Publikationer pr. år
Publikationer pr. år
Publikation
- 40 resultater
Søgeresultater
-
2024
Evaluating different software and methodologies for tracing breed origin of alleles in crossbred dairy cattle
Liu, H., Ole, F. C., Byskov, K., Eiríksson, J. H., Milkevych, V., Thomasen, J. R. & Karaman, E., 22 jul. 2024.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
Fil -
Genomic prediction of methane emission using microbiome data and genomic markers in Holstein cows
Saedi, N., Ye, X., Cai, Z., Lund, M. S. & Karaman, E., 2024, (Under udarbejdelse) Genomic prediction of methane emission using microbiome data and genomic markers in Holstein cows.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning
-
Incorporating prior biological information into genomic predictions: An example from mastitis in Danish Jersey and Nordic Red cattle
Karaman, E., Cai, Z., Chegini, A., Lidauer, M., Moreira, G. C. M., Chitneedi, P. K., consortium, T. B. & Janss, L., 2024, s. 30-31. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
-
Marker weighting improves single-step genomic prediction reliabilities of udder health traits in Nordic Red and Jersey dairy cattle populations
Chegini, A., Strandén, I., Karaman, E., Iso-Touru, T., Pösö, J., Aamand, G. P. & Lidauer, M. H., 4 okt. 2024, (E-pub ahead of print) I: Journal of Dairy Science.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang -
Within and across population genomic predictions incorporating functional genomic annotations
Bonifazi, R., Heidaritabar, M., Barlow, L., Bouwman, A. C., Plastow, G., Stothard, P., Chen, L., Basarab, J., Li, C., Karaman, E., Moreira, G. & Gredler-Grandl, B., 2024, s. 73-74. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
-
2023
A breed-of-origin of alleles model that includes crossbred data improves predictive ability for crossbred animals in a multi-breed population
Guillenea, A., Lund, M. S., Evans, R., Boerner, V. & Karaman, E., dec. 2023, I: Genetics, selection, evolution : GSE. 55, 1, 34.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang1 Citationer (Scopus) -
Bayesian gene regulatory network inference using mixture priors
Karaman, E., 2023.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
-
Biologically informed genomic predictions with the NextGP.jl statistical analysis package
Karaman, E., Milkevych, V. & Janss, L., 2023, Book of Abstracts of the 74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. Wageningen Academic Publishers, (EAAP Book of Abstracts).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
-
Genomic evaluation of crossbred dairy cows considering breed origin of alleles
Guillenea, A., Christensen, O. F., Thomasen, J. R., Liu, H. & Karaman, E., 2023.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
-
Multibreed genomic prediction using summary statistics and a breed-origin-of-alleles approach
Clasen, J. B., Fikse, W. F., Su, G. & Karaman, E., jul. 2023, I: Heredity. 131, 1, s. 33-42 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang -
Study of fertility traits in Italian Jersey Cattle
Persichilli, C., Karaman, E., Finocchiaro, R., Pilla, F., Fabris, A., Visentin, G. & Cassandro, M., 2023, I: Italian Journal of Animal Science. 22, sup1, s. 41 1 s., 0563.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review
Åben adgang -
Using genomic markers and microbiome data to predict methane emissions from Holstein cows
Saedi, N., Lund, M. S. & Karaman, E., 2023, Book of Abstracts of the 74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science. Wageningen Academic PublishersPublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
-
2022
Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde x Holstein x Red Danish)
Saintilan, R., Croiseau, P., Baur, A., Croue, I., Ducrocq, V., Thomasen, J. R., Karaman, E., Boichard, D., Leclerc, H. & Cuyabano, B. C. D., okt. 2022, Proceedings of the 2022 Interbull Meeting. s. 18-22 5 s. (Interbull Bulletin, Bind 57).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
-
Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde x Holstein x Red Danish)
Croiseau, P., Saintilan, R., Baur, A., Croue, I., Ducrocq, V., Thomasen, J. R., Karaman, E., Boichard, D., Leclerc, H. & Cuyabano, B. C. D., maj 2022, WCGALP 2022 Programme book. Wageningen Academic Publishers, 4 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
Breed-origin-of-alleles approach using summary statistics for multi-breed genomic prediction in dairy cattle
Clasen, J. B., Fikse, W. F., Su, G. & Karaman, E., 2022, WCGALP 2022: Programme book. Wageningen Academic PublishersPublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
-
Genomic prediction in multi-breed Irish beef cattle population using a breed origin of alleles model
Guillenea, A., Lund, M. S., Evans, R. D., Börner, V. & Karaman, E., jul. 2022, WCGALP 2022 Programme book. Wageningen Academic Publishers, 4 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
Genomic prediction in Nordic Red dairy cattle considering breed origin of alleles
Guillenea, A., Su, G., Lund, M. S. & Karaman, E., mar. 2022, I: Journal of Dairy Science. 105, 3, s. 2426-2438 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil8 Citationer (Scopus)53 Downloads (Pure) -
Genomic prediction using breed origin of alleles model accounting for probabilities in the assignment of the alleles
Guillenea, A., Su, G., Lund, M. S. & Karaman, E., jul. 2022, WCGALP 2022 Programme book. Wageningen Academic Publishers, 4 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
Genomic prediction with incomplete omics data
Karaman, E., Milkevych, V., Cai, Z., Janss, L., Sahana, G. & Lund, M. S., jul. 2022, WCGALP 2022 Programme book. Wageningen Academic PublishersPublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
NextGP: A Julia package for next generation genomic prediction tools
Karaman, E., nov. 2022, Danish Data Science 2022 - Abstract books. s. 11 A9Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
Åben adgang -
Quantitative trait simulation using MeSCoT software
Milkevych, V., Karaman, E., Sahana, G., Janss, L., Cai, Z. & Lund, M. S., jul. 2022, WCGALP 2022 Programme book. Wageningen Academic Publishers, 4 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
XSim Version 2: Simulation of Modern Breeding Programs
Chen, C. J., Garrick, D., Fernando, R., Karaman, E., Stricker, C., Keehan, M. & Cheng, H., apr. 2022, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 12, 4, 9 s., jkac032.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang8 Citationer (Scopus) -
2021
Breed of origin of alleles and genomic predictions for crossbred dairy cows
Eiríksson, J. H., Karaman, E., Su, G. & Christensen, O. F., dec. 2021, I: Genetics Selection Evolution. 53, 1, 13 s., 84.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil8 Citationer (Scopus)61 Downloads (Pure) -
Genomic prediction using a reference population of multiple pure breeds and admixed individuals
Karaman, E., Su, G., Croue, I. & Lund, M. S., maj 2021, I: Genetics Selection Evolution. 53, 1, 15 s., 46.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil29 Citationer (Scopus)82 Downloads (Pure) -
MeSCoT: The tool for quantitative trait simulation through the mechanistic modeling of genes' regulatory interactions
Milkevych, V., Karaman, E., Sahana, G., Janss, L., Cai, Z. & Lund, M. S., jul. 2021, I: G3 (Bethesda, Md.). 11, 7, 15 s., jkab133.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang1 Citationer (Scopus) -
2020
Correction: Multi-trait single-step genomic prediction accounting for heterogeneous (co)variances over the genome
Karaman, E., Lund, M. S. & Su, G., apr. 2020, I: Heredity. 124, 4, s. 618 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
Åben adgang1 Citationer (Scopus) -
Genomic prediction for crossbred cows by combining marker effects estimated in purebreds
Eiriksson, J. H., Karaman, E., Su, G. & Christensen, O. F., 2020.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
-
Genomic prediction using a multi-breed reference data of purebred and admixed populations
Karaman, E., Su, G., Croue, I. & Lund, M. S., nov. 2020.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
Fil82 Downloads (Pure) -
Genomic prediction using data from multiple pure breeds and crossbreds
Karaman, E., Su, G., Croue, I. & Lund, M. S., dec. 2020.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
-
Genomic prediction using purebred and crossbred individuals
Karaman, E., Su, G., Croue, I. & Lund, M. S., dec. 2020, I: GenTORE Newsletter. 4, s. 13-16 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Improvement of genomic prediction by integrating additional single nucleotide polymorphisms selected from imputed whole genome sequencing data
Liu, A., Lund, M. S., Boichard, D. A., Karaman, E., Fritz, S., Aamand, G. P., Nielsen, U. S., Wang, Y. & Su, G., 1 jan. 2020, I: Heredity. 124, 1, s. 37-49 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil37 Citationer (Scopus)80 Downloads (Pure) -
Imputation for sequencing variants preselected to a customized low-density chip
Liu, A., Lund, M. S., Boichard, D., Mao, X., Karaman, E., Fritz, S., Aamand, G. P., Wang, Y. & Su, G., dec. 2020, I: Scientific Reports. 10, 9 s., 9524.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang2 Citationer (Scopus) -
Multi-trait single-step genomic prediction accounting for heterogeneous (co)variances over the genome
Karaman, E., Lund, M. S. & Su, G., 1 feb. 2020, I: Heredity. 124, 2, s. 274-287 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil18 Citationer (Scopus)37 Downloads (Pure) -
Weighted single-step genomic best linear unbiased prediction integrating variants selected from sequencing data by association and bioinformatics analyses
Liu, A., Lund, M. S., Boichard, D., Karaman, E., Guldbrandtsen, B., Fritz, S., Aamand, G. P., Nielsen, U. S., Sahana, G., Wang, Y. & Su, G., 2020, I: Genetics Selection Evolution. 52, 1, 17 s., 48.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang13 Citationer (Scopus) -
2019
Pooled genotyping strategies for the rapid construction of genomic reference populations
Alexandre, P., Porto-Neto, L., Karaman, E., Lehnert, S. & Reverter, A., dec. 2019, I: Journal of Animal Science. 97, 12, s. 4761– 4769 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang13 Citationer (Scopus) -
2018
A two-step approach to account for heterogeneous (co)variances across the genome using GBLUP
Karaman, E., Lund, M. S., Anche, M. T., Janss, L. & Su, G., 13 feb. 2018.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
-
Genomic prediction using multi-trait model with heterogeneous genomic (co)variance
Anche, M. T., Su, G., Karaman, E., Janss, L. & Lund, M. S., 2018, Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock, 2018 . Bind Volume Methods and Tools - Models and Computing Strategies 2. s. 1-6 6 s. 284Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
Genomic Prediction Using Multi-trait Weighted GBLUP Accounting for Heterogeneous Variances and Covariances Across the Genome
Karaman, E., Lund, M. S., Anche, M. T., Janss, L. & Su, G., 1 nov. 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 11, s. 3549-3558 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil29 Citationer (Scopus)197 Downloads (Pure) -
Using additional single nucleotide polymorphisms selected from whole genome sequence data for genomic prediction in Danish Jersey
Liu, A., Lund, M. S., Boichard, D., Fritz, S., Karaman, E., Wang, Y. & Su, G., 2018, Proceedings of the World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2018. 6 s. 586Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review
Åben adgang -
2017
Weighted Multi-Trait GBLUP: Using (co)variance estimates from Bayesian models
Karaman, E., Lund, M. S., Anche, M. T., Janss, L. & Su, G., 2017.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning