Carsten Suhr Jacobsen

2024

Total RNA analysis of the active microbiome on moving bed biofilm reactor carriers under incrementally increasing micropollutant concentrations

Martin, J. D., Tisler, S., Scheel, M., Svendsen, S., Anwar, M. Z., Zervas, A., Ekelund, F., Bester, K., Hansen, L. H., Jacobsen, C. S. & Ellegaard-Jensen, L., 1 sep. 2024, I: FEMS Microbiology Ecology. 100, 9, fiae098.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

2023

Abrupt permafrost thaw triggers activity of copiotrophs and microbiome predators

Scheel, M., Zervas, A., Rijkers, R., Tveit, A. T., Ekelund, F., Campuzano Jiménez, F., Christensen, T. R. & Jacobsen, C. S., nov. 2023, I: FEMS Microbiology Ecology. 99, 11, 12 s., fiad123.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

5 Citationer (Scopus)

Optimizing Total RNA sequencing for elucidation of the active microbial community of agricultural soil

Ellegaard-Jensen, L., Zervas, A., Anwar, M. Z. & Jacobsen, C. S., jun. 2023.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

Revealing the contributions of the belowground plant-root associated microbiome to soil aggregation in agricultural soils

Gil Martinez, M., Isobel Galen, E., Andersen, S., Faurholdt Jørgensen, E., Ellegaard-Jensen, L., Zervas, A., Jacobsen, C. S., Ekelund, F., Laursen, K. H. & Kjøller, R., maj 2023.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review

2022

Abrupt permafrost thaw triggers microbial bloom and increased activity of microbial predators

Scheel, M., Zervas, A., Tveit, A. T., Rijkers, R., Ekelund, F., Jacobsen, C. S. & Christensen, T. R., 9 aug. 2022, bioRxiv.

Publikation: Working paper/Preprint › Working paper › Forskning

Åben adgang

Diversity and Structure of Bacterial Communities in Different Rhizocompartments (Rhizoplane, Rhizosphere, and Bulk) at Flag Leaf Emergence in Four Winter Wheat Varieties

Zervas, A., Ellegaard-Jensen, L., Hennessy, R. C., Bak, F., Guan, Y., Horn Herms, C., Molina Zamudio, K. Y., Thybo Ganzhorn, D., Muller-Stover, D. S., Ahmad, J., Grunden, A., Jacobsen, C. S. & Nicolaisen, M. H., maj 2022, I: Microbiology Resource Announcements. 11, 5, 3 s., e00222-22.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

29 Downloads (Pure)

Enhanced fermentative lactic acid production from source-sorted organic household waste: Focusing on low-pH microbial adaptation and bio-augmentation strategy

Zhang, Z., Tsapekos, P., Alvarado-Morales, M., Zhu, X., Zervas, A., Jacobsen, C. S. & Angelidaki, I., feb. 2022, I: Science of the Total Environment. 808, 152129.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

17 Citationer (Scopus)

10 Downloads (Pure)

Erosion of ancient Arctic permafrost: transcriptomics reveal microbiome changes

Scheel, M., Zervas, A., Jacobsen, C. S. & Christensen, T. R., 2022.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Formidling

Ex-situ biogas upgrading in thermophilic trickle bed reactors packed with micro-porous packing materials

Ghofrani-Isfahani, P., Tsapekos, P., Peprah, M., Kougias, P., Zervas, A., Zhu, X., Yang, Z., Jacobsen, C. S. & Angelidaki, I., jun. 2022, I: Chemosphere. 296, 133987.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

26 Citationer (Scopus)

30 Downloads (Pure)

Heat Shock Response of the Active Microbiome From Perennial Cave Ice

Mondini, A., Anwar, M. Z., Ellegaard-Jensen, L., Lavin, P., Jacobsen, C. S. & Purcarea, C., mar. 2022, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 809076.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

3 Citationer (Scopus)

Hvorfor bliver Indlandsisen sort?

Anesio, A. M. & Jacobsen, C. S., 2022, I: Videnskab.dk.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Bidrag til avis - Avisartikel

Åben adgang

Microbial Community Changes in 26,500-Year-Old Thawing Permafrost

Scheel, M., Zervas, A., Jacobsen, C. S. & Christensen, T. R., mar. 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 14 s., 787146.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

15 Citationer (Scopus)

Microbial Diversity in Four Rhizocompartments (Bulk Soil, Rhizosphere, Rhizoplane, and Endosphere) of Four Winter Wheat Varieties at the Fully Emerged Flag Leaf Growth Stage

Ahmad, J., Zervas, A., Ellegaard-Jensen, L., Hennessy, R. C., Carbone, I., Cornish, V., Müller-Stöver, D. S., Grunden, A., Jacobsen, C. S. & Nicolaisen, M. H., nov. 2022, I: Microbiology Resource Announcements. 11, 11, 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

1 Citationer (Scopus)

23 Downloads (Pure)

Should I grow or should I go? Transcriptomic responses of permafrost soil microbiomes to sudden thaw and erosion

Scheel, M., Zervas, A., Jacobsen, C. S. & Christensen, T. R., maj 2022.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Formidling

Åben adgang

2021

Application of wood ash leads to strong vertical gradients in soil pH changing prokaryotic community structure in forest top soil

Bang-Andreasen, T., Peltre, M., Ellegaard-Jensen, L., Hansen, L. H., Ingerslev, M., Rønn, R., Jacobsen, C. S. & Kjøller, R., jan. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 10 s., 742.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

21 Citationer (Scopus)

Bacteria respond stronger than fungi across a steep wood-ash driven pH gradient

Cruz-Paredes, C., Bang-Andreasen, T., Christensen, S., Ekelund, F., Frøslev, T. G., Jacobsen, C. S., Johansen, J. L., Mortensen, L. H., Rønn, R., Madsen, M. V. & Kjøller, R., 2021, I: Frontiers in Forests and Global Change. 4, 10 s., 781844.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

11 Citationer (Scopus)

46 Downloads (Pure)

Besparelser rammer grøn forskning på Aarhus Universitet: Er politikerne overhovedet klar over konsekvenserne?

Olesen, J. E., Ingvartsen, K. L., Williams, M. H., Hertel, O., Jacobsen, C. S., Lund, M. S., Bach, H. & Halberg, N., 16 mar. 2021, I: Altinget.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Bidrag til avis - Avisartikel

Åben adgang

Comprehensive evaluation of different strategies to recover methanogenic performance in ammonia-stressed reactors

Yan, M., Zhu, X., Treu, L., Ravenni, G., Campanaro, S., Goonesekera, E. M., Ferrigno, R., Jacobsen, C. S., Zervas, A., Angelidaki, I. & Fotidis, I. A., sep. 2021, I: Bioresource Technology. 336, 125329.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

28 Citationer (Scopus)

68 Downloads (Pure)

Ex-situ biogas upgrading in thermophilic up-flow reactors: The effect of different gas diffusers and gas retention times

Ghofrani-Isfahani, P., Tsapekos, P., Peprah, M., Kougias, P., Zhu, X., Kovalovszki, A., Zervas, A., Zha, X., Jacobsen, C. S. & Angelidaki, I., nov. 2021, I: Bioresource Technology. 340, 125694.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

26 Citationer (Scopus)

26 Downloads (Pure)

Influence of Spatial Scale on Structure of Soil Bacterial Communities across an Arctic Landscape

Malard, L. A., Anwar, M. Z., Jacobsen, C. S. & Pearce, D. A., mar. 2021, I: Applied and Environmental Microbiology. 87, 5, s. 1-16 16 s., e02220-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

8 Citationer (Scopus)

28 Downloads (Pure)

Investigating the Wheat Interactome

Aggerbeck, M. R., Tang, C., Zervas, A., Salvato, F., Morena Fernandez, J., Baars, O., Kleiner, M., Hansen, M., Johansen, A., Ellegaard-Jensen, L., Hansen, L. H. & Jacobsen, C. S., 11 nov. 2021.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Microbial comparative transcriptomics in abruptly thawing Greenlandic permafrost

Scheel, M., Zervas, A., Jacobsen, C. S. & Christensen, T. R., dec. 2021.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Formidling

2020

A comparison of the fate of diflufenican in agricultural sandy soil and gravel used in urban areas

Svendsen, S. B., Carvalho, P. N., Bollmann, U. E., Ellegaard-Jensen, L., Albers, C. N., Strobel, B. W., Jacobsen, C. S. & Bester, K., 1 maj 2020, I: Science of the Total Environment. 715, 136803.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

7 Citationer (Scopus)

Complete Genome and Plasmid Sequences of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Enteritidis PT1, Obtained from the Salmonella Reference Laboratory at Public Health England, Colindale, United Kingdom

Anwar, M. Z., Zervas, A., Hansen, L. H., Barker, G., Anesio, A. M. & Jacobsen, C. S., 2020, I: Microbiology Resource Announcements. 9, 2, 2 s., e01064.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

2 Citationer (Scopus)

84 Downloads (Pure)

Glacial microbiota are hydrologically connected and temporally variable

Cameron, K. A., Müller, O., Stibal, M., Edwards, A. & Jacobsen, C. S., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 8, s. 3172-3187 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

15 Citationer (Scopus)

43 Downloads (Pure)

Leaching of herbicidal residues from gravel surfaces – A lysimeter-based study comparing gravels with agricultural topsoil

Albers, C. N., Jacobsen, O. S., Bester, K., Jacobsen, C. S. & Carvalho, P. N., nov. 2020, I: Environmental Pollution. 266, 3, 115225.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

6 Citationer (Scopus)

Low Turnover of Soil Bacterial rRNA at Low Temperatures

Schostag, M. D., Albers, C. N., Jacobsen, C. S. & Priemé, A., maj 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 962.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

14 Citationer (Scopus)

Microbial life in collapsing permafrost in NE Greenland

Scheel, M., Christensen, T. R., Rundgren, M., Jacobsen, C. S. & Zervas, A., maj 2020.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Formidling

Åben adgang

Total RNA sequencing reveals multilevel microbial community changes and functional responses to wood ash application in agricultural and forest soil

Bang-Andreasen, T., Anwar, M. Z., Lanzén, A., Kjøller, R., Rønn, R., Ekelund, F. & Jacobsen, C. S., 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 3, 13 s., fiaa016.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

37 Citationer (Scopus)

44 Downloads (Pure)

2019

Bacterial and protozoan dynamics upon thawing and freezing of an active layer permafrost soil

Schostag, M., Priemé, A., Jacquiod, S., Russel, J., Ekelund, F. & Jacobsen, C. S., 2019, I: ISME Journal. 13, 5, s. 1345-1359 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

55 Citationer (Scopus)

Biogeographical patterns in soil bacterial communities across the Arctic region

Malard, L. A., Anwar, M. Z., Jacobsen, C. S. & Pearce, D. A., 2019, 1 s.

Publikation: Working paper/Preprint › Preprint

Åben adgang

Biogeographical patterns in soil bacterial communities across the Arctic region

Malard, L. A., Anwar, M. Z., Jacobsen, C. S. & Pearce, D. A., sep. 2019, I: FEMS Microbiology Ecology. 95, 9, fiz128.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

59 Citationer (Scopus)

92 Downloads (Pure)

Comparative Metatranscriptomics Workflow (CoMW)

Anwar, M. Z. (Udvikler), Lanzen, A. (Udvikler), Bang-Andreasen, T. (Andet) & Jacobsen, C. S. (Andet), maj 2019

Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning › peer review

Åben adgang

NoNewBAM: diflufenican degradation and potential leaching

Carvalho, P. N., Svendsen, S. B., Albers, C. N., Jacobsen, O. S., Bester, K. & Jacobsen, C. S., 31 jan. 2019.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review

Quantitative and qualitative evaluation of the impact of the G2 enhancer, bead sizes and lysing tubes on the bacterial community composition during DNA extraction from recalcitrant soil core samples based on community sequencing and qPCR

Gobbi, A., Santini, R. G., Filippi, E., Ellegaard-Jensen, L., Jacobsen, C. S. & Hansen, L. H., apr. 2019, I: PLOS ONE. 14, 4, 17 s., e0200979.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

25 Citationer (Scopus)

Sorption and degradation of diflufenican in the urban environment

Svendsen, S. B., Carvalho, P. N., Bollmann, U. E., Ellegaard-Jensen, L., Albers, C. N., Strobel, B. W., Jacobsen, C. S. & Bester, K., 2019.

Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review

To assemble or not to resemble: A validated Comparative Metatranscriptomics Workflow (CoMW)

Anwar, M. Z., Lanzen, A., Bang-Andreasen, T. & Jacobsen, C. S., 2019, s. 1-10, 10 s.

Publikation: Working paper/Preprint › Working paper › Forskning

Åben adgang

25 Citationer (Scopus)

To assemble or not to resemble-A validated Comparative Metatranscriptomics Workflow (CoMW)

Anwar, M. Z., Lanzen, A., Bang-Andreasen, T. & Jacobsen, C. S., 1 aug. 2019, I: GigaScience. 8, 8, s. 1-10 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Total RNA Protocol (extraction, quantification and Illumina library preparation)

Mondini, A., Schostag, M. D., Ellegaard-Jensen, L., Bang-Andreasen, T., Anwar, M. Z., Purcarea, C. & Jacobsen, C. S., 10 jul. 2019, 26 s. protocols.io.

Publikation: Andet › Udgivelser på nettet - Net-publikation › Forskning

Åben adgang

Total RNA-sequencing reveals multi-level microbial community changes and functional responses to wood ash application in agricultural and forest soil

Bang-Andreasen, T., Anwar, M. Z., Lanen, A., Kjøller, R., Rønn, R., Ekelund, F. & Jacobsen, C. S., 2019, bioRxiv.

Publikation: Working paper/Preprint › Working paper › Forskning

Åben adgang

Transcriptomic responses to warming and cooling of an Arctic tundra soil microbiome

Schostag, M. D., Anwar, M. Z., Jacobsen, C. S., Larose, C., Vogel, T. M., Maccario, L., Jacquiod, S., Faucherre, S. & Priemé, A., 2019.

Publikation: Working paper/Preprint › Preprint

Åben adgang

2018

Benchmarking and Standardizing Comparative Metatranscriptomics Workflow

Anwar, M. Z. & Jacobsen, C. S., nov. 2018.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Cd toxicity in Ash amended to plantations; the dilemma of different answers at different levels of description. European Geosciences Union General Assembly 2018

Christensen, S., Ekelund, F., Kjøller, R., Vestergård, M., Johansen, J., Mortensen, L. H., Paredes, C. C., Andreasen, T., Ingerslev, M., Hansen, M., Krogh, P. H., Qin, J., Hovmand, M. F., Skov, S., Maresca, A., Astrup, T. F., Jacobsen, C. S., Findsen, D. E., Kindtler, N. L. & Nielsen, M. L., 20 feb. 2018.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

Editorial: Polar and Alpine Microbiology

Stibal, M., Jacobsen, C. S. & Haggblom, M. M., sep. 2018, I: FEMS Microbiology Ecology. 94, 9, 3 s., 136.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Leder › peer review

2 Citationer (Scopus)

Emissions of biogenic volatile organic compounds from arctic shrub litter are coupled with changes in the bacterial community composition

Svendsen, S. H., Prieme, A., Voriskova, J., Kramshoj, M., Schostag, M., Jacobsen, C. S. & Rinnan, R., maj 2018, I: Soil Biology & Biochemistry. 120, s. 80-90 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

25 Citationer (Scopus)

Inhibition of anaerobic digestion processes: Applications of molecular tools

Amha, Y. M., Anwar, M. Z., Brower, A., Jacobsen, C. S., Stadler, L. B., Webster, T. M. & Smith, A. L., 1 jan. 2018, I: Bioresource Technology. 247, s. 999-1014 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Review › Forskning › peer review

116 Citationer (Scopus)

Inter-laboratory testing of the effect of DNA blocking reagent G2 on DNA extraction from low-biomass clay samples

Jacobsen, C. S., Nielsen, T. K., Vester, J. K., Stougaard, P., Nielsen, J. L., Voriskova, J., Winding, A., Baldrian, P., Liu, B., Frostegard, A., Pedersen, D., Tveit, A. T., Svenning, M. M., Tebbe, C. C., Ovreas, L., Jakobsen, P. B., Blazewicz, S. J., Hubablek, V., Bertilsson, S. & Hansen, L. H. & 4 flere, Cary, S. C., Holben, W. E., Ekelund, F. & Baelum, J., 9 apr. 2018, I: Scientific Reports. 8, 1, 6 s., 5711.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

Fil

7 Citationer (Scopus)

129 Downloads (Pure)

NoNewBAM – er jordherbicidet diflufenican en trussel for grundvandet ved anvendelse på udyrkede urbane arealer?

Jacobsen, C. S., 2018, Nyt om pesticider - undersøgelser og afværge . ATV Jord og Grundvand

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning

Åben adgang

Standardized and Validated Workflow for Comparative Metatranscriptomics

Anwar, M. Z., Lanzen, A., Bang-Andreasen, T. & Jacobsen, C. S., sep. 2018.

Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

2017

Conservative tracer bromide inhibits pesticide mineralisation in soil

Bech, T. B., Rosenbom, A. E., Sorensen, S. R. & Jacobsen, C. S., mar. 2017, I: Environmental Pollution. 222, s. 404-411 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

8 Citationer (Scopus)

Carsten Suhr Jacobsen

Publikation

Søgeresultater