Publikationer pr. år
Publikationer pr. år
- 1 - 50 ud af 102 resultater
Søgeresultater
-
2024
Breaking bad nucleotides: understanding the regulatory mechanisms of bacterial small alarmone hydrolases
Chrenková, A., Bisiak, F. & Brodersen, D. E., aug. 2024, I: Trends in Microbiology. 32, 8, s. 769-780 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
-
Structural Variations and Rearrangements in Bacterial Type II Toxin-Antitoxin Systems
Nielsen, M. R. & Brodersen, D. E., 2024, Macromolecular Protein Complexes V. Cham: Springer, Bind 104. s. 245-267 23 s. (Subcellular Biochemistry, Bind 104).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning
-
2023
Structural basis for kinase inhibition in the tripartite E. coli HipBST toxin-antitoxin system
Bærentsen, R. L., Nielsen, S. V., Skjerning, R. B., Lyngsø, J., Bisiak, F., Pedersen, J. S., Gerdes, K., Sørensen, M. A. & Brodersen, D. E., nov. 2023, I: eLife. 12, 20 s., RP90400.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang3 Citationer (Scopus) -
Structural remodelling of the carbon-phosphorus lyase machinery by a dual ABC ATPase
Amstrup, S. K., Ong, S. C., Sofos, N., Karlsen, J. L., Skjerning, R. B., Boesen, T., Enghild, J. J., Hove-Jensen, B. & Brodersen, D. E., feb. 2023, I: Nature Communications. 14, 1001.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang9 Citationer (Scopus) -
2022
A Semester-Long Learning Path Teaching Computational Skills via Molecular Graphics in PyMOL
Kjærgaard, M., Rasmussen, L. S., Vinther, J. N., Andersen, K. R., Andersen, E. S., Lorentzen, E., Thirup, S. S., Otzen, D. & Brodersen, D. E., dec. 2022, I: The Biophysicist. 3, 2, s. 106–114 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang -
Structural basis for regulation of a tripartite toxin-antitoxin system by dual phosphorylation
Bærentsen, R., Vang Nielsen, S., Lyngsø, J., Bisiak, F., Pedersen, J. S., Gerdes, K., Sørensen, M. & Brodersen, D. E., jan. 2022, bioRxiv, 76 s.Publikation: Working paper/Preprint › Preprint
Åben adgang -
Structural Remodelling of the Carbon-Phosphorus Enzymatic Machinery by a Dual ATP-Binding Cassette Module
Brodersen, D. E., Amstrup, S. K., Sofos, N. E., Karlsen, J., Skjerning, R., Boesen, T., Enghild, J. J. & Jensen, B. H., maj 2022, I: The FASEB Journal. 36 , S1Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning
-
Structural remodelling of the carbon-phosphorus lyase machinery by a dual ABC ATPase
Amstrup, S. K., Sofos, N. E., Karlsen, J. L., Skjerning, R. B., Boesen, T., Enghild, J. J., Hove-Jensen, B. & Brodersen, D. E., jun. 2022, bioRxiv, 34 s.Publikation: Working paper/Preprint › Preprint
-
Structural variations between small alarmone hydrolase dimers support different modes of regulation of the stringent response
Bisiak, F., Chrenková, A., Zhang, S. D., Pedersen, J. N., Otzen, D. E., Zhang, Y. E. & Brodersen, D. E., jul. 2022, I: Journal of Biological Chemistry. 298, 7, 102142.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang4 Citationer (Scopus) -
2021
Evolving complex insulation
Liuzzi, A. & Brodersen, D. E., dec. 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 12, s. 1216-1217 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
-
Phylogeny Reveals Novel HipA-Homologous Kinase Families and Toxin-Antitoxin Gene Organizations
Gerdes, K., Bærentsen, R. & Brodersen, D. E., 29 jun. 2021, I: mBio. 12, 3, s. e0105821 e01058-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
11 Citationer (Scopus) -
Structural Basis for Toxin Inhibition in the VapXD Toxin-Antitoxin System
Bertelsen, M. B., Senissar, M., Nielsen, M. H., Bisiak, F., Cunha, M. V., Molinaro, A. L., Daines, D. A. & Brodersen, D. E., feb. 2021, I: Structure. 29, 2, s. 139-150.e3Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang13 Citationer (Scopus) -
Two P or Not Two P: Understanding Regulation by the Bacterial Second Messengers (p)ppGpp
Bange, G., Brodersen, D. E., Liuzzi, A. & Steinchen, W., 2021, I: Annual Review of Microbiology. 75, s. 383-406 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
32 Citationer (Scopus) -
2020
Structural basis for inhibition of an archaeal CRISPR-Cas type I-D large subunit by an anti-CRISPR protein
Manav, M. C., Van, L. B., Lin, J., Fuglsang, A., Peng, X. & Brodersen, D. E., nov. 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 10 s., 5993.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang17 Citationer (Scopus) -
Structure and Function of the Bacterial Protein Toxin Phenomycin
Hansen, B. K., Larsen, C. K., Nielsen, J. T., Svenningsen, E. B., Van, L. B., Jacobsen, K. M., Bjerring, M., Flygaard, R. K., Jenner, L. B., Nejsum, L. N., Brodersen, D. E., Mulder, F. A. A., Tørring, T. & Poulsen, T. B., 2020, I: Structure. 28, 5, s. 528-539.e9 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
2 Citationer (Scopus) -
2019
(p)ppGpp Regulates a bacterial nucleosidase by an allosteric two-domain switch
Zhang, Y., Bærentsen, R. L., Fuhrer, T., Sauer, U., Gerdes, K. & Brodersen, D. E., apr. 2019, I: Molecular Cell. 74, 6, s. 1239-1249.e4Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil35 Citationer (Scopus)50 Downloads (Pure) -
Evolution of the bacterial nucleosidase PpnN and its relation to the stringent response
Bærentsen, R. L., Brodersen, D. E. & Zhang, Y. E., sep. 2019, I: Microbial Cell. 6, 9, s. 450-453 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang7 Citationer (Scopus) -
Serine-Threonine Kinases Encoded by Split hipA Homologs Inhibit Tryptophanyl-tRNA Synthetase
Vang Nielsen, S., Turnbull, K. J., Roghanian, M., Bærentsen, R., Semanjski, M., Brodersen, D. E., Macek, B. & Gerdes, K., 18 jun. 2019, I: mBio. 10, 3, 16 s., e01138-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
23 Citationer (Scopus) -
The E. coli HicB Antitoxin Contains a Structurally Stable Helix-Turn-Helix DNA Binding Domain
Manav, C., Turnbull, K. J., Jurėnas, D., Garcia-Pino, A., Gerdes, K. & Brodersen, D. E., nov. 2019, I: Structure. 27, 11, s. 1675-1685.e3Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil15 Citationer (Scopus)59 Downloads (Pure) -
The Prodigal Compound: Return of Ribosyl 1,5-Bisphosphate as an Important Player in Metabolism
Hove-Jensen, B., Brodersen, D. E. & Manav, C., mar. 2019, I: Microbiology and Molecular Biology Reviews. 83, 1, e00040-18.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
Åben adgang5 Citationer (Scopus) -
The RES domain toxins of RES-Xre toxin-antitoxin modules induce cell stasis by degrading NAD+
Skjerning, R. B., Senissar, M., Winther, K. S., Gerdes, K. & Brodersen, D. E., jan. 2019, I: Molecular Microbiology. 111, 1, s. 221-236 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil37 Citationer (Scopus)155 Downloads (Pure) -
2018
Anti-CRISPR proteins encoded by archaeal lytic viruses inhibit subtype I-D immunity
He, F., Bhoobalan-Chitty, Y., Van, L. B., Kjeldsen, A. L., Dedola, M., Makarova, K. S., Koonin, E. V., Brodersen, D. E. & Peng, X., apr. 2018, I: Nature Microbiology. 3, 4, s. 461-469 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil103 Citationer (Scopus)380 Downloads (Pure) -
Publisher Correction: Anti-CRISPR proteins encoded by archaeal lytic viruses inhibit subtype I-D immunity
He, F., Bhoobalan-Chitty, Y., Van, L. B., Kjeldsen, A. L., Dedola, M., Makarova, K. S., Koonin, E. V., Brodersen, D. E. & Peng, X., 21 jun. 2018, I: Nature Microbiology. 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning
-
Structural basis for (p)ppGpp synthesis by the Staphylococcus aureus small alarmone synthetase RelP
Manav, M. C., Beljantseva, J., Bojer, M. S., Tenson, T., Ingmer, H., Hauryliuk, V. & Brodersen, D. E., 2018, I: Journal of Biological Chemistry. 293, 9, s. 3254-3264 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil36 Citationer (Scopus)159 Downloads (Pure) -
The ABC of Phosphonate Breakdown: A Mechanism for Bacterial Survival
Manav, C., Sofos, N., Hove-Jensen, B. & Brodersen, D. E., nov. 2018, I: BioEssays. 40, 11, 11 s., 1800091.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
Åben adgangFil30 Citationer (Scopus)206 Downloads (Pure) -
Toxins, Targets, and Triggers: An Overview of Toxin-Antitoxin Biology
Harms, A., Brodersen, D. E., Mitarai, N. & Gerdes, K., 7 jun. 2018, I: Molecular Cell. 70, 5, s. 768-784 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review
Åben adgang455 Citationer (Scopus) -
2017
Discrete Structural Dynamics of Pseudo-Palindromic Motifs Control DNA Binding of Bacterial Toxin-Antitoxin Complexes
Brodersen, D. E., Bendtsen, K. L., Xu, K., Luckmann, M., Winther, K., Shah, S. A. & Pedersen, C. N. S., apr. 2017, I: F A S E B Journal. 31, No. 1 supplement, 1 s., 777.2.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review
Åben adgang -
Higher-Order Structure in Bacterial VapBC Toxin-Antitoxin Complexes
Bendtsen, K. L. & Brodersen, D. E., 2017, I: Sub-cellular Biochemistry. 83, s. 381-412 32 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
13 Citationer (Scopus) -
Structural conservation of the PIN domain active site across all domains of life
Senissar, M., Manav, M. C. & Brodersen, D. E., 2017, I: Protein Science. 26, 8, s. 1474-1492 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil33 Citationer (Scopus)230 Downloads (Pure) -
Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding
Bendtsen, K. L., Xu, K., Luckmann, M., Winther, K. S., Shah, S. A., Pedersen, C. N. S. & Brodersen, D. E., 17 mar. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 5, s. 2875-2886 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil16 Citationer (Scopus)248 Downloads (Pure) -
2016
Computational discovery of specificity-conferring sites in non-ribosomal peptide synthetases
Knudsen, M., Søndergaard, D. A., Tofting-Olesen, C., Hansen, F. T., Brodersen, D. E. & Pedersen, C. S., 2016, I: Bioinformatics. 32, 3, s. 325-329 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
22 Citationer (Scopus) -
Identification of the non-ribosomal peptide synthetase responsible for biosynthesis of the potential anti-cancer drug sansalvamide in Fusarium solani
Romans-Fuertes, P., Sondergaard, T. E., Sandmann, M. I. H., Wollenberg, R. D., Nielsen, K. F., Hansen, F. T., Giese, H., Brodersen, D. E. & Sørensen, J. L., 1 nov. 2016, I: Current Genetics. 62, 4, s. 799-807 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
23 Citationer (Scopus) -
RRM domain of human RBM7: purification, crystallization and structure determination
Sofos, N. E., Winkler, M. & Brodersen, D. E., 22 apr. 2016, I: Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications. 72, Pt 5, s. 397-402 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
5 Citationer (Scopus) -
Structural analysis of the active site architecture of the VapC toxin from Shigella flexneri
Xu, K., Dedic, E. & Brodersen, D. E., 7 apr. 2016, I: Proteins. 84, 7, s. 892-899 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
10 Citationer (Scopus) -
The transcriptional regulator GalR self-assembles to form highly regular tubular structures
Agerschou, E. D., Christiansen, G., Schafer, N. P., Madsen, D. J., Brodersen, D. E., Semsey, S. & Otzen, D. E., 2016, I: Scientific Reports. 6, 27672.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang2 Citationer (Scopus) -
2015
An update to polyketide synthase and non-ribosomal synthetase genes and nomenclature in Fusarium
Hansen, F. T., Gardiner, D. M., Lysøe, E., Fuertes, P. R., Tudzynski, B., Wiemann, P., Sondergaard, T. E., Giese, H., Brodersen, D. E. & Sørensen, J. L., feb. 2015, I: Fungal Genetics and Biology. 75, s. 20-29 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
99 Citationer (Scopus) -
Cut to the chase-Regulating translation through RNA cleavage
Sofos, N., Xu, K., Dedic, E. & Brodersen, D. E., jul. 2015, I: Biochimie. 114, s. 10-17 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
13 Citationer (Scopus) -
Structural basis for RNA-genome recognition during bacteriophage Qβ replication
Olesen, H. G., Mohr, D., Seweryn, P., Yoshimura, Y., Kutlubaeva, Z., Dolman, F., Chelchessa, B., Chetverin, A. B., Mulder, F. A. A., Brodersen, D. E. & Knudsen, C. R., 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 22, s. 10893-10906 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil21 Citationer (Scopus)208 Downloads (Pure) -
Structural Biology
Brodersen, D. E., 4 jun. 2015. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
-
Structural Insights Into The Bacterial Carbon-Phosphorus Lyase Machinery
Brodersen, D. E., 12 jul. 2015. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
60 Citationer (Scopus) -
Structural insights into the bacterial carbon - phosphorus lyase machinery
Seweryn, P., Van, L. B., Kjeldgaard, M., J. Russo, C., A. Passmore, L., Hove-Jensen, B., Jochimsen, B. & Brodersen, D. E., sep. 2015, I: Nature. 525, s. 68-72 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
60 Citationer (Scopus) -
Structural studies of the human Nuclear EXosome Targeting complex
Sofos, N. E., Brodersen, D. E. & Winkler, M., 25 aug. 2015. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
-
2014
Fungal NRPS-dependent siderophores: From function to prediction
Sørensen, J. L., Knudsen, M., Hansen, F. T., Olesen, C., Romans Fuertes, P., Lee, T. V., Søndergaard, T. E., Pedersen, C. N. S., Brodersen, D. E. & Giese, H., 26 jul. 2014, Biosynthesis and Molecular Genetics of Fungal Secondary Metabolites. Martin, J.-F., Garcia-Estrada, C. & Zeilinger, S. (red.). Springer, s. 317-339 13 s. (Fungal Biology).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review
-
Structural analysis of the yeast exosome Rrp6p-Rrp47p complex by small-angle x-ray scattering
Dedic, E., Seweryn, P., Jonstrup, A. T., Flygaard, R. K., Fedosova, N. U., Hoffmann, S. V., Boesen, T. & Brodersen, D. E., 18 jul. 2014, I: Biochemical and Biophysical Research Communications. 450, 1, s. 634-640 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil5 Citationer (Scopus)549 Downloads (Pure) -
Structural Characterization of the Saccharomyces cerevisiae THO Complex by Small-Angle X-Ray Scattering
Poulsen, J. B., Sanderson, L. E., Agerschou, E. D., Dedic, E., Boesen, T. & Brodersen, D. E., jul. 2014, I: PLOS ONE. 9, 7, s. 1-11 11 s., e103470.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil3 Citationer (Scopus)327 Downloads (Pure) -
Understanding the Substrate Specificity of the Fungal NRPS Enzymes
Olesen, C., Hansen, F. T. & Brodersen, D. E., 14 nov. 2014. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
-
2013
Expression and purification of the human MTR4 protein – an activator of the nuclear exosome
Sofos, N. E. & Brodersen, D. E., 27 maj 2013.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
-
Mimer: an automated spreadsheet-based crystallization screening system
Brodersen, D. E., Andersen, G. R. & Andersen, C. B. F., 1 jul. 2013, I: Acta Crystallographica. Section F: Structural Biology and Crystallization Communications Online. 69, Pt 7, s. 815-820 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil11 Citationer (Scopus)698 Downloads (Pure) -
Mutational analysis of the yeast RNA helicase Sub2p reveals conserved domains required for growth, mRNA export, and genomic stability
Saguez, C., Zubiate, F. A. G., Schmid, M., Bøggild, A., Latrick, C. M., Malagon, F., Putnam, A., Sanderson, L., Jankowsky, E., Brodersen, D. E. & Jensen, T. H., 20 aug. 2013, I: RNA. 19, s. 1363-1371 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil23 Citationer (Scopus)203 Downloads (Pure) -
Protein expression, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the isolated Shigella flexneri VapC toxin
Kehan, X., Dedic, E., Cob-Cantal, P., Dienemann, C., Bøggild, A., Winther, K. S., Gerdes, K. & Brodersen, D. E., 1 jul. 2013, I: Acta Crystallographica. Section F: Structural Biology and Crystallization Communications Online. 69, Pt 7, s. 762-765 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Fil6 Citationer (Scopus)264 Downloads (Pure)