Christian Nørgaard Storm Pedersen

Publikation

Publikationer pr. år 2001 2001 2002 2003 2004 2005 2009 2010 2011 2013 2014 2018

• 41 Tidsskriftartikel
• 21 Konferencebidrag i proceedings
• 9 Poster
• 4 Konferenceartikel
• 8 Mere
  • 3 Bidrag til bog/antologi
  • 2 Working paper
  • 1 Rapport
  • 1 Konferenceabstrakt i tidsskrift
  • 1 Letter

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2018

  BS-virus-finder: virus integration calling using bisulfite sequencing data

  Gao, S., Hu, X., Xu, F., Gao, C., Xiong, K., Zhao, X., Chen, H., Zhao, S., Wang, M., Fu, D., Zhao, X., Bai, J., Mao, L., Li, B., Wu, S., Wang, J., Li, S., Yang, H., Bolund, L. & Pedersen, C. N. S., 2018, I: GigaScience. 7, 1, s. 1-7 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Bisulfite Sequencing 100%
  • Finders 100%
  • Virus Integration 100%
  • Virus DNA Cell DNA Interaction 100%
  • DNA Methylation 75%
  2 Citationer (Scopus)
• 2017

  Discrete Structural Dynamics of Pseudo-Palindromic Motifs Control DNA Binding of Bacterial Toxin-Antitoxin Complexes

  Brodersen, D. E., Bendtsen, K. L., Xu, K., Luckmann, M., Winther, K., Shah, S. A. & Pedersen, C. N. S., apr. 2017, I: F A S E B Journal. 31, No. 1 supplement, 1 s., 777.2.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review

  Åben adgang

• Prediction of Primary Tumors in Cancers of Unknown Primary

  Søndergaard, D., Nielsen, S., Pedersen, C. N. S. & Besenbacher, S., 7 jul. 2017, I: Journal of integrative bioinformatics. 14, 2

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Classification Accuracy 100%
  • Clinical Outcome 100%
  • Molecular Data 100%
  • Gene Expression Data 100%
  10 Citationer (Scopus)

  266 Downloads (Pure)

• Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference

  Maretty, L., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. C., Theil Have, C., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J. & Guo, X. & 39 flere, Sun, J., Cao, H., Ye, C., van Beusekom, J., Espeseth, T., Flindt, E. N., Friborg, R. M., Halager, A. E., Le Hellard, S., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Mailund, T., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Ponten, T., Sullivan, P. F., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, T., Krogh, A., Bolund, L., Sørensen, T. I. A., Pedersen, O., Gupta, R., Rasmussen, S., Besenbacher, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, H., Kristiansen, K., Brunak, S. & Schierup, M. H., 3 aug. 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Association Mapping 100%
  • Genetic Variation 66%
  • Haplotype 33%
  • Major Histocompatibility Complex 33%
  • Human Genome 33%
  92 Citationer (Scopus)

  605 Downloads (Pure)

• Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding

  Bendtsen, K. L., Xu, K., Luckmann, M., Winther, K. S., Shah, S. A., Pedersen, C. N. S. & Brodersen, D. E., 17 mar. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 5, s. 2875-2886 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Antitoxin 100%
  • DNA Binding 100%
  • Protein Motif 100%
  • Peptide Sequence 28%
  • Toxin-Antitoxin System 28%
  16 Citationer (Scopus)

  248 Downloads (Pure)
• 2016

  Computational Classification of P-Type ATPases

  Søndergaard, D. A., Knudsen, M. & Pedersen, C. S., 2016, I: Methods in Molecular Biology. 1377, s. 493-502 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • P-Type ATPase 100%
  • Molecular Biology 50%
  • Peptide Sequence 50%

• Computational discovery of specificity-conferring sites in non-ribosomal peptide synthetases

  Knudsen, M., Søndergaard, D. A., Tofting-Olesen, C., Hansen, F. T., Brodersen, D. E. & Pedersen, C. S., 2016, I: Bioinformatics. 32, 3, s. 325-329 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Computational Discovery 100%
  • Synthetase 100%
  • Nonribosomal Peptides 100%
  • Nonribosomal Peptide 100%
  • Peptide Sequence 42%
  22 Citationer (Scopus)
• 2015

  Novel variation and de novo mutation rates in population-wide de novo assembled Danish trios

  Besenbacher, S., Liu, S., Izarzugaza, J. M. G., Grove, J., Belling, K., Bork-Jensen, J., Huang, S., Als, T. D., Li, S., Yadav, R., Rubio-García, A., Lescai, F., Demontis, D., Rao, J., Ye, W., Mailund, T., Møllegaard Friborg, R., Pedersen, C. N. S., Xu, R. & Sun, J. & 27 flere, Liu, H., Wang, O., Cheng, X., Flores, D., Rydza, E., Rapacki, K., Damm Sørensen, J., Chmura, P., Westergaard, D., Dworzynski, P., Sørensen, T. I. A., Lund, O., Hansen, T., Xu, X., Li, N., Bolund, L., Pedersen, O., Eiberg, H., Krogh, A., Børglum, A. D., Brunak, S., Kristiansen, K., Schierup, M. H., Wang, J., Gupta, R., Villesen, P. & Rasmussen, S., 2015, I: Nature Communications. 6, 9 s., 5969.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  131 Citationer (Scopus)

• PATBox: A Toolbox for Classification and Analysis of P-Type ATPases

  Søndergaard, D. & Pedersen, C. N. S., 2015, I: PLOS ONE. 10, 9, e0139571.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  1 Citationer (Scopus)
• 2014

  Combinatorics of Non-Ribosomal Peptide Synthetases

  Knudsen, M., Søndergaard, D. & Pedersen, C. N. S., 5 nov. 2014.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• Fungal NRPS-dependent siderophores: From function to prediction

  Sørensen, J. L., Knudsen, M., Hansen, F. T., Olesen, C., Romans Fuertes, P., Lee, T. V., Søndergaard, T. E., Pedersen, C. N. S., Brodersen, D. E. & Giese, H., 26 jul. 2014, Biosynthesis and Molecular Genetics of Fungal Secondary Metabolites. Martin, J.-F., Garcia-Estrada, C. & Zeilinger, S. (red.). Springer, s. 317-339 13 s. (Fungal Biology).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  • Siderophore 100%

• Large Scale Identification and Categorization of Protein Sequences Using Structured Logistic Regression

  Pedersen, B. P., Ifrim, G., Liboriussen, P., Axelsen, K. B., Palmgren, M. G., Nissen, P., Wiuf, C. H. & Pedersen, C. N. S., 20 jan. 2014, I: P L o S One. 9, 1, 11 s., e85139.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  12 Citationer (Scopus)

• Machine learning approaches to functional prediction of P-Type ATPases

  Søndergaard, D., Knudsen, M. & Pedersen, C. N. S., nov. 2014.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• tqDist: A Library for Computing the Quartet and Triplet Distances Between Binary and General Trees

  Sand, A., Holt, M. K., Johansen, J., Brodal, G. S., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 2014, I: Bioinformatics. 30, 4, s. 2079-2080 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  50 Citationer (Scopus)
• 2013

  Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distances for Binary and General Trees

  Sand, A., Holt, M. K., Johansen, J., Fagerberg, R., Pedersen, C. N. S., Brodal, G. S. & Mailund, T., 2013, I: Biology. 2, 4, s. 1189-1209 21 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  13 Citationer (Scopus)

• Algorithms for Hidden Markov Models Restricted to Occurrences of Regular Expressions

  Tataru, P., Sand, A., Hobolth, A., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 8 nov. 2013, I: Biology. 2, 4, s. 1282-1295 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Decoding Algorithm 100%
  • Hidden Markov Model 100%
  • Model Analysis 33%
  3 Citationer (Scopus)

• A practical O(n log² n) time algorithm for computing the triplet distance on binary trees

  Sand, A., Pedersen, C. N. S., Mailund, T., Brodal, G. S. & Fagerberg, R., 2013, I: B M C Bioinformatics. 14, Suppl 2, s. S18 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Binary Tree 100%
  • Running Time 33%
  • Asymptotics 33%
  • Induced Topology 33%
  • Time Complexity 33%
  6 Citationer (Scopus)

  476 Downloads (Pure)

• Characterising RNA secondary structure space using information entropy

  Sükösd, Z., Knudsen, B., Anderson, J. W., Novák, A., Kjems, J. & Pedersen, C. N. S., 21 jan. 2013, I: B M C Bioinformatics. 14 , Suppl 2, s. 1-9 9 s., S22.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Protein Secondary Structure 100%
  • RNA 100%
  • Probability Distribution 50%
  7 Citationer (Scopus)

  247 Downloads (Pure)

• Efficient Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degree

  Brodal, G. S., Fagerberg, R., Mailund, T., Pedersen, C. N. S. & Sand, A., 2013, I: The Annual A C M - S I A M Symposium on Discrete Algorithms. Proceedings. 24, s. 1814-1832 19 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Running Time 100%
  • Induced Topology 100%
  • Efficient Algorithm 100%
  • Distance Measure 50%
  32 Citationer (Scopus)

  711 Downloads (Pure)

• GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution

  Simonsen, M., Christensen, M. H., Thomsen, R. & Pedersen, C. N. S., 2013, Massively Parallel Evolutionary Computation on GPGPUs. tsutsui, S. & Collet, P. (red.). Springer Publishing Company, (Natural Computing Series).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  1 Citationer (Scopus)

• Methods for Similarity-Based Virtual Screening

  Kristensen, T. G., Nielsen, J. & Pedersen, C. N. S., 2013, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 5, 6

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  20 Citationer (Scopus)

• zipHMMlib: a highly optimised HMM library exploiting repetitions in the input to speed up the forward algorithm

  Sand, A., Kristiansen, M., Pedersen, C. N. S. & Mailund, T., dec. 2013, I: BMC Bioinformatics . 14, 339, s. 339-348 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  10 Citationer (Scopus)
• 2012

  Evolution of plant P-type ATPases

  Pedersen, C. N. S., Axelsen, K. B., Harper, J. F. & Palmgren, M. G., 2012, I: Frontiers in Plant Science. 21

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  126 Citationer (Scopus)

• PPfold 3.0: fast RNA secondary structure prediction using phylogeny and auxiliary data

  Sükösd, Z., Knudsen, B., Kjems, J. & Pedersen, C. N. S., 9 nov. 2012, I: Bioinformatics. 28, 20, s. 2691-2692 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Protein Secondary Structure 100%
  • RNA 100%
  • Secondary Structure 100%
  • Structure Prediction 33%
  • Accurate Prediction 33%
  45 Citationer (Scopus)

• shortran: A pipeline for small RNA-seq data analysis

  Gupta, V., Markmann, K., Pedersen, C. N. S., Stougaard, J. & Andersen, S. U., 2012, I: Bioinformatics. 28, 20, s. 2698-2700 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • RNA 100%
  • RNA Sequencing 100%
  • RNA Sequence 50%
  • High Throughput Sequencing 50%
  20 Citationer (Scopus)

  301 Downloads (Pure)

• UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based DCJ

  Hilker, R., Sickinger, C., Pedersen, C. N. S. & Stoye, J., 2012, I: Bioinformatics. 28, 19, s. 2509-2511 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  34 Citationer (Scopus)
• 2011

  A sub-cubic time algorithm for computing the quartet distance between two general trees

  Nielsen, J., Kristensen, A. K., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 3 jun. 2011, I: Algorithms for Molecular Biology. 6, 15

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Time Complexity 100%
  • Quadratic Time 100%
  • Space Complexity 100%
  • Fast Algorithm 100%
  • Complexity Space 100%
  13 Citationer (Scopus)

  262 Downloads (Pure)

• GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution

  Simonsen, M., Thomsen, R., Christensen, M. H. & Pedersen, C. N. S., 2011, GECCO'11 Proceedings of the 13th annual conference on Genetic and evolutionary computation. Association for Computing Machinery, s. 1803-1810 8 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  • Docking (Molecular) 100%
  • Computer Model 33%
  12 Citationer (Scopus)

• Inference of Large Phylogenies Using Neighbour-Joining

  Simonsen, M., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 2011, I: Biomedical Engineering Systems and Technologies. 127, 5, s. 334-344 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Search Heuristic 100%
  • Desktop Computer 100%
  • Running Time 100%
  • Memory Consumption 50%
  • Memory Requirement 50%
  19 Citationer (Scopus)

• Molecular Docking with Ligand Attached Water Molecules

  Lie, M. A., Thomsen, R., Pedersen, C. N. S., Schiøtt, B. & Christensen, M. H., 2011, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 51, 4, s. 909-917 19 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  68 Citationer (Scopus)

• Rapid Computation of Distance Estimators from Nucleotide and Amino Acid Alignments

  Simonsen, M. & Pedersen, C. N. S., 2011, Proceedings of the 26th Annual ACM Symposium on Applied Computing. Association for Computing Machinery

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  7 Citationer (Scopus)

• Using Inverted Indices for Accelerating LINGO Calculations

  Kristensen, T. G., Nielsen, J. & Pedersen, C. N. S., 18 feb. 2011, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 51, 3, s. 597-600 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Similarity Matrix 100%
  • Inverted Index 100%
  • Fingerprint Data 50%
  15 Citationer (Scopus)
• 2010

  A tree-based method for the rapid screening of chemical fingerprints

  Kristensen, T. G., Nielsen, J. & Pedersen, C. N. S., 2010, I: Algorithms for Molecular Biology. 5, 9, 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Speed-up 100%
  • Data Structure 100%
  • Hierarchical Clustering 100%
  40 Citationer (Scopus)

• Building Very Large Neighbour-Joining Trees

  Simonsen, M., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 2010, BIOINFORMATICS 2010: Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics (part of the 3rd International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2010). Fred, A., Filipe, J. & Gamboa, H. (red.). Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication, s. 26 7 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Memory Requirement 100%
  • Running Time 100%
  • Branch and Bound 100%
  536 Downloads (Pure)

• Data Structures for Accelerating Tanimoto Queries on Real Valued Vectors

  Kristensen, T. G. & Pedersen, C. N. S., 2010, Algorithms in Bioinformatics: 10th International Workshop (WABI 2010). Moulton, V. & Singh, M. (red.). Springer, Bind 6293. s. 28-39 12 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  1 Citationer (Scopus)

• HMMlib: A C++ Library for General Hidden Markov Models Exploiting Modern CPUs

  Sand, A., Brask, A. T., Pedersen, C. N. S., Mailund, T. & Brask, A. T., 2010, 2010 Ninth International Workshop on Parallel and Distributed Methods in Verification and Second International Workshop on High Performance Computational Systems Biology. IEEE, s. 126 - 134 9 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  16 Citationer (Scopus)

• Using the Power of Modern Processors in Bioformatics

  Simonsen, M., Sand, A., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., jun. 2010. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  Fil
  227 Downloads (Pure)
• 2009

  A fast algorithm for genome wide haplotype pattern mining

  Besenbacher, S., Pedersen, C. S. & Mailund, T., 2009, I: B M C Bioinformatics. suppl. 1, s. 772 780 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  212 Downloads (Pure)

• A Quadratic Time Algorithm for Computing the Quartet Distance between Two General Trees

  Mailund, T., Nielsen, J. & Pedersen, C. S., 2009, Proceedings of IJCBS 2009. IEEE Computer Society Press, s. 565-568 4 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  • Complexity Space 100%
  • Fast Algorithm 100%

• A tree based method for the rapid screening of chemical fingerprints

  Kristensen, T. G., Nielsen, J. & Pedersen, C. N. S., 2009, I: Lecture Notes in Computer Science. 5724, s. 194-205 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  • Large Data Set 100%
  • Speed-up 100%
  • Data Structure 100%
  • Hierarchical Clustering 100%
  5 Citationer (Scopus)

• Automatic classification of P-Type ATPases using SLR

  Liboriussen, P., Pedersen, B. P., Ifrim, G., Nissen, P. & Pedersen, C. S., 2009.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Building very large neighbour-joining trees

  Simonsen, M., Mailund, T. & Pedersen, C. S., 2009.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Investigation of a simple heuristic improving the speed of statistical alignments

  Nielsen, J., Pedersen, C. S. & Hein, J., 2009.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Largest Common Chemical Feature Subtree as a Virtual Screening Method

  Kristensen, T. G., Pedersen, C. S., Thomsen, R. & Christensen, M. H., 2009. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  • Test Set 100%
  • Method Performs 100%
  • Performance Measure 100%
  • Tree 100%
  • Virtual Screening 100%

• Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution

  Pedersen, C. S. & Kristensen, T. G., 2009.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  • Evolution 100%
  • Ligand 100%
  • Data Base 50%

• Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution

  Kristensen, T. G. & Pedersen, C. S., 2009,  Proceedings of the 2009 International Joint conferences on Bioinformatics, System biology and Intelligent Computing (IJCBS2009). Zhang, J., Li, G.-Z. & Yang, J. Y. (red.). IEEE Computer Society Press, s. 331-334 4 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  • Structure (Composition) 100%
  • Chemical Structure 100%
  • Chemical Bonding 50%
  • Chemical Bond 50%
• 2008

  All-to-all RF Distance Methods

  Kristensen, T. G. & Pedersen, C. S., 2008.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Computing the all-pairs quartet distance on a set of evolutionary trees

  Stissing, M., Mailund, T., Pedersen, C. S., Brodal, G. S. & Fagerberg, R., 2008, I: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 6, 1, s. 37-50 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  296 Downloads (Pure)

• Rapid Neighbour-Joining

  Simonsen, M., Mailund, T. & Pedersen, C. S., 2008, Proceedings of the 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). s. 113-122

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1871 Downloads (Pure)

• Rapid neighbour-joining

  Simonsen, M., Mailund, T. & Pedersen, C. N. S., 28 nov. 2008, Algorithms in Bioinformatics - 8th International Workshop, WABI 2008, Proceedings. s. 113-122 10 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 5251 LNBI).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  • Search Strategies 100%
  • Optimization Criterion 50%
  105 Citationer (Scopus)