Kontakt
Ditlev Egeskov Brodersen
Professor
Institut for Molekylærbiologi og Genetik - Proteinvidenskab
Gustav Wieds Vej 10C
bygning 3130, 205
8000 Aarhus C
Danmark
Fastnet: +4521669001
Mobil: +4521669001
Mikrobielle overlevelsesmekanismer
Vi er interesserede i at forstå de fundamentale, molekylære mekanismer, der ligger til grund for centrale overlevelsesmekanismer i både bakterier og archaea med det formål at forstå hvordan mikroorganismer responderer på næringsmangel, antibiotika og andre ændringer i deres miljø. Et kendskab til disse mekanismer kan udnyttes til udvikling af nye antimikrobielle lægemidler. Til det formål anvender vi bioinformatisk analyse af bakterielle (meta-) genomer, klassisk biokemi kombineret med hybrid-strukturbiologi (røntgenkrystallografi, elektronmikroskopi og røntgen småvinkelspredning) samt mikrobiologiske studier af fysiologi og vækst.
Aktuelle projekter:
- Mekanismen for aktivering og aktivitet af bakterielle RNase-type (VapBC, RelBE, HicAB) og kinase-type (HipBA) toksin-antitoksinsystemer.
- Opnå en forståelse hvordan phosphonat kan udnyttes som kilde til phosphat via carbon-phosphorus lyase-pathway'en i E. coli.
- Opnå en forståelse af samspillet mellem toxin-antitoxin-systemer og CRISPR-Cas immunitet i bakterier og archaea.
- Regulering af (p)ppGpp-syntese og effekterne af denne alarmone i bakterier under stress.
Læs mere om forskningen i gruppen.
Undervisning
- Forelæser og kursusansvarlig på grundkurset "Biomolekylær Struktur og Funktion" (10 ECTS, 2017-)
- Ansvarlig for ph.d.-kursus i strukturel biologi (Parma Universitet, Italien, 2017-2019)
- Forelæser og underviser på overbygningskurset "Strukturbiologi" (10 ECTS, 2011-2017)
- Udvikling af moderne, forskningsbaserede undervisningsmetoder.
- Udvikling af educational IT, bl.a. grundlægger af undervisningsplatformen curriculearn.dk
- Brug af moderne teknologi i undervisningen.
Forskningsområder
- Natur og teknologi > Biologi > Mikrobielle processer og stofkredsløb
- Natur og teknologi > Biologi > Bakterier
- It, datalogi og matematik > Softwaresystemer > Robotter Automatiseret krystallisationsscreening
- It, datalogi og matematik > Bioinformatik > Strukturel analyse Visualisering og sammenligning af proteinstrukturer
- Natur og teknologi > Molekylærbiologi og bioteknologi > 3D-strukturer af store molekyler
- Natur og teknologi > Kemi > Enzymer og kunstige enzymer
- Natur og teknologi > Kemi > RNA
- Natur og teknologi > Kemi > Røntgenkrystallografi
- Natur og teknologi > Fysik: Anvendelse og teknik > Nanovidenskab og nanoteknologi
- Pædagogik, læring og filosofi > Læring, didaktik og uddannelse > Elektroniske undervisningsmidler
- Pædagogik, læring og filosofi > Læring, didaktik og uddannelse > Undervisningsmål og -metoder
- Udgivet
Structural basis for inhibition of an archaeal CRISPR-Cas type I-D large subunit by an anti-CRISPR protein
Manav, M. C., Van, L. B., Lin, J., Fuglsang, A., Peng, X. & Brodersen, D. E., nov. 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 10 s., 5993.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
- Udgivet
Structural Basis for Toxin Inhibition in the VapXD Toxin-Antitoxin System
Bertelsen, M. B., Senissar, M., Nielsen, M. H., Bisiak, F., Cunha, M. V., Molinaro, A. L., Daines, D. A. & Brodersen, D. E., feb. 2021, I: Structure. 29, 2, s. 139-150.e3Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The RES domain toxins of RES-Xre toxin-antitoxin modules induce cell stasis by degrading NAD+
Skjerning, R. B., Senissar, M., Winther, K. S., Gerdes, K. & Brodersen, D. E., jan. 2019, I: Molecular Microbiology. 111, 1, s. 221-236 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
- Udgivet
Toxins, Targets, and Triggers: An Overview of Toxin-Antitoxin Biology
Harms, A., Brodersen, D. E., Mitarai, N. & Gerdes, K., 7 jun. 2018, I: Molecular Cell. 70, 5, s. 768-784 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
Anti-CRISPR proteins encoded by archaeal lytic viruses inhibit subtype I-D immunity
He, F., Bhoobalan-Chitty, Y., Van, L. B., Kjeldsen, A. L., Dedola, M., Makarova, K. S., Koonin, E. V., Brodersen, D. E. & Peng, X., apr. 2018, I: Nature Microbiology. 3, s. 461-469 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Structural basis for (p)ppGpp synthesis by the Staphylococcus aureus small alarmone synthetase RelP
Manav, M. C., Beljantseva, J., Bojer, M. S., Tenson, T., Ingmer, H., Hauryliuk, V. & Brodersen, D. E., 2018, I: Journal of Biological Chemistry. 293, 9, s. 3254-3264 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding
Bendtsen, K. L., Xu, K., Luckmann, M., Winther, K. S., Shah, S. A., Pedersen, C. N. S. & Brodersen, D. E., 17 mar. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 5, s. 2875-2886 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
- Udgivet
Structural insights into the bacterial carbon - phosphorus lyase machinery
Seweryn, P., Van, L. B., Kjeldgaard, M., J. Russo, C., A. Passmore, L., Hove-Jensen, B., Jochimsen, B. & Brodersen, D. E., sep. 2015, I: Nature. 525, s. 68-72 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
VapC20 of Mycobacterium tuberculosis Cleaves the Sarcin Ricin Loop of 23S rRNA
Winther, K. S., Brodersen, D. E., Brown, A. K. & Gerdes, K., 14 nov. 2013, I: Nature Communications. 4, 9 s., 2796.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
- Udgivet
The structure of intact E. coli RelBE suggests a structural basis for conditional cooperativity.
Bøggild, A., Sofos, N. E., Easter, A. D., Passmore, L. & Brodersen, D., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
Structural studies of microbial defence mechanisms
Ditlev E. Brodersen (Foredragsholder)
16 aug. 2018Aktivitet: Tale eller præsentation - typer › Foredrag og mundtlige bidrag
Down the rabbit hole
Ditlev E. Brodersen (Foredragsholder)
30 okt. 2017Aktivitet: Tale eller præsentation - typer › Foredrag og mundtlige bidrag
Discrete Structural Dynamics of Pseudo-Palindromic Motifs Control DNA Binding of Bacterial Toxin-Antitoxin Complexes
Ditlev E. Brodersen (Foredragsholder)
23 apr. 2017Aktivitet: Tale eller præsentation - typer › Foredrag og mundtlige bidrag
ST Education Award 2017
Brodersen, Ditlev E. (Modtager), 25 aug. 2017
Pris: Priser, stipendier, udnævnelser
Ditlev Brodersen awarded prestigious visiting professorship at Università di Parma
05/04/2017
1 Mediebidrag
Presse/medie
ID: 4930