Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

Kasper Urup Kjeldsen

  1. 2019
  2. E-pub ahead of print

    On the evolution and physiology of cable bacteria. / Kjeldsen, Kasper U; Schreiber, Lars; Thorup, Casper A; Boesen, Thomas; Bjerg, Jesper T; Yang, Tingting; Dueholm, Morten S; Larsen, Steffen; Risgaard-Petersen, Nils; Nierychlo, Marta; Schmid, Markus; Bøggild, Andreas; van de Vossenberg, Jack; Geelhoed, Jeanine S; Meysman, Filip J R; Wagner, Michael; Nielsen, Per H; Nielsen, Lars Peter; Schramm, Andreas.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 19.08.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. Udgivet

    The Polyextremophilic Bacterium Clostridium paradoxum Attains Piezophilic Traits by Modulating Its Energy Metabolism and Cell Membrane Composition. / Scoma, Alberto; Garrido-Amador, Paloma; Nielsen, Søren Dollerup; Røy, Hans; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Applied and Environmental Microbiology, Bind 85, Nr. 15, 01.08.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  4. E-pub ahead of print

    Environmental filtering determines family-level structure of sulfate-reducing microbial communities in subsurface marine sediments. / Marshall, Ian P.G.; Ren, Ge; Jaussi, Marion; Lomstein, Bente Aa; Jørgensen, Bo Barker; Røy, Hans; Kjeldsen, Kasper U.

    I: ISME Journal, 03.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. Accepteret/In press

    Single-cell amplified genomes of two uncultivated members of the deltaproteobacterial SEEP-SRB1 clade, isolated from marine sediment. / Petro, Caitlin; Jochum, Lara M.; Schreiber, Lars; Marshall, Ian P.G.; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Marine Genomics, 01.01.2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  6. Udgivet

    In situ biodegradation, photooxidation and dissolution of petroleum compounds in Arctic seawater and sea ice. / Vergeynst, Leendert; Christensen, Jan H.; Kjeldsen, Kasper Urup; Meire, Lorenz; Boone, Wieter; Malmquist, Linus M.V.; Rysgaard, Søren.

    I: Water Research, Bind 148, 2019, s. 459-468.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  7. 2018
  8. Udgivet

    Single-cell genomics reveals a diverse metabolic potential of uncultivated Desulfatiglans-related Deltaproteobacteria widely distributed in marine sediment. / Jochum, Lara; Schreiber, Lars; Marshall, Ian; Jørgensen, Bo Barker; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 9, 2038, 03.09.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  9. Udgivet

    Bacterial interactions during sequential degradation of cyanobacterial necromass in a sulfidic arctic marine sediment. / Mueller, Albert L.; Pelikan, Claus; de Rezende, Julia R.; Wasmund, Kenneth; Putz, Martina; Glombitza, Clemens; Kjeldsen, Kasper U.; Jorgensen, Bo Barker; Loy, Alexander.

    I: Environmental Microbiology, Bind 20, Nr. 8, 08.2018, s. 2927-2940.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  10. E-pub ahead of print

    Contrasting community composition of endospores and vegetative Firmicutes in a marine sediment suggests both endogenous and exogenous sources of endospore accumulation. / Cupit, Carina; Lomstein, Bente Aagaard; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Environmental Microbiology Reports, 24.07.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. Udgivet

    Sulfate Transporters in Dissimilatory Sulfate Reducing Microorganisms : A Comparative Genomics Analysis. / Marietou, Angeliki; Roy, Hans; Jorgensen, Bo B.; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 9, 309, 02.03.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskningpeer review

  12. Udgivet

    Bacterial community succession and degradation patterns of hydrocarbons in seawater at low temperature. / Vergeynst, Leendert; Kjeldsen, Kasper U; Lassen, Pia; Rysgaard, Søren.

    I: Journal of Hazardous Materials, Bind 353, 2018, s. 127-134.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. 2017
  14. Udgivet

    Depth Distribution and Assembly of Sulfate-Reducing Microbial Communities in Marine Sediments of Aarhus Bay. / Jochum, Lara M.; Chen, Xihan; Lever, Mark A.; Loy, Alexander; Jorgensen, Bo Barker; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Applied and Environmental Microbiology, Bind 83, Nr. 23, e01547-17, 12.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  15. Udgivet

    Microbial turnover times in the deep seabed studied by amino acid racemization modelling. / Braun, Stefan; Mhatre, Snehit S; Jaussi, Marion; Røy, Hans; Kjeldsen, Kasper U; Pearce, Christof; Seidenkrantz, Marit-Solveig; Jørgensen, Bo Barker; Lomstein, Bente Aa.

    I: Scientific Reports, Bind 7, Nr. 1, 5680, 18.07.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  16. Udgivet

    Concurrent Methane Production and Oxidation in Surface Sediment from Aarhus Bay, Denmark. / Xiao, Ke-Qing; Beulig, Felix; Kjeldsen, Kasper U.; Jørgensen, Bo B.; Risgaard-Petersen, Nils.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 8, 1198, 30.06.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  17. Udgivet

    The marine sulfate reducer Desulfobacterium autotrophicum HRM2 can switch between low and high apparent half-saturation constants for dissimilatory sulfate reduction. / Tarpgaard, Irene Harder; Jorgensen, Bo Barker; Kjeldsen, Kasper Urup; Roy, Hans.

    I: F E M S Microbiology Reviews, Bind 93, Nr. 4, 012, 04.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  18. Udgivet

    Microbial community assembly and evolution in subseafloor sediment. / Starnawski, Piotr; Bataillon, Thomas; Ettema, Thijs J G; Jochum, Lara M.; Schreiber, Lars; Chen, Xihan; Lever, Mark A.; Polz, Martin F.; Jørgensen, Bo B.; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 114, Nr. 11, 14.03.2017, s. 2940-2945.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  19. Udgivet

    Quantification of anaerobic thermophilic endospores in marine sediment by microcalorimetry, and its use in bioprospecting for gas and oil. / Nielsen, Søren Dollerup; Volpi, Marta; Löbmann, Korbinian; Kjeldsen, Kasper Urup; Røy, Hans.

    I: Limnology and Oceanography: Methods, Bind 5, Nr. 3, 02.03.2017, s. 519-530.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  20. Udgivet

    Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity. / Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Caceres, Eva F; Saw, Jimmy H; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr; Kjeldsen, Kasper U; Stott, Matthew B; Nunoura, Takuro; Banfield, Jillian F; Schramm, Andreas; Baker, Brett J; Spang, Anja; Ettema, Thijs J G.

    I: Nature, Bind 541, Nr. 7637, 19.01.2017, s. 353-358.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  21. Udgivet

    Assembly, succession and activity of marine microbial hydrocarbon-degrading communities at low temperatures. / Vergeynst, Leendert; Lassen, Pia; Dalsgaard, Tage; Kjeldsen, Kasper Urup; Rysgaard, Søren.

    2017. Abstract fra Gulf of Mexico Oil Spill & Ecosystem Science Conference, New Orleans, USA.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  22. Udgivet

    Estimating the abundance of endospores of sulfate-reducing bacteria in environmental samples by inducing germination and exponential growth. / Rezende, Julia Rosa de; Hubert, Casey RJ; Røy, Hans; Kjeldsen, Kasper Urup; Jørgensen, Bo Barker.

    I: Geomicrobiology Journal, Bind 34, Nr. 4, 2017, s. 338-345.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  23. Udgivet

    Identity, abundance and reactivation kinetics of thermophilic fermentative endospores in cold marine sediment and seawater. / Volpi, Marta; Lomstein, Bente Aagaard; Sichert , Andreas ; Røy, Hans; Jørgensen, Bo Barker; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 8, 131, 2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  24. Udgivet

    In situ bacterial hydrocarbon degradation in Arctic seawater and sea ice. / Vergeynst, Leendert; Christensen, Jan; Boone, Wieter; Dalsgaard, Tage; Kjeldsen, Kasper Urup; Malmquist, Linus; Meire, Lorenz; Rysgaard, Søren.

    2017.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  25. Udgivet

    In situ investigation of hydrocarbon degradation in Arctic seawater and sea ice. / Vergeynst, Leendert; Christensen, Jan H. ; Boone, Wieter; Dalsgaard, Tage; Kjeldsen, Kasper Urup; Malmquist, Linus; Meire, Lorenz; Rysgaard, Søren.

    2017. Abstract fra Arctic Change 2017 - ArcticNet Annual Scientific Meetings, Quebec, Canada.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  26. Udgivet

    Microbial community assembly in marine sediments. / Petro, Caitlin; Starnawski, Piotr; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Aquatic Microbial Ecology, Bind 79, Nr. 3, 2017, s. 177-195.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskningpeer review

  27. Udgivet

    The novel bacterial phylum Calditrichaeota is diverse, widespread and abundant in marine sediments and has the capacity to degrade detrital proteins. / Marshall, Ian P G; Starnawski, Piotr; Cupit, Carina; Cáceres, Eva Fernández; Ettema, Thijs J G; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper U.

    I: Environmental Microbiology Reports, Bind 9, Nr. 4, 2017, s. 397-403.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  28. 2016
  29. Udgivet

    Evidence of active methanogenesis in surface sediment from Aarhus Bay, Denmark. / Xiao, Ke-Qing; Beulig, Felix; Kjeldsen, Kasper Urup; Røy, Hans; Jørgensen, Bo Barker; Risgaard-Petersen, Nils.

    2016. Poster session præsenteret ved 16th International Symposium on Microbial Ecology, Montreal, Canada.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningpeer review

  30. Udgivet

    Endozoicomonas are specific, facultative symbionts of sea squirts. / Schreiber, Lars; Kjeldsen, Kasper Urup; Funch, Peter; Jensen, Jeppe; Obst, Matthias; López-Legentil, Susanna; Schramm, Andreas.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 7, 12.07.2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet

    A taxonomic framework for cable bacteria and proposal of the candidate genera Electrothrix and Electronema. / Trojan, Daniela; Schreiber, Lars; Bjerg, Jesper Tataru; Bøggild, Andreas; Yang, Tingting; Kjeldsen, Kasper Urup; Schramm, Andreas.

    I: Systematic and Applied Microbiology, Bind 39, Nr. 5, 07.2016, s. 297-306.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Description of Endozoicomonas ascidiicola sp. nov., isolated from Scandinavian ascidians. / Schreiber, Lars; Kjeldsen, Kasper Urup; Obst, Matthias; Funch, Peter; Schramm, Andreas.

    I: Systematic and Applied Microbiology, Bind 39, Nr. 5, 07.2016, s. 313-318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    Cellular content of biomolecules in sub-seafloor microbial communities. / Braun, Stefan; Morono, Yuki; Becker, Kevin W.; Hinrichs, Kai-Uwe; Kjeldsen, Kasper Urup; Jørgensen, Bo Barker; Lomstein, Bente Aagaard.

    I: Geochimica et Cosmochimica Acta, Bind 188, 17.06.2016, s. 330-351.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  34. Udgivet

    A novel extracellular gut symbiont in the marine worm Priapulus caudatus (Priapulida) reveals an alphaproteobacterial symbiont clade of the Ecdysozoa. / Kroer, Paul; Kjeldsen, Kasper Urup; Nyengaard, Jens Randel; Schramm, Andreas; Funch, Peter.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 7, 539, 26.04.2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  35. Udgivet

    Identity, abundance and reactivation kinetics of thermophilic fermentative endospores in marine sediment and seawater. / Volpi, Marta; Lomstein, Bente Aagaard; Sichert, A; Røy, Hans; Jørgensen, Bo Barker; Kjeldsen, Kasper Urup.

    2016. Poster session præsenteret ved ISME 16 - 16th International Symposium on Microbial Ecology, Montreal, Canada.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningpeer review

  36. Udgivet

    Microbes degrading hydrocarbons at low temperatures: Untangling microbial community assembly and succession. / Vergeynst, Leendert; Lassen, Pia; Dalsgaard, Tage; Kjeldsen, Kasper Urup; Rysgaard, Søren.

    2016. Abstract fra ArcticNet Annual Scientific Meeting, 5-9 December, Winnipeg, MB, Canada., Winnipeg, Canada.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  37. 2015
  38. Udgivet

    Ubiquitous presence and novel diversity of anaerobic alkane degraders in cold marine sediments. / Gittel, Antje; Donhauser, Johanna; Røy, Hans; Girguis, Peter R.; Jørgensen, Bo Barker; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 6, 1414, 12.2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  39. Udgivet

    A new α-proteobacterium in the penis worm reveals clade of gut symbionts of the Ecdysozoa. / Kroer, Paul; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper Urup; Funch, Peter.

    2015. Abstract fra IV International Workshop on Scalidophora, Ferrol, Galicia, Spanien.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  40. Udgivet

    What is the lower limit for cellular metabolic rates? / Jaussi, Marion; Kjeldsen, Kasper Urup; Seidenkrantz, Marit-Solveig; Lomstein, Bente Aagaard; Jørgensen, Bo Barker; Røy, Hans.

    2015. Poster session præsenteret ved MICROENERGY 2015, Sandbjerg, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  41. Udgivet

    Uncultured Desulfobacteraceae and Crenarchaeotal group C3 incorporate (13) C-acetate in coastal marine sediment. / Na, Hyunsoo; Lever, Mark Alexander; Kjeldsen, Kasper Urup; Schulz, Frederik; Jørgensen, Bo Barker.

    I: Environmental Microbiology Reports, Bind 7, Nr. 4, 08.2015, s. 614-22.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  42. Udgivet

    Wide-spread distribution of 1-methylalkylsuccinate synthase (masD) gene phylotypes in hydrocarbon seepage-impacted and pristine marine sediments. / Gittel, Antje; Donhauser, Johanna; Kjeldsen, Kasper Urup; Røy, Hans; Girguis, Peter R.; Jørgensen, Bo Barker.

    2015. Poster session præsenteret ved Gordon Research Seminar & Conference, South Hadely, USA.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningpeer review

  43. Udgivet

    Anaerobic oxidation of short­-chain hydrocarbons in marine sediments: Microbial targets in oil and gas exploration. / Gittel, Antje; Donhauser, Johanna; Kjeldsen, Kasper Urup; Røy, Hans; Jørgensen, Bo Barker.

    2015. Poster session præsenteret ved International Symposium on Applied Microbiology and Molecular Biology in Oil Systems(ISMOS-5), Stavanger, Norge.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningpeer review

  44. Udgivet

    Sulfate reduction rates and the size of the sulfate-reducer community are tightly linked in the subsurface of an arctic fjord (Greenland). / Jaussi, Marion; Kjeldsen, Kasper Urup; Seidenkrantz, Marit-Solveig; Lomstein, Bente Aagaard; Jørgensen, Bo Barker; Røy, Hans.

    2015. Abstract fra EMBO Workshop on Microbial Sulfur Metabolism, Helsingør, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  45. Udgivet

    Sulfate-­reducing alkane degraders in cold marine surficial sediments: Microbial targets in oil and gas exploration. / Gittel, Antje; Donhauser, Johanna; Kjeldsen, Kasper Urup; Røy, Hans; Jørgensen, Bo Barker.

    2015. Poster session præsenteret ved EMBO Workshop on Microbial Sulfur Metabolism, Helsingør, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningpeer review

  46. Udgivet

    Methanogenic archaea and sulfate reducing bacteria co-cultured on acetate : teamwork or coexistence? / Ozuolmez, Derya; Na, Hyunsoo; Lever, Mark A; Kjeldsen, Kasper U; Jørgensen, Bo B; Plugge, Caroline M.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 6, 492, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  47. Udgivet

    Phylogenetic and environmental diversity of DsrAB-type dissimilatory (bi)sulfite reductases. / Müller, Albert Leopold; Kjeldsen, Kasper Urup; Rattai, Thomas; Pester, Michael; Loy, Alexander.

    I: I S M E Journal, Bind 9, 2015, s. 1152-1165.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  48. 2014
  49. Udgivet

    A tunicate-specific Endozoicomonas-lineage, and comparative genomicsand physiology of the symbiotic Endozoicomonas clade. / Schreiber, Lars; Kjeldsen, Kasper Urup; Tegetmeyer, Halina; Funch, Peter; López-Legentil, Susanna; Dubilier, Nicole; Schramm, Andreas.

    2014. Poster session præsenteret ved 15th International Symposium on Microbial Ecology, Seoul, Sydkorea.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  50. Udgivet

    The cable genome: first insights into the metabolic potential of electron-conducting filamentous Desulfobulbaceae from single filament genome sequencing. / Schreiber, Lars; Kjeldsen, Kasper Urup; Bjerg, Jesper Jensen; Bøggild, Andreas; van de Vossenberg, Jack; Nielsen, Lars Peter; Schramm, Andreas.

    2014. Abstract fra 15th International Symposium on Microbial Ecology, Seoul, Sydkorea.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  51. Udgivet

    Succession of cable bacteria and electric currents in marine sediment. / Schauer, Regina; Risgaard-Petersen, Nils; Kjeldsen, Kasper Urup; Bjerg, Jesper Jensen; Jørgensen, Bo Barker; Schramm, Andreas; Nielsen, Lars Peter.

    I: I S M E Journal, Bind 8, 23.01.2014, s. 1314-1322.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  52. Udgivet

    Endospores of thermophilic bacteria as tracers of microbial dispersal by ocean currents. / Müller, Albert Leopold; de Rezende, Júlia Rosa; Hubert, Casey R J; Kjeldsen, Kasper Urup; Lagkouvardos, Ilias; Berry, David; Jørgensen, Bo Barker; Loy, Alexander.

    I: I S M E Journal, Bind 8, 2014, s. 1153–1165.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  53. Udgivet

    Survival of prokaryotes in a polluted Waste dump during remediation by alkaline hydrolysis. / Nielsen, Marie Bank; Kjeldsen, Kasper Urup; Lever, Mark; Ingvorsen, Kjeld.

    I: Ecotoxicology, Bind 23, 2014, s. 404-418.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  54. Udgivet

    The earthworm-Verminephrobacter symbiosis : an emerging experimental system to study extracellular symbiosis. / Lund, Marie Braad; Kjeldsen, Kasper U; Schramm, Andreas.

    I: Frontiers in Microbiology, Bind 5, 128, 2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskningpeer review

  55. 2013
  56. Udgivet

    How do natural, uncultivated microbes interact with organic matter? Insights from single cell genomics and metagenomics. / Lloyd, Karen; Bird, Jordan; Schreiber, Lars; Petersen, Dorthe Groth; Kjeldsen, Kasper Urup; Schramm, Andreas; Stepanauskas, Ramunas; Jørgensen, Bo Barker.

    2013. Abstract fra 2013 AGU Fall Meeting, San Francisco, USA.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  57. Udgivet

    Predominant archaea in marine sediments degrade detrital proteins. / Lloyd, Karen; Schreiber, L.; Petersen, Dorthe Groth; Kjeldsen, K.U.; Lever, M.A.; Steen, A.D.; Stepanauskas, R.; Richter, M.; Kleindienst, S.; Lenk, S.; Schramm, Andreas; Jorgensen, B.B.

    I: Nature, Bind 496, Nr. 7444, 11.04.2013, s. 215-218.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  58. Udgivet

    Complete genome sequence of Desulfocapsa sulfexigens, a marine deltaproteobacterium specialized in disproportionating inorganic sulfur compounds. / Finster, Kai; Kjeldsen, Kasper Urup; Kube, MichaeL; Reinhardt, Richard; Mussmann, Marc; Amann, Rudolf; Schreiber, Lars.

    I: Standards in Genomic Sciences, Bind 8, 2013, s. 58-68.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  59. Udgivet

    Dispersal of thermophilic Desulfotomaculum endospores into Baltic Sea sediments over thousands of years. / Rezende, Julia Rosa de; Kjeldsen, Kasper Urup; Hubert, Casey RJ; Finster, Kai; Loy, Alexander; Jørgensen, Bo Barker.

    I: I S M E Journal, Bind 7, 2013, s. 72-84.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  60. 2012
  61. Udgivet

    Filamentous bacteria transport electrons over centimetre distances. / Pfeffer, Christian; Larsen, Steffen; Song, Jie; Dong, Mingdong; Besenbacher, Flemming; Meyer, Rikke Louise; Kjeldsen, Kasper Urup; Schreiber, Lars; Gorby, Yuri A.; El-Naggar, Mohamed Y.; Leung, Kar Man; Schramm, Andreas; Risgaard-Petersen, Nils; Nielsen, Lars Peter.

    I: Nature, Bind 491, 08.11.2012, s. 218-221.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  62. Udgivet

    High affinity sulfate reduction kinetics in marine sediment. / Tarpgaard, Irene Harder; Røy, Hans; Kjeldsen, Kasper Urup; Finster, Kai; Jørgensen, Bo Barker.

    2012. Abstract fra ISME Conference 2012, København, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  63. Udgivet

    Verminephrobacter aporrectodeae sp. nov. subsp. tuberculatae and subsp. caliginosae; the specific nephridial symbionts of the earthworms Aporrectodea tuberculata and A. caliginosa. / Lund, Marie Braad; Schätzle, Sarah; Schramm, Andreas; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology, Bind 101, Nr. 3, 03.2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  64. Udgivet

    A single cell approach for revealing the phylogenetic identity of unknown sulfate-reducing microbes in a marine sediment. / Petersen, Dorthe Groth; Lloyd, Karen; Schreiber, Lars; Kjeldsen, Kasper Urup; Jørgensen, Bo Barker; Schramm, Andreas.

    2012. Abstract fra 14th International Symposium on Microbial Ecology, Copenhagen, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  65. Udgivet

    Pinning down a metabolism for widespread, abundant, uncultured archaea through single cell genomic analysis. / Lloyd, Karen; Schreiber, Lars; Petersen, Dorthe Groth; Richter, Michael; Kjeldsen, Kasper Urup; Lever, Mark; Kleindienst, Sara; Schramm, Andreas; Jørgensen, Bo Barker.

    2012. Abstract fra 14th International Symposium on Microbial Ecology, Copenhagen, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  66. Udgivet

    Probing the genomic content of low-energy specialists. / Lloyd, Karen; Schreiber, Lars; Petersen, Dorthe Groth; Richter, Michael; Kjeldsen, Kasper Urup; Lever, Mark; Lenk, Sabine; Kleindienst, Sara; Schramm, Andreas; Jørgensen, Bo Barker.

    2012. Abstract fra MICROENERGY 2012 2nd International Workshop on Microbial Life under Extreme Energy Limitation, Aarhus , Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  67. Udgivet

    Purifying selection and molecular adaptation in the genome of Verminephrobacter, the heritable symbiotic bacteria of earthworms. / Kjeldsen, Kasper U; Bataillon, Thomas; Pinel, Nicolás; De Mita, Stéphane; Lund, Marie B; Panitz, Frank; Bendixen, Christian; Stahl, David A; Schramm, Andreas.

    I: Genome Biology and Evolution, Bind 4, Nr. 3, 2012, s. 307-315.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  68. Udgivet

    Reconstructing genomes of uncultured microorganisms from marine sediments using single cell genomics - an Aarhus Bay, Denmark, case study. / Schreiber, Lars; Lloyd, Karen; Petersen, Dorthe Groth; Richter, Michael; Kjeldsen, Kasper Urup; Lever, Mark; Lenk, Sabine; Kleindienst, Sara ; Jørgensen, Bo Barker; Schramm, Andreas.

    2012. Abstract fra 14th International Symposium on Microbial Ecology, Copenhagen, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  69. Udgivet

    Single cell genomics of uncultured subsurface archaea. / Lloyd, Karen; Schreiber, Lars; Petersen, Dorthe Groth; Richter, Michael; Kjeldsen, Kasper Urup; Lever, Mark; Kleindienst, Sara ; Schramm, Andreas; Jørgensen, Bo Barker.

    2012. Abstract fra Goldschmidt, Montreal, Canada.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  70. 2011
  71. Udgivet

    Microbial populations in a district heating system - an anaerobic, low salinity, nutrient-poor and alkaline environment. / Ingvorsen, Kjeld; Kjeldsen, Kasper Urup; Abildgaard, Lone; Nielsen, Marie Bank.

    2011.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

  72. Udgivet

    Description of Citricoccus nitrophenolicus sp. nov., a para-nitrophenol degrading actinobacterium isolated from a wastewater treatment plant and emended description of the genus Citricoccus Altenburger et al. 2002. / Nielsen, Marie Bank; Kjeldsen, Kasper Urup; Ingvorsen, Kjeld.

    I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology, 2011, s. 489-499.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  73. 2010
  74. Udgivet

    Desulfosalsimonas propionicica gen. nov. sp. nov., a halophilic, sulfate-reducing member of the family Desulfobacteraceae isolated from a salt-lake sediment. / Kjeldsen, Kasper Urup; Jakobsen, T. F.; Glastrup, J.; Ingvorsen, Kjeld.

    I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Bind 60, 2010, s. 1060-1065.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  75. Udgivet

    Desulfovibrio oceani subsp. oceani sp. nov., subsp. nov and Desulfovibrio oceani subsp. galateae subsp. nov., novel sulfate-reducing bacteria isolated from the oxygen minimum zone off the coast of Peru. / Finster, Kai; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology, 2010.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  76. Udgivet

    Marinimicrobium haloxylanilyticum sp. nov., a new moderately halophilic, polysaccharide-degrading bacterium isolated from Great Salt Lake, Utah. / Fogh Møller, Mette; Kjeldsen, Kasper Urup; Ingvorsen, Kjeld.

    I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology, Bind 98, Nr. 4, 2010, s. 553-565.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  77. Udgivet

    Abundance and similarity of endospores of thermophilic sulfate-reducing bacteria in cold marine sediments of Aarhus Bay (56N) and Svalbard (79N). / Rezende, Julia Rosa de; Hubert, Casey; Kjeldsen, Kasper Urup; Loy, Alexander; Müller, Albert; Wagner, Michael; Jørgensen, Bo Barker.

    2010. Abstract fra 13th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-13), Seattle, USA.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  78. Udgivet

    Diversity and host specificity of the Verminephrobacter–earthworm symbiosis. / Lund, Marie Braad; Davidson, Seana; Holmstrup, Martin; James, Sam; Kjeldsen, Kasper Urup; Stahl, David; Schramm, Andreas.

    I: Environmental Microbiology, Bind 12, 2010, s. 2142–2151.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  79. Udgivet

    Tracking heat-lovers in the cold: towards a global phylogeography of thermophilic spore-forming bacteria in marine sediments. / Müller, Albert; Rezende, Julia Rosa de; Hubert, Casey; Kjeldsen, Kasper Urup; Wagner, Michael; Jørgensen, Bo Barker; Loy, Alexander.

    2010. Poster session præsenteret ved 13th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-13), Seattle, USA.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  80. Udgivet

    Two types of endosymbiotic bacteria in the enigmatic marine worm Xenoturbella. / Kjeldsen, Kasper Urup; Obst, Matthias; Nakano, Hiroaki; Funch, Peter; Schramm, Andreas.

    I: Applied and Environmental Microbiology, Bind 76, Nr. 8, 2010, s. 2657-2662.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  81. 2009
  82. Udgivet

    Demequina lutea sp. nov., isolated from a high Arctic permafrost soil. / Finster, Kai; Herbert, Rodney Andrew; Kjeldsen, Kasper Urup; Schumann, Peter; Lomstein, Bente Aagaard.

    I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Bind 59, 2009, s. 649-653.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  83. Udgivet

    Biocorrosion and biofilm formation in a nutrient limited heating system subjected to alternating microaerophilic conditions. / Kjellerup, B. V.; Kjeldsen, Kasper Urup; Lopes, F.; Abildgaard, Lone; Ingvorsen, Kjeld; Froelund, B.; Sowers, K. R.; Nielsen, P. H.

    I: Biofouling, Bind 25, Nr. 8, 2009, s. 727-737.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  84. Udgivet

    Description of Tessaracoccus profundi sp.nov., a deep-subsurface actinobacterium isolated from a Chesapeake impact crater drill core (940 m depth). / Finster, Kai; Cockell, C.S.; Voytek, M.A.; Gronstal, A.L.; Kjeldsen, Kasper Urup.

    I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology, Bind 96, 2009, s. 515-526.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  85. Udgivet

    Enumeration and identification of dominant types of sulfate-reducing bacteria in pulp from a paper-recycling plant: a multiphasic approach. / Kjeldsen, Kasper Urup; Tang, Lone; Jørgensen, Maria Giltoft; Ingvorsen, Kjeld.

    I: F E M S Microbiology Ecology, Bind 69, Nr. 3, 2009, s. 481-493.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  86. Udgivet

    Evolution and function of the earthworm-Verminephrobacter symbiosis. / Schramm, Andreas; Lund, Marie Braad; Kjeldsen, Kasper Urup.

    2009. Abstract fra FEMS2009 - 3rd Congress of European Microbiologists, Gothenburg, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceRådgivning

  87. Udgivet

    Regnormens tro følgesvend. / Lund, Marie Braad; Kjeldsen, Kasper Urup; Holmstrup, Martin; Schramm, Andreas.

    I: Aktuel Naturvidenskab, Nr. 4, 2009, s. 24-28.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelFormidling

  88. 2008
  89. Udgivet

    Comparative Genomics of Symbiotic Bacteria in Earthworm Nephridia. / Kjeldsen, Kasper Urup; Pinel, Nicolas; Lund, Marie Braad; Davidson, Seana; Stolyar, Sergei; Walcott, Ron; Parales, Rebecca; Richardson, P.; Stahl, David; Schramm, Andreas.

    2008. Abstract fra International Symposium on Microbial Ecology (ISME-12), Cairns, Australien.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  90. 2007
  91. Udgivet

    Diversity of sulfate-reducing bacteria from an extreme hypersaline sediment, Great Salt Lake (Utah). / Kjeldsen, Kasper Urup; Loy, Alexander; Jakobsen, Trine Fredlund; Thomsen, Trine Rolighed; Wagner, Michael; Ingvorsen, Kjeld.

    I: F E M S Microbiology Ecology, Bind 60, 2007, s. 287–298.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  92. Udgivet

    Improved 16S rRNA-targeted probe set for analysis of sulfate-reducing bacteria by fluorescence in situ hybridization. / Lucker, Sebastian; Steger, Doris; Kjeldsen, Kasper Urup; MacGregor, Barbara; Wagner, Michael; Loy, Alexander.

    I: Journal of Microbiological Methods, Bind 69, 2007, s. 523–528.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  93. Udgivet

    Phylogenetic and functional diversity of bacteria in biofilms from metal surfaces of an alkaline district heating system. / Kjeldsen, Kasper Urup; Kjellerup, Birthe Venø; Egli, Konrad; Frølund, Bo; Nielsen, Per Halkjær; Ingvorsen, Kjeld.

    I: F E M S Microbiology Ecology, Bind 61, 2007, s. 384–397.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  94. 2006
  95. Udgivet

    Desulfitibacter alkalitolerans gen. nov., sp. nov., an anaerobic, alkalitolerant, sulfite-reducing bacterium isolated from a district heating plant. / Nielsen, Marie Bank; Kjeldsen, Kasper Urup; Ingvorsen, Kjeld.

    I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Bind 56, 2006, s. 2831-2836.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  96. Udgivet

    Desulfohalobium utahense sp. nov., a moderately halophilic, sulfate-reducing bacterium isolated from Great Salt Lake. / Jakobsen, Trine F.; Kjeldsen, Kasper Urup; Ingvorsen, Kjeld.

    I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Bind 56, 2006, s. 2063-2069.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  97. Udgivet

    Desulfovibrio alkalitolerans sp. nov., a novel alkalitolerant, sulphate-reducing bacterium isolated from district heating water. / Abildgaard, Lone; Nielsen, Marie Bank; Kjeldsen, Kasper Urup; Ingvorsen, Kjeld.

    I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Bind 56, 2006, s. 1019-1024.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  98. Udgivet

    Culture-dependent and culture-independent diversity of halophilic sulfate-reducing prokaryotes from an extreme hypersaline sediment in Great Salt Lake (Utah, USA). / Kjeldsen, Kasper Urup; Loy, A.; R. Thomsen, T.; F. Jakobsen, T.; Wagner, M.; Ingvorsen, Kjeld.

    11th International Symposium on Microbial Ecology - ISME-11. The Hidden Powers - Microbial Communities in Action. Vienna, Austria, August 20-25, 2006. Book of Abstracts. www.kenes.com/isme. - p. A371.. 2006.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferenceabstrakt i proceedingsForskning

  99. 2005
  100. Udgivet

    Desulfovibrio aerotolerans sp. nov., an oxygen tolerant sulphate-reducing bacterium isolated from activated sludge. / Mogensen, G.L.; Kjeldsen, K.U.; Ingvorsen, Kjeld.

    I: Anaerobe, Bind 11, 2005, s. 339-349.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  101. Udgivet

    Effects of oxygen exposure on respiratory activities of Desulfovibrio desulfuricans strain DvO1 isolated from activated sludge. / Kjeldsen, K.U.; Joulian, C.; Ingvorsen, Kjeld.

    I: F E M S Microbiology Ecology, Bind 53, 2005, s. 275-284.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  102. 2004
  103. Udgivet

    Oxygen tolerance of sulfate-reducing bacteria in activated sludge. / Kjeldsen, K.U.; Joulian, C.; Ingvorsen, Kjeld.

    I: Environ. Sci. Technol., Bind 38, 2004, s. 2038-2043.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  104. Udgivet

    Sulfate-reducing prokaryotes in extreme environments. / Kjeldsen, K.U.

    2004.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning