Dreams : deep read-level error model for sequencing data applied to low-frequency variant calling and circulating tumor DNA detection. / Christensen, Mikkel H; Drue, Simon O; Rasmussen, Mads H et al.
I: Genome Biology, Bind 24, Nr. 1, 30.04.2023, s. 99.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The impact of two decades of multidisciplinary efforts to reduce the risk of recurrence from colorectal cancer - a Danish population-based registry-study : 4206/7. / Nors, Jesper Berg; Gotschalck, Kåre Andersson; Erichsen, Rune et al.
2023. Poster session præsenteret ved AACR Annual Meeting 2023, Orlando, Florida, USA.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
MSIMEP : Predicting microsatellite instability from microarray DNA methylation tumor profiles. / Santamarina-García, Martín; Brea-Iglesias, Jenifer; Bramsen, Jesper Bertram et al.
I: iScience, Bind 26, Nr. 3, 106127, 03.2023.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Impact of Whole Genome Doubling on Detection of Circulating Tumor DNA in Colorectal Cancer. / Kabel, Jonas; Henriksen, Tenna Vesterman; Demuth, Christina et al.
I: Cancers, Bind 15, Nr. 4, 1136, 02.2023.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The impact of two decades of multidisciplinary efforts to reduce the risk of recurrence from non-metastatic colorectal cancer - a Danish population-wide registry-study. / Nors, Jesper Berg; Gotschalck, Kåre Andersson; Erichsen, Rune et al.
2023. Poster session præsenteret ved PhD Day 2023, Aarhus.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
Identifying Recurrences Among Non-Metastatic Colorectal Cancer Patients Using National Health Data Registries : Validation and Optimization of a Registry-Based Algorithm in a Modern Danish Cohort. / Nors, Jesper; Mattesen, Trine Block; Cronin-Fenton, Deirdre et al.
I: Clinical epidemiology, Bind 15, 2023, s. 241-250.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
ASO Author Reflections : Is ctDNA Detection an Accurate Measure of the Risk of Recurrence in Patients Undergoing Neoadjuvant Treatment? / Gögenur, Mikail; Lindbjerg Andersen, Claus; Gögenur, Ismail.
I: Annals of Surgical Oncology, Bind 29, Nr. 13, 12.2022, s. 8675.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
ASO Visual Abstract : ctDNA for Recurrence Risk Assessment in Patients Treated with Neoadjuvant Treatment - A Systematic Review and Meta-analysis. / Gögenur, Mikail; Hadi, Noor Al-Huda; Qvortrup, Camilla et al.
I: Annals of Surgical Oncology, Bind 29, Nr. 13, 8676, 12.2022.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Transposon-activated POU5F1B promotes colorectal cancer growth and metastasis. / Simó-Riudalbas, Laia; Offner, Sandra; Planet, Evarist et al.
I: Nature Communications, Bind 13, Nr. 1, 4913, 12.2022.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
ctDNA for Risk of Recurrence Assessment in Patients Treated with Neoadjuvant Treatment : A Systematic Review and Meta-analysis. / Gögenur, Mikail; Hadi, Noor Al-Huda; Qvortrup, Camilla et al.
I: Annals of Surgical Oncology, Bind 29, Nr. 13, 12.2022, s. 8666-8674.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Personalized circulating tumor DNA in patients with hepatocellular carcinoma : a pilot study. / Pommergaard, H C; Yde, Christina Westmose; Ahlborn, L B et al.
I: Molecular Biology Reports, Bind 49, Nr. 2, 11.2022, s. 1609-1616.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Letter › peer review
Comparing single-target and multitarget approaches for postoperative circulating tumour DNA detection in stage II-III colorectal cancer patients. / Henriksen, Tenna Vesterman; Reinert, Thomas; Rasmussen, Mads Heilskov et al.
I: Molecular Oncology, Bind 16, Nr. 20, 10.2022, s. 3654-3665.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
ctDNA-guided adjuvant chemotherapy for colorectal cancer-ready for prime time? / Andersen, Claus L; Heitzer, Ellen.
I: Cancer Cell, Bind 40, Nr. 9, 09.2022, s. 911-913.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
Unsupervised detection of fragment length signatures of circulating tumor DNA using non-negative matrix factorization. / Renaud, Gabriel; Nørgaard, Maibritt; Lindberg, Johan et al.
I: eLife, Bind 11, e71569, 07.2022.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Error Characterization and Statistical Modeling Improves Circulating Tumor DNA Detection by Droplet Digital PCR. / Henriksen, Tenna V; Drue, Simon O; Frydendahl, Amanda et al.
I: Clinical Chemistry, Bind 68, Nr. 5, 05.2022, s. 657-667.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Tumour-agnostic circulating tumour DNA analysis for improved recurrence surveillance after resection of colorectal liver metastases : A prospective cohort study. / Øgaard, Nadia; Reinert, Thomas; Henriksen, Tenna V. et al.
I: European Journal of Cancer, Bind 163, 03.2022, s. 163-176.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Circulating Tumor DNA in Stage III Colorectal Cancer, beyond Minimal Residual Disease Detection, toward Assessment of Adjuvant Therapy Efficacy and Clinical Behavior of Recurrences. / Henriksen, Tenna Vesterman; Tarazona, Noelia; Frydendahl, Amanda et al.
I: Clinical Cancer Research, Bind 28, Nr. 3, 02.2022, s. 507-517.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Circulating tumor DNA for prognosis assessment and postoperative management after curative-intent resection of colorectal liver metastases. / Reinert, Thomas; Petersen, Lena Marie Skindhøj; Henriksen, Tenna Vesterman et al.
I: International Journal of Cancer, Bind 150, Nr. 9, 07.01.2022, s. 1537-1548.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Cirkulerende tumor-DNA ved behandling af kræft. / Iden, Cecilie Riis; Johansen, Amanda Frydendahl Boll; Øgaard, Nadia et al.
I: Ugeskrift for Læger, Bind 183, Nr. 2, V02210154, 01.2022.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Detection and characterization of lung cancer using cell-free DNA fragmentomes. / Mathios, Dimitrios; Johansen, Jakob Sidenius; Cristiano, Stephen et al.
I: Nature Communications, Bind 12, 5060, 12.2021.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
MethCORR infers gene expression from DNA methylation and allows molecular analysis of ten common cancer types using fresh-frozen and formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples. / Mattesen, Trine B.; Andersen, Claus L.; Bramsen, Jesper B.
I: Clinical Epigenetics, Bind 13, 20, 12.2021.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Plasma-only ctDNA-guided MRD detection in patients with CRC : letter. / Reinert, Thomas; Henriksen, Tenna V.; Aleshin, Alexey et al.
I: Clinical Cancer Research, Bind 27, Nr. 23, 12.2021, s. 6613.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
Fear of cancer recurrence and quality of life in a ctDNA based surveillance program following curative intended treatment of colorectal cancer – a substudy of IMPROVE-IT2. / Nors, Jesper Berg; Juul, Therese; Gotschalck, Kåre Andersson et al.
2021. Poster session præsenteret ved DCCC ctDNA årsmøde 2021.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Complete pathological and serological response to immunotherapy in a patient with MMR-deficient early rectal cancer. / Tarpgaard, L. S.; Andersen, P. V.; Øgaard, N. et al.
I: Annals of Oncology, Bind 32, Nr. 6, 06.2021, s. 805-806.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
Age-stratified reference intervals unlock the clinical potential of circulating cell-free DNA as a biomarker of poor outcome for healthy individuals and patients with colorectal cancer. / Ørntoft, Mai-Britt Worm; Jensen, Sarah Østrup; Øgaard, Nadia et al.
I: International Journal of Cancer, Bind 148, Nr. 7, 04.2021, s. 1665-1675.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
MethCORR modelling of methylomes from formalin-fixed paraffin-embedded tissue enables characterization and prognostication of colorectal cancer. / Mattesen, Trine B.; Rasmussen, Mads H.; Sandoval, Juan et al.
I: Nature Communications, Bind 11, 2025, 12.2020.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Development of blood-based biomarker tests for early detection of colorectal neoplasia : Influence of blood collection timing and handling procedures. / Lech Pedersen, Niels; Mertz Petersen, Mathias; Ladd, Jon J. et al.
I: Clinica Chimica Acta, Bind 507, 08.2020, s. 39-53.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
IMPROVE-IT2 : implementing noninvasive circulating tumor DNA analysis to optimize the operative and postoperative treatment for patients with colorectal cancer - intervention trial 2. Study protocol. / Nors, Jesper; Henriksen, Tenna Vesterman; Gotschalck, Kåre Andersson et al.
I: Acta Oncologica, Bind 59, Nr. 3, 03.2020, s. 336-341.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning › peer review
Enhanced Performance of DNA Methylation Markers by Simultaneous Measurement of Sense and Antisense DNA Strands after Cytosine Conversion. / Jensen, Sarah Østrup; Øgaard, Nadia; Nielsen, Hans Jørgen et al.
I: Clinical Chemistry, Bind 66, Nr. 7, 2020, s. 925-933.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The effect of surgical trauma on circulating free DNA levels in cancer patients - implications for studies of circulating tumor DNA. / Henriksen, Tenna V; Reinert, Thomas; Christensen, Emil et al.
I: Molecular Oncology, Bind 14, Nr. 8, 2020, s. 1670-1679.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Transcriptomic and proteomic intra-tumor heterogeneity of colorectal cancer varies depending on tumor location within the colorectum. / Árnadóttir, Sigrid Salling; Mattesen, Trine Block; Vang, Søren et al.
I: PLOS ONE, Bind 15, Nr. 12, e0241148, 2020.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Gel-based proteomics of clinical samples identifies potential serological biomarkers for early detection of colorectal cancer. / Thorsen, Stine B.; Gromova, Irina; Christensen, Ib J. et al.
I: International Journal of Molecular Sciences , Bind 20, Nr. 23, 6082, 12.2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
IMPROVE-IT2: Implementing non-invasive circulating tumor DNA analysis to optimize the operative and postoperative treatment for patients with colorectal cancer – Intervention Trial 2. Study protocol. / Nors, Jesper Berg; Henriksen, Tenna Vesterman; Gotschalck, Kåre Andersson et al.
2019. Poster session præsenteret ved Randers Forskningssymposium 2019, Randers, Danmark.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Validation of computational determination of microsatellite status using whole exome sequencing data from colorectal cancer patients. / Johansen, Amanda Frydendahl Boll; Kassentoft, Christine Gaasdal; Knudsen, Michael et al.
I: BMC Cancer, Bind 19, Nr. 1, 971, 21.10.2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Correlation between early dynamics in circulating tumour DNA and outcome from FOLFIRI treatment in metastatic colorectal cancer. / Lyskjær, Iben; Kronborg, Camilla Skovhus; Rasmussen, Mads Heilskov et al.
I: Scientific Reports, Bind 9, Nr. 1, 11542, 08.08.2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Analysis of Plasma Cell-Free DNA by Ultradeep Sequencing in Patients With Stages I to III Colorectal Cancer. / Reinert, Thomas; Henriksen, Tenna Vesterman; Christensen, Emil et al.
I: JAMA Oncology, Bind 5, Nr. 8, 01.08.2019, s. 1124-1131.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Early Detection of Metastatic Relapse and Monitoring of Therapeutic Efficacy by Ultra-Deep Sequencing of Plasma Cell-Free DNA in Patients With Urothelial Bladder Carcinoma. / Christensen, Emil; Birkenkamp-Demtröder, Karin; Sethi, Himanshu et al.
I: Journal of Clinical Oncology, Bind 37, Nr. 18, 06.2019, s. 1547-1557.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with cancer. / Cristiano, Stephen; Leal, Alessandro; Phallen, Jillian et al.
I: Nature, Bind 570, Nr. 7761, 06.2019, s. 385-389.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Letter › peer review
DAPK1 loss triggers tumor invasion in colorectal tumor cells. / Steinmann, Sara; Kunze, Philipp; Hampel, Chuanpit et al.
I: Cell Death and Disease, Bind 10, Nr. 12, 895, 2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Novel DNA methylation biomarkers show high sensitivity and specificity for blood-based detection of colorectal cancer- A clinical biomarker discovery and validation study. / Jensen, Sarah Østrup; Øgaard, Nadia; Ørntoft, Mai Britt Worm et al.
I: Clinical Epigenetics, Bind 11, Nr. 1, 158, 2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Triage for selection to colonoscopy? / Mertz-Petersen, Mathias; Piper, Thomas B; Kleif, Jakob et al.
I: European Journal of Surgical Oncology, Bind 44, Nr. 10, 10.2018, s. 1539-1541.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer. / Palin, Kimmo; Pitkänen, Esa; Turunen, Mikko et al.
I: Nature Communications, Bind 9, 3664, 10.09.2018.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Characterization of genetic intratumor heterogeneity in colorectal cancer and matching patient-derived spheroid cultures. / Árnadóttir, Sigrid S; Jeppesen, Maria; Lamy, Philippe et al.
I: Molecular Oncology, Bind 12, Nr. 1, 2018, s. 132–147.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
A genetically inducible porcine model of intestinal cancer. / Callesen, Morten Møbjerg; Árnadóttir, Sigrid Salling; Lyskjær, Iben et al.
I: Molecular Oncology, Bind 11, Nr. 11, 11.2017, s. 1616-1629.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Clinical implications of monitoring circulating tumor DNA in patients with colorectal cancer. / Schøler, Lone V; Reinert, Thomas; Ørntoft, Mai-Britt W et al.
I: Clinical Cancer Research, Bind 23, Nr. 18, 09.2017, s. 5437-5445.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Direct detection of early-stage cancers using circulating tumor DNA. / Phallen, Jillian; Sausen, Mark; Adleff, Vilmos et al.
I: Science Translational Medicine, Bind 9, Nr. 403, 16.08.2017.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
An Optimized Shotgun Strategy for the Rapid Generation of Comprehensive Human Proteomes. / Bekker-Jensen, Dorte B; Kelstrup, Christian D; Batth, Tanveer S et al.
I: Cell Systems, Bind 4, Nr. 6, 28.06.2017, s. 587-599.e4.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Molecular-Subtype-Specific Biomarkers Improve Prediction of Prognosis in Colorectal Cancer. / Bramsen, Jesper Bertram; Rasmussen, Mads Heilskov; Ongen, Halit et al.
I: Cell Reports, Bind 19, Nr. 6, 09.05.2017, s. 1268-1280.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The non-coding variant rs1800734 enhances DCLK3 expression through long-range interaction and promotes colorectal cancer progression. / Liu, Ning Qing; Ter Huurne, Menno; Nguyen, Luan N et al.
I: Nature Communications, Bind 8, 14.02.2017, s. 14418.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Comparative analysis of 12 different kits for bisulfite conversion of circulating cell-free DNA. / Ørntoft, Mai-Britt Worm; Jensen, Sarah Østrup; Hansen, Thomas Birkballe et al.
I: Epigenetics, Bind 12, Nr. 8, 2017, s. 626-636.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
SNHG5 promotes colorectal cancer cell survival by counteracting STAU1-mediated mRNA destabilization. / Damas, Nkerorema Djodji; Marcatti, Michela; Côme, Christophe et al.
I: Nature Communications, Bind 7, 22.12.2016, s. 13875.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Putting a brake on stress signaling - miR-625-3p as a biomarker for choice of therapy in colorectal cancer. / Lyskjær, Iben; Rasmussen, Mads H; Andersen, Claus L.
I: Epigenomics, Bind 8, Nr. 11, 25.10.2016, s. 1449-1452.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Kommentar/debat/letter to the editor › Forskning
miRNA profiling of circulating EpCAM(+) extracellular vesicles: promising biomarkers of colorectal cancer. / Ostenfeld, Marie Stampe; Jensen, Steffen Grann; Jeppesen, Dennis Kjølhede et al.
I: Journal of Extracellular Vesicles, Bind 5, 29.08.2016, s. 31488.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
miR-625-3p regulates oxaliplatin resistance by targeting MAP2K6-p38 signalling in human colorectal adenocarcinoma cells. / Rasmussen, Mads Heilskov; Lyskjær, Iben; Jersie-Christensen, Rosa Rakownikow et al.
I: Nature Communications, Bind 7, 16.08.2016.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
SNHG16 is regulated by the Wnt pathway in colorectal cancer and affects genes involved in lipid metabolism. / Christensen, Lise-Lotte; True, Kirsten Kallesøe; Hamilton, M.P. et al.
I: Molecular Oncology, Bind 10, Nr. 8, 26.06.2016, s. 1266-1282.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Inducible colorectal cancer in a genetic porcine model. / Callesen, Morten Møbjerg; Árnadóttir, Sigrid Salling; Jakobsen, Jannik E. et al.
I: Transgenic Research, Bind 25, Nr. 2, 01.04.2016, s. 225.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review
Analysis of circulating tumour DNA to monitor disease burden following colorectal cancer surgery. / Reinert, Thomas; Schøler, Lone Vedel; Thomsen, Rune et al.
I: Gut, Bind 65, Nr. 4, 2016.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Performance of the colorectal cancer screening marker Sept9 is influenced by age, diabetes and arthritis: a nested case-control study. / Ørntoft, Mai-Britt Worm; Nielsen, Hans Jørgen; Ørntoft, Torben Falck et al.
I: BMC Cancer, Bind 15/819, 29.10.2015, s. 1-10.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
3'-UTR poly(T/U) repeat of EWSR1 is altered in microsatellite unstable colorectal cancer with nearly perfect sensitivity. / Kondelin, Johanna; Tuupanen, Sari; Gylfe, Alexandra E et al.
I: Familial Cancer, Bind 14, Nr. 3, 09.2015, s. 449-53.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Establishment and characterization of models of chemotherapy resistance in colorectal cancer : Towards a predictive signature of chemoresistance. / Jensen, Niels F; Stenvang, Jan; Beck, Mette K et al.
I: Molecular Oncology, Bind 9, Nr. 6, 06.2015, s. 1169-85.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The potential role of Alu Y in the development of resistance to SN38 (Irinotecan) or oxaliplatin in colorectal cancer. / Lin, Xue; Stenvang, Jan; Rasmussen, Mads Heilskov et al.
I: B M C Genomics, Bind 16, 2015, s. 404.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Determinants of recurrence after intended curative resection for colorectal cancer. / Wilhelmsen, Michael; Kring, Thomas; Jorgensen, Lars N et al.
I: Scandinavian Journal of Gastroenterology, Bind 49, Nr. 12, 12.2014, s. 1399-408.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
A dual program for translation regulation in cellular proliferation and differentiation. / Gingold, Hila; Tehler, Disa; Christoffersen, Nanna R et al.
I: Cell, Bind 158, Nr. 6, 11.09.2014, s. 1281-92.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Identification of 33 candidate oncogenes by screening for base-specific mutations. / Tuupanen, S; Hänninen, U A; Kondelin, J et al.
I: B J C, 12.08.2014, s. 1657-1662.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Putative cis-regulatory drivers in colorectal cancer. / Ongen, Halit; Andersen, Claus Lindbjerg; Bramsen, Jesper B et al.
I: Nature, Bind 512, Nr. 7512, 07.08.2014, s. 87-90.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Next-generation sequencing of RNA and DNA isolated from paired fresh-frozen and formalin-fixed paraffin-embedded samples of human cancer and normal tissue. / Hedegaard, Jakob; Thorsen, Kasper; Lund, Mette Katrine et al.
I: PLOS ONE, Bind 9, Nr. 5, 30.05.2014, s. e98187.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Mnk2 alternative splicing modulates the p38-MAPK pathway and impacts Ras-induced transformation. / Maimon, Avraham; Mogilevsky, Maxim; Shilo, Asaf et al.
I: Cell Reports, Bind 7, Nr. 2, 24.04.2014, s. 501-13.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
A DERL3-associated defect in the degradation of SLC2A1 mediates the Warburg effect. / Lopez-Serra, Paula; Marcilla, Miguel; Villanueva, Alberto et al.
I: Nature Communications, Bind 5, 3608, 03.04.2014.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Metoder til screening for kolorektal cancer kan forbedres. / Rasmussen, Louise; Jørgensen, Lars Nannestad; Madsen, Mogens Rørbæk et al.
I: Ugeskrift for Laeger, Bind 176, Nr. 11B, 10.03.2014.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Functional screening identifies miRNAs influencing apoptosis and proliferation in colorectal cancer. / Christensen, Lise Lotte; Holm, Anja; Rantala, Juha et al.
I: PLOS ONE, Bind 9, Nr. 6, 2014, s. e96767.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The DNA damage checkpoint precedes activation of ARF in response to escalating oncogenic stress during tumorigenesis. / Evangelou, K; Bartkova, J; Kotsinas, A et al.
I: Cell Death and Differentiation, Bind 20, Nr. 11, 11.2013, s. 1485-97.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
MiRNA-362-3p induces cell cycle arrest through targeting of E2F1, USF2 and PTPN1 and is associated with recurrence of colorectal cancer. / Christensen, Lise Lotte; Tobiasen, Heidi; Holm, Anja et al.
I: International Journal of Cancer, Bind 133, Nr. 1, 07.2013, s. 67-78.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
High expression of microRNA-625-3p is associated with poor response to first-line oxaliplatin based treatment of metastatic colorectal cancer. / Rasmussen, Mads Heilskov; Jensen, Niels; Tarpgaard, Line Schmidt et al.
I: Molecular Oncology, Bind 7, Nr. 3, 06.2013, s. 637-646.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The splicing factor SRSF6 is amplified and is an oncoprotein in lung and colon cancers. / Cohen-Eliav, Michal; Golan-Gerstl, Regina; Siegfried, Zahava et al.
I: Journal of Pathology, Bind 229, Nr. 4, 03.2013, s. 630-639.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Circulating U2 small nuclear RNA fragments as a novel diagnostic biomarker for pancreatic and colorectal adenocarcinoma. / Baraniskin, Alexander; Nöpel-Dünnebacke, Stefanie; Ahrens, Maike et al.
I: International Journal of Cancer, Bind 132, Nr. 2, 01.2013, s. E48-57.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Functional screening identifies miRNAs that induce apoptosis and/or inhibit proliferation in colorectal cancer. / Christensen, Lise Lotte; Holm, Anja; Schepeler, Troels et al.
2013. Poster session præsenteret ved Keystone Symposium, Vancouver, Canada.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
Attenuation of the beta-catenin/TCF4 complex in colorectal cancer cells induces several growth-suppressive microRNAs that target cancer promoting genes. / Schepeler, Troels; Holm, Anja; Halvey, P et al.
I: Oncogene, 31.05.2012, s. 2750-2760.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Are CIMP and chr16p13.2 copy number status independent prognostic markers in stage II and III colorectal cancer? / Andersen, Claus Lindbjerg; Lamy, Philippe; Orntoft, Torben Falck.
I: International Journal of Cancer, Bind 130, Nr. 1, 01.01.2012, s. 243.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Long-range epigenetic silencing of chromosome 5q31 protocadherins is involved in early and late stages of colorectal tumorigenesis through modulation of oncogenic pathways. / Dallosso, A R; Øster, Bodil; Greenhough, A et al.
I: Oncogene, Nr. 31, 2012, s. 4409-4419.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Non-CpG island promoter hypomethylation and miR-149 regulate the expression of SRPX2 in colorectal cancer. / Oster, Bodil; Linnet, Lene; Christensen, Lise Lotte et al.
I: International Journal of Cancer, 2012.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis. / Thorsen, Kasper; Schepeler, Troels; Øster, Bodil et al.
I: B M C Genomics, Bind 12, Nr. 1, 14.10.2011, s. 505.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Elevated microRNA-126 is associated with high vascular endothelial growth factor receptor 2 expression levels and high microvessel density in colorectal cancer. / Hansen, Torben Frøstrup; Andersen, Claus Lindbjerg; Nielsen, Boye Schnack et al.
I: Oncology Letters, Bind 2, Nr. 6, 04.08.2011, s. 1101-1106.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
A Beta-Mixture Model for Dimensionality Reduction, Sample Classification and Analysis. / Laurila, Kirsti; Øster, Bodil; Andersen, Claus L et al.
I: B M C Bioinformatics, Bind 12, Nr. 1, 27.05.2011, s. 215.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Identification and validation of highly frequent CpG island hypermethylation in colorectal adenomas and carcinomas : CpG island hypermethylation in colorectal cancer. / Øster, Bodil; Thorsen, Kasper; Lamy, Philippe et al.
I: International Journal of Cancer, 11.03.2011.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Elevated micro-RNA-126 is associated with high vascular endothelial growth factor receptor 2 expression levels and high microvessel density in colorectal cancer. / Hansen, Torben Frøstrup; Andersen, Claus Lindbjerg; Nielsen, Boye Schnack et al.
I: Oncology Letters, Bind 2, Nr. 6, 2011, s. 1101-1106.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Evaluation of two commercial global miRNA expression profiling platforms for detection of less abundant miRNAs. / Jensen, Steffen G; Lamy, Philippe; Rasmussen, Mads H et al.
I: B M C Genomics, Bind 12, 2011, s. 435.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Identification of miRNAs associated with recurrence of stage II colorectal cancer. / Christensen, Lise Lotte; Tobiasen, Heidi; Schepeler, Troels et al.
2011. Poster session præsenteret ved MicroRNAs and Non-coding RNAs and Cancer, Canada.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
Repression of KIAA1199 attenuates wnt-signalling and decreases the proliferation of colon cancer cells : KIAA1199 in colorectal cancer. / Birkenkamp-Demtröder, Karin; Maghnouj, Abdelouahid; Mansilla, Francisco et al.
I: British Journal of Cancer, 2011.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Frequent genomic loss at chr16p13.2 is associated with poor prognosis in colorectal cancer. / Andersen, Claus Lindbjerg; Lamy, Philippe; Thorsen, Kasper et al.
I: International Journal of Cancer, 10.12.2010.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Rseg - an R package to optimize segmentation of SNP array data. / Lamy, Philippe; Wiuf, Carsten; Ørntoft, Torben Falck et al.
I: Bioinformatics, 05.12.2010.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
KIAA1199 depletion targets the wnt/beta catenin signaling pathway and impairs migration and proliferation of human colon cancer cells . / Birkenkamp-Demtröder, Karin; Maghnouj, Abdelouahid ; Mansilla, Francisco et al.
2010. Abstract fra 101th Annual Meeting of the American Association of Cancer Research (AACR), Washington, USA.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › peer review
Clusterin, a candidate tumor suppressor gene in colorectal cancer, is regulated by the Wnt-pathway. / Schepler, Troels; Mansilla, Francisco; Ørntoft, Torben Falck et al.
2010. Poster session præsenteret ved 98th AACR Annual meeting of the American Association for cancer research, Washington, USA.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Alternative splicing of SLC39A14 in colorectal cancer is regulated by the Wnt pathway. / Thorsen, Kasper; Mansilla, Francisco; Schepler, Troels et al.
I: Molecular and Cellular Proteomics, 2010.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
The relationship between miRNA-126, vascular endothelial growth factor receptor 2 and neoangiogenesis in patients with colorectal cancer. / Hansen, Torben Frøstrup; Andersen, Claus Lindbjerg; Spindler, Karen-Lise Garm et al.
2010.Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning › peer review
Dysregulation of the transcription factors SOX4, CBFB and SMARCC1 correlates with outcome of colorectal cancer. / Andersen, C L; Christensen, L L; Thorsen, K et al.
I: British Journal of Cancer, Bind 100, Nr. 3, 10.02.2009, s. 511-23.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Functional characterization of rare missense mutations in MLH1 and MSH2 identified in Danish colorectal cancer patients. / Christensen, Lise Lotte; Kariola, Reetta; Korhonen, Mari K et al.
I: Familial Cancer, Bind 8, Nr. 4, 01.01.2009, s. 489-500.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Blockage of receptor for advanced glycation end products prevents development of cardiac dysfunction in db/db type 2 diabetic mice. / Nielsen, Jan M; Kristiansen, Steen B; Nørregaard, Rikke et al.
I: European Journal of Heart Failure, Bind 11, Nr. 7, 2009, s. 638-47.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
DNA microarrays and genetic testing. / Andersen, Lars Dyrskjøt; Sørensen, Karina Dalsgaard; Ostenfeld, Marie Stampe et al.
Molecular Diagnostics. 2009.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review
Dysregulation of the transcription factors SOX4, CBFB, and SMARCC1 correlates with outcome of colorectal cancer. / Andersen, Claus Lindbjerg; Christensen, Lise Lotte; Thorsen, Kasper et al.
I: British Journal of Cancer, 2009.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Genomic profiling of microRNAs in bladder cancer: miR-129 is associated with poor outcome and promotes cell death in vitro. / Andersen, Lars Dyrskjøt; Ostenfeld, Marie Stampe; Bramsen, Jesper Bertram et al.
I: Cancer Research, Bind 69, Nr. 11, 2009, s. 4851-60.Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review