Aarhus University Seal

Daniel Miotto Dupont

  1. 2023
  2. Udgivet

    Antigen footprint governs activation of the B cell receptor. / Ferapontov, Alexey; Omer, Marjan; Baudrexel, Isabelle et al.

    I: Nature Communications, Bind 14, Nr. 1, 976, 12.2023.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. 2022
  4. Udgivet

    Differential RNA aptamer affinity profiling on plasma as a potential diagnostic tool for bladder cancer. / Fjelstrup, Søren; Dupont, Daniel M; Bus, Claus et al.

    I: NAR cancer, Bind 4, Nr. 3, zcac025, 09.2022.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. 2021
  6. Udgivet

    A serum-stable RNA aptamer specific for SARS-CoV-2 neutralizes viral entry. / Valero, Julian; Civit, Laia; Dupont, Daniel M. et al.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 118, Nr. 50, e2112942118, 12.2021.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  7. Udgivet

    Nanopore sequencing of brain-derived full-length circRNAs reveals circRNA-specific exon usage, intron retention and microexons. / Rahimi, Karim; Venø, Morten T.; Dupont, Daniel M. et al.

    I: Nature Communications, Bind 12, 4825, 08.2021.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  8. Udgivet

    Multivalent Aptamer-Functionalized Single-Strand RNA Origami as Effective, Target-Specific Anticoagulants with Corresponding Reversal Agents. / Krissanaprasit, Abhichart; Key, Carson M; Froehlich, Kristen et al.

    I: Advanced Healthcare Materials, Bind 10, Nr. 11, 2001826, 06.2021.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  9. 2019
  10. Udgivet

    Biochemical and structural analyses suggest that plasminogen activators coevolved with their cognate protein substrates and inhibitors. / Jendroszek, Agnieszka; Madsen, Jeppe B; Chana-Muñoz, Andrés et al.

    I: The Journal of Biological Chemistry, Bind 294, Nr. 10, 03.2019, s. 3794-3805.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. Udgivet

    Blocking the proteolytic activity of zymogen matriptase with antibody-based inhibitors. / Tamberg, Trine; Hong, Zebin; De Schepper, Daphné et al.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 294, Nr. 1, 01.2019, s. 314-326.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  12. 2018
  13. Udgivet

    Small-Molecule Probes for Affinity-Guided Introduction of Biocompatible Handles on Metal-Binding Proteins. / Mortensen, Michael Rosholm; Skovsgaard, Mikkel B.; Okholm, Anders Hauge et al.

    I: Bioconjugate Chemistry, Bind 29, Nr. 9, 19.09.2018, s. 3016–3025.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  14. 2017
  15. Udgivet

    An albumin-oligonucleotide assembly for potential combinatorial drug delivery and half-life extension applications. / Kuhlmann, Matthias; Hamming, Jonas Bohn Refslund; Voldum, Anders et al.

    I: Molecular Therapy - Nucleic Acids, Bind 9, 15.12.2017, s. 284-293.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  16. Udgivet

    A Conjugate of Two tPA-Binding RNA Aptamers Efficiently Inhibits Fibrinolysis. / Bjerregaard, Nils; Dupont, Daniel M; Andreasen, Peter A.

    I: Nucleic Acid Therapeutics, Bind 27, Nr. 2, 01.04.2017, s. 95-104.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  17. 2016
  18. Udgivet

    An RNA Aptamer Inhibits a Mutation-Induced Inactivating Misfolding of a Serpin. / Madsen, Jeppe B; Andersen, Lisbeth M; Dupont, Daniel M et al.

    I: Cell Chemical Biology, Bind 23, Nr. 6, 01.06.2016, s. 700–708.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  19. Udgivet

    Expected and unexpected features of protein-binding RNA aptamers. / Bjerregaard, Nils; Andreasen, Peter A; Dupont, Daniel M.

    I: Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA, Bind 7, Nr. 6, 12.05.2016, s. 744-757.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  20. Udgivet

    Building a Molecular Trap for a Serine Protease from Aptamer and Peptide Modules. / Dupont, Daniel M; Bjerregaard, Nils; Verpaalen, Ben et al.

    I: Bioconjugate Chemistry, Bind 27, Nr. 4, 2016, s. 918-926.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  21. 2015
  22. Udgivet

    Characterisation of aptamer-target interactions by branched selection and high-throughput sequencing of SELEX pools. / Dupont, Daniel M; Larsen, Niels; Jensen, Jan K et al.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 43, Nr. 21, e139, 02.12.2015, s. 1-13.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  23. Udgivet

    Tissue-type plasminogen activator-binding RNA aptamers inhibiting low-density lipoprotein receptor family-mediated internalisation. / Bjerregaard, N; Bøtkjær, K A; Helsen, N et al.

    I: Thrombosis and Haemostasis, Bind 114, Nr. 1, 07.2015, s. 139-149.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  24. Udgivet

    Protein-binding RNA aptamers affect molecular interactions distantly from their binding sites. / Dupont, Daniel Miotto; Thuesen, Cathrine K; Bøtkjær, Kenneth A et al.

    I: PLOS ONE, Bind 10, Nr. 3, e0119207, 20.03.2015, s. 1-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  25. 2014
  26. Udgivet

    Dissecting the effect of RNA aptamer binding on the dynamics of plasminogen activator inhibitor 1 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry. / Trelle, Morten B; Dupont, Daniel Miotto; Madsen, Jeppe Buur et al.

    I: A C S Chemical Biology, Bind 9, Nr. 1, 17.01.2014, s. 174-182.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  27. 2012
  28. Udgivet

    Targeting Tumor Cell Invasion and Dissemination In Vivo by an Aptamer That Inhibits Urokinase-type Plasminogen Activator through a Novel Multifunctional Mechanism. / Botkjaer, Kenneth A; Deryugina, Elena I; Dupont, Daniel M et al.

    I: Molecular Cancer Research, Bind 10, Nr. 12, 2012, s. 1532-1543.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  29. 2011
  30. Udgivet

    Tumor-targeted polydiacetylene micelles for in vivo imaging and drug delivery. / Mackiewicz, Nicolas; Gravel, Edmond; Garofalakis, Anikitos et al.

    I: Small, Bind 7, Nr. 19, 04.10.2011, s. 2786-92.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet

    Methods to Identify Aptamers against Cell Surface Biomarkers. / Cibiel, Agnes; Ducongé, Frédéric; Dupont, Daniel Miotto.

    I: Pharmaceuticals, Bind 4, Nr. 9, 20.09.2011, s. 1216-1235.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Nucleic Acid Aptamers Against Proteases. / Dupont, D M; Andersen, L M; Bøtkjær, Kenneth Alrø et al.

    I: Current Medicinal Chemistry, Bind 18, Nr. 27, 15.09.2011, s. 4139-4151.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    RNA aptamers to the cancer-associated proteins UPA and PAI-1 with therapeutic potential. / Dupont, Daniel Miotto; Madsen, Jeppe Buur; Bøtkjær, Kenneth Alrø et al.

    I: Nucleic Acid Therapeutics, Bind 21, Nr. 5, 2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  34. 2010
  35. Udgivet

    Serum-stable RNA aptamers to urokinase-type plasminogen activator blocking receptor binding. / Dupont, Daniel Miotto; Madsen, Jeppe Buur; Hartmann, Roland Karl et al.

    I: RNA, Bind 16, Nr. 12, 01.12.2010, s. 2360-9.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  36. Udgivet

    In vivo validation of free-space fluorescence tomography using nuclear imaging. / Garofalakis, Anikitos; Dubois, Albertine; Kuhnast, Bertrand et al.

    I: Chinese Optics Letters, Bind 35, Nr. 18, 15.09.2010, s. 3024-6.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  37. Udgivet

    RNA aptamers as conformational probes and regulatory agents for plasminogen activator inhibitor-1. / Madsen, Jeppe B; Dupont, Daniel Miotto; Andersen, Thomas B et al.

    I: Biochemistry, Bind 49, Nr. 19, 18.05.2010, s. 4103-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  38. 2009
  39. Udgivet

    Interactions of plasminogen activator inhibitor-1 with vitronectin involve an extensive binding surface and induce mutual conformational rearrangements. / Blouse, Grant E; Dupont, Daniel Miotto; Schar, Christine R et al.

    I: Biochemistry, Bind 48, Nr. 8, 03.03.2009, s. 1723-35.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  40. Udgivet

    Biochemical properties of plasminogen activator inhibitor-1. / Dupont, Daniel Miotto; Madsen, Jeppe Buur; Kristensen, Thomas Kielsgaard et al.

    I: Frontiers in Bioscience, Bind 14, 2009, s. 1337-1361.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisReviewForskning

  41. 2008
  42. Udgivet

    A new way of targeting protease-receptor binding: Selection of uPA binding RNA aptamers inhibiting its association to its receptor uPAR. / Dupont, Daniel Miotto; Kjems, Jørgen; Andreasen, Peter et al.

    I: Acta Pathologica Microbiologica et Immunologica Scandinavica, 2008, s. 443-443.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  43. Udgivet

    A peptide accelerating the conversion of plasminogen activator inhibitor-1 to an inactive latent state. / Mathiasen, Lisa; Dupont, Daniel Miotto; Christensen, Anni et al.

    I: Molecular Pharmacology, Bind 74, Nr. 3, 2008, s. 641-653.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  44. Udgivet

    Phage-displayed peptides and RNA aptamers targeting the cancer-associated proteins uPA and PAI-1. / Dupont, Daniel Miotto.

    Aarhus Universitetsforlag, 2008.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  45. 2007
  46. Udgivet

    A novel type of agent blocking the association of uPA to its receptor uPAR: uPA-binding aptamers. / Dupont, Daniel Miotto; Madsen, J.B.; Kjems, Jørgen et al.

    2007. Abstract fra XIth International Workshop on Molecular and Cellular Biology of Plasminogen Activation, Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  47. Udgivet

    Conformational probes and activity regulators of plasminogen activator inhibitor-1, isolated from phage-displayed disulphide bridge-constrained peptide libraries. / Dupont, Daniel Miotto; Jensen, J.K.; Mathiasen, Lisa et al.

    2007. Poster session præsenteret ved XIth International Workshop on Molecular and Cellular Biology of Plasminogen Activation, Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  48. Udgivet

    Dissecting serpin-protease reaction pathways by the use of monoclonal antibodies. / Bødker, J.S.; Blouse, Grant; Dupont, Daniel Miotto et al.

    2007. Poster session præsenteret ved XIth International Workshop on Molecular and Cellular Biology of Plasminogen Activation, Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  49. Udgivet

    PAI-1-vitronectin interactions involve an extended binding surface and mutual conformational rearrangements. / Blouse, Grant; Peterson, C.B.; Dupont, Daniel Miotto et al.

    2007. Poster session præsenteret ved XIth International Workshop on Molecular and Cellular Biology of Plasminogen Activation, Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  50. Udgivet
  51. 2006
  52. Udgivet

    Evidence for a pre-latent form of the serpin plasminogen activator inhibitor-1 with a detached beta-strand 1C. / Dupont, Daniel M; Blouse, Grant E; Hansen, Martin et al.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 281, Nr. 47, 24.11.2006, s. 36071-81.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  53. Udgivet

    Evidence for a prelatent form of plasminogen activator inhibitor-1 with a detached β-strand 1C. / Dupont, Daniel Miotto; Blouse, Grant; Hansen, Martin et al.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 281, 2006, s. 36071-36081.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  54. Udgivet

    Novel conformational probes and activity regulators of plasminogen avtivator inhibitor-1, isolated from phage-displayed disulfide bridge constrained peptide libraries. / Dupont, Daniel Miotto; Hansen, Martin; Jensen, J.K. et al.

    2006. Poster session præsenteret ved Annual Meeting of the "Cancer Degradome", København, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  55. 2004
  56. Udgivet

    Construction of a plasminogen activator inhibitor-1 variant without measurable affinity to vitronection buth otherwise normal. / Jensen, J.K.; Durand, M.K.V.; Skeldal, S. et al.

    I: F E B S Letters, Bind 556, 2004, s. 175-179.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  57. Udgivet

    Plasminogen activator inhibitor-1 and tumour growth, invasion, and metastasis. / Durand, M, K.V.; Bødker, J.S.; Christensen, A. et al.

    I: Thromb. Haemostas., Bind 91, 2004, s. 438-449.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  58. 2003
  59. Udgivet

    Mutational analysis of plasminogen activator inhibitor-1. Interactions of a-helix F and its neighbouring structural elements regulates the activity and the rate of latency transition. / Wind, T.; Jensen, J.K.; Dupont, D.M. et al.

    I: F E B S Journal, Bind 270, 2003, s. 1680-1688.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review