flere, Hayashi, A., Sønderkær, M., Nielsen, K. L., Schneeberger, K., Vilhjalmsson, B., Akashi, R., Stougaard, J., Sato, S., Schierup, M. H. & Andersen, S. U., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 15 s., 253.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Integration and reanalysis of transcriptomics and methylomics data derived from blood and testis tissue of men with 47,XXY Klinefelter syndrome indicates the primary involvement of Sertoli cells in the testicular pathogenesis

Winge, S. B., Soraggi, S., Schierup, M. H., Rajpert-De Meyts, E. & Almstrup, K., jun. 2020, I: American Journal of Medical Genetics. Part C: Seminars in Medical Genetics. 184, 2, s. 239-255 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review

Symbiosis genes show a unique pattern of introgression and selection within a Rhizobium leguminosarum species complex

Cavassim, M. I. A., Moeskjær, S., Moslemi, C., Fields, B., Bachmann, A., Vilhjálmsson, B. J., Schierup, M. H., W Young, J. P. & Andersen, S. U., apr. 2020, I: Microbial Genomics. 6, 4, 000351.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The last pieces of a puzzling early meeting

Schierup, M. H., sep. 2020, I: Science (New York, N.Y.). 369, 6511, s. 1565-1566

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The nature of Neanderthal introgression revealed by 27,566 Icelandic genomes

Skov, L., Coll Macià, M., Sveinbjörnsson, G., Mafessoni, F., Lucotte, E. A., Einarsdóttir, M. S., Jonsson, H., Halldorsson, B., Gudbjartsson, D. F., Helgason, A., Schierup, M. H. & Stefansson, K., jun. 2020, I: Nature. 582, 7810, s. 78-83 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2019

Alu insertion polymorphisms shared by Papio baboons and Theropithecus gelada reveal an intertwined common ancestry

Walker, J. A., Jordan, V. E., Storer, J. M., Steely, C. J., Gonzalez-Quiroga, P., Beckstrom, T. O., Rewerts, L. C., St. Romain, C. P., Rockwell, C. E., Rogers, J., Jolly, C. J., Konkel, M. K., The Baboon Genome Analysis Consortium & Batzer, M. A., 26 nov. 2019, I: Mobile DNA. 10, 1, 13 s., 46.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

1 Citationer (Scopus)

60 Downloads (Pure)

Association mapping and disease: Evolutionary perspectives

Besenbacher, S., Mailund, T., Vilhjálmsson, B. J. & Schierup, M. H., 2019, Evolutionary genomics: Statistical and computational methods. Anisimova, M. (red.). 2 udg. Springer, s. 533-553 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1910).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

Åben adgang

Breaking Free: The Genomics of Allopolyploidy-Facilitated Niche Expansion in White Clover

Griffiths, A. G., Moraga, R., Tausen, M., Gupta, V., Bilton, T. P., Campbell, M. A., Ashby, R., Nagy, I., Khan, A., Larking, A., Anderson, C., Franzmayr, B., Hancock, K., Scott, A., Ellison, N. W., Cox, M. P., Asp, T., Mailund, T., Schierup, M. H. & Andersen, S. U., jul. 2019, I: The Plant Cell. 31, 7, s. 1466-1487 22 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Direct estimation of mutations in great apes reconciles phylogenetic dating

Besenbacher, S., Hvilsom, C., Marques-Bonet, T., Mailund, T. & Schierup, M. H., feb. 2019, I: Nature Ecology & Evolution. 3, 2, s. 286-292 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Evidence for Faster X Chromosome Evolution in Spiders

Bechsgaard, J., Schou, M. F., Vanthournout, B., Hendrickx, F., Knudsen, B., Settepani, V., Schierup, M. H. & Bilde, T., 1 jun. 2019, I: Molecular Biology and Evolution. 36, 6, s. 1281-1293 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

111 Downloads (Pure)

Selective single molecule sequencing and assembly of a human Y chromosome of African origin

Kuderna, L. F. K., Lizano, E., Julia, E., Gomez-Garrido, J., Serres-Armero, A., Kuhlwilm, M., Alandes, R. A., Alvarez-Estape, M., Juan, D., Simon, H., Alioto, T., Gut, M., Gut, I., Schierup, M. H., Fornas, O. & Marques-Bonet, T., 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 8 s., 4.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

257 Downloads (Pure)

The comparative genomics and complex population history of Papio baboons

Rogers, J., Raveendran, M., Alan Harris, R., Mailund, T., Leppälä, K., Athanasiadis, G., Schierup, M. H., Cheng, J., Munch, K., Walker, J. A., Konkel, M. K., Jordan, V., Steely, C. J., Beckstrom, T. O., Bergey, C., Burrell, A., Schrempf, D., Noll, A., Kothe, M. & Kopp, G. H. & 23 flere, Liu, Y., Murali, S., Billis, K., Martin, F. J., Muffato, M., Cox, L., Else, J., Disotell, T., Muzny, D. M., Phillips-Conroy, J., Aken, B., Eichler, E. E., Marques-Bonet, T., Kosiol, C., Batzer, M. A., Hahn, M. W., Tung, J., Zinner, D., Roos, C., Jolly, C. J., Gibbs, R. A., Worley, K. C. & Baboon Genome Analysis Consortium, 30 jan. 2019, I: Science Advances. 5, 1, 14 s., 6947.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

2018

A computational reconstruction of Papio phylogeny using Alu insertion polymorphisms

Jordan, V. E., Walker, J. A., Beckstrom, T. O., Steely, C. J., McDaniel, C. L., St Romain, C. P., The Baboon Genome Analysis Consortium, Worley, K. C., Phillips-Conroy, J., Jolly, C. J., Rogers, J., Konkel, M. K. & Batzer, M. A., 5 apr. 2018, I: Mobile DNA. 9, 1, 11 s., 13.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

1 Citationer (Scopus)

Analysis of lineage-specific Alu subfamilies in the genome of the olive baboon, Papio anubis

The Baboon Genome Analysis Consortium, 19 mar. 2018, I: Mobile DNA. 9, 1, 10.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2 Citationer (Scopus)

Detecting archaic introgression using an unadmixed outgroup

Skov, L., Hui, R., Shchur, V., Hobolth, A., Scally, A., Schierup, M. H. & Durbin, R., 1 sep. 2018, I: PLOS Genetics. 14, 9, e1007641.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

147 Downloads (Pure)

Dynamic Copy Number Evolution of X- and Y-Linked Ampliconic Genes in Human Populations

Lucotte, E. A., Skov, L., Jensen, J. M., Coll Macià, M., Munch, K. & Schierup, M. H., 2018, I: Genetics. 209, 3, s. 907-920 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

137 Downloads (Pure)

Transcriptome analysis of the adult human Klinefelter testis and cellularity-matched controls reveals disturbed differentiation of Sertoli- and Leydig cells article

Winge, S. B., Dalgaard, M. D., Belling, K. G., Jensen, J. M., Nielsen, J. E., Aksglaede, L., Schierup, M. H., Brunak, S., Skakkebæk, N. E., Juul, A., Rajpert-De Meyts, E. & Almstrup, K., 1 jun. 2018, I: Cell Death and Disease. 9, 6, 586.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

159 Downloads (Pure)

Transcriptome profiling of fetal Klinefelter testis tissue reveals a possible involvement of long non-coding RNAs in gonocyte maturation

Winge, S. B., Dalgaard, M. D., Jensen, J. M., Graem, N., Schierup, M. H., Juul, A., Rajpert-De Meyts, E. & Almstrup, K., 2018, I: Human Molecular Genetics. 27, 3, s. 430-439 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Mikkel Heide Schierup

Publikation

Søgeresultater