Bioinformatics Research Centre

Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl
Du er her: BiRC » Christian Nørgaard Storm Pedersen » Publikationer

Christian Nørgaard Storm Pedersen

1 - 83 ud af 83Pr. side: 100
RSS feed af denne liste
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2018
  2. Udgivet

    BS-virus-finder : virus integration calling using bisulfite sequencing data. / Gao, Shengjie; Hu, Xuesong; Xu, Fengping; Gao, Changduo; Xiong, Kai; Zhao, Xiao; Chen, Haixiao; Zhao, Shancen; Wang, Mengyao; Fu, Dongke; Zhao, Xiaohui; Bai, Jie; Mao, Likai; Li, Bo; Wu, Song; Wang, Jian; Li, Shengbin; Yang, Huangming; Bolund, Lars; Pedersen, Christian N S.

    I: GigaScience, 2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  3. 2017
  4. Udgivet

    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference. / Maretty, Lasse; Jensen, Jacob Malte; Petersen, Bent; Sibbesen, Jonas Andreas; Liu, Siyang; Villesen, Palle; Skov, Laurits; Belling, Kirstine Christensen; Theil Have, Christian; Izarzugaza, José M G; Grosjean, Marie; Bork-Jensen, Jette; Grove, Jakob; Als, Thomas D; Huang, Shujia; Chang, Yuqi; Xu, Ruiqi; Ye, Weijian; Rao, Junhua; Guo, Xiaosen; Sun, Jihua; Cao, Hongzhi; Ye, Chen; van Beusekom, Johan; Espeseth, Thomas; Flindt, Esben Nørgaard; Friborg, Rune M; Halager, Anders E; Le Hellard, Stephanie; Hultman, Christina M; Lescai, Francesco; Li, Shengting; Lund, Ole; Løngren, Peter; Mailund, Thomas; Matey-Hernandez, Maria Luisa; Mors, Ole; Pedersen, Christian N S; Sicheritz-Ponten, Thomas; Sullivan, Patrick F; Syed, Ali; Westergaard, David; Yadav, Rachita; Li, Ning; Xu, Xun; Hansen, Torben; Krogh, Anders; Bolund, Lars; Sørensen, Thorkild I A; Pedersen, Oluf; Gupta, Ramneek; Rasmussen, Simon; Besenbacher, Søren; Børglum, Anders D; Wang, Jun; Eiberg, Hans; Kristiansen, Karsten; Brunak, Søren; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Nature, Bind 548, 03.08.2017, s. 87-91.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  5. Udgivet

    Prediction of Primary Tumors in Cancers of Unknown Primary. / Søndergaard, Dan; Nielsen, Svend; Pedersen, Christian N S; Besenbacher, Søren.

    I: Journal of integrative bioinformatics, Bind 14, Nr. 2, 07.07.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  6. Udgivet

    Discrete Structural Dynamics of Pseudo-Palindromic Motifs Control DNA Binding of Bacterial Toxin-Antitoxin Complexes. / Brodersen, Ditlev Egeskov; Bendtsen, Kirstine Louise; Xu, Kehan; Luckmann, Majbritt; Winther, Kristoffer; Shah, Shiraz A.; Pedersen, Christian N. S.

    I: F A S E B Journal, Bind 31, Nr. No. 1 supplement, 777.2, 04.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review

  7. Udgivet

    Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding. / Bendtsen, Kirstine L; Xu, Kehan; Luckmann, Majbritt; Winther, Kristoffer S; Shah, Shiraz A; Pedersen, Christian N S; Brodersen, Ditlev E.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 45, Nr. 5, 17.03.2017, s. 2875-2886.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  8. 2016
  9. Udgivet

    Computational Classification of P-Type ATPases. / Søndergaard, Dan Ariel; Knudsen, Michael; Pedersen, Christian Storm.

    I: Methods in Molecular Biology, Bind 1377, 2016, s. 493-502.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  10. Udgivet

    Computational discovery of specificity-conferring sites in non-ribosomal peptide synthetases. / Knudsen, Michael; Søndergaard, Dan Ariel; Tofting-Olesen, Claus; Hansen, Frederik Teilfeldt; Brodersen, Ditlev Egeskov; Pedersen, Christian Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 32, Nr. 3, 2016, s. 325-329.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  11. 2015
  12. Udgivet

    Novel variation and de novo mutation rates in population-wide de novo assembled Danish trios. / Besenbacher, Søren; Liu, Siyang; Izarzugaza, José M G; Grove, Jakob; Belling, Kirstine; Bork-Jensen, Jette; Huang, Shujia; Als, Thomas D; Li, Shengting; Yadav, Rachita; Rubio-García, Arcadio; Lescai, Francesco; Demontis, Ditte; Rao, Junhua; Ye, Weijian; Mailund, Thomas; Møllegaard Friborg, Rune; Pedersen, Christian N S; Xu, Ruiqi; Sun, Jihua; Liu, Hao; Wang, Ou; Cheng, Xiaofang; Flores, David; Rydza, Emil; Rapacki, Kristoffer; Damm Sørensen, John; Chmura, Piotr; Westergaard, David; Dworzynski, Piotr; Sørensen, Thorkild I A; Lund, Ole; Hansen, Torben; Xu, Xun; Li, Ning; Bolund, Lars; Pedersen, Oluf; Eiberg, Hans; Krogh, Anders; Børglum, Anders D; Brunak, Søren; Kristiansen, Karsten; Schierup, Mikkel H; Wang, Jun; Gupta, Ramneek; Villesen, Palle; Rasmussen, Simon.

    I: Nature Communications, Bind 6, 5969, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  13. Udgivet

    PATBox: A Toolbox for Classification and Analysis of P-Type ATPases. / Søndergaard, Dan; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: PLOS ONE, Bind 10, Nr. 9, e0139571, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  14. 2014
  15. Udgivet

    Combinatorics of Non-Ribosomal Peptide Synthetases. / Knudsen, Michael; Søndergaard, Dan; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    2014.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

  16. Udgivet

    Machine learning approaches to functional prediction of P-Type ATPases. / Søndergaard, Dan; Knudsen, Michael; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    2014.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

  17. Udgivet

    Fungal NRPS-dependent siderophores: From function to prediction. / Sørensen, Jens Laurids; Knudsen, Michael; Hansen, Frederik Teilfeldt; Olesen, Claus; Romans Fuertes, Patricia; Lee, T. Verne; Søndergaard, Teis Esben; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Brodersen, Ditlev E.; Giese, Henriette.

    Biosynthesis and Molecular Genetics of Fungal Secondary Metabolites. red. / Juan-Francisco Martin; Carlos Garcia-Estrada; Susanne Zeilinger. Springer, 2014. s. 317-339 (Fungal Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  18. Udgivet

    Large Scale Identification and Categorization of Protein Sequences Using Structured Logistic Regression. / Pedersen, Bjørn Panella; Ifrim, Georgiana; Liboriussen, Poul; Axelsen, Kristian B.; Palmgren, Michael G.; Nissen, Poul; Wiuf, Carsten Henrik; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: P L o S One, Bind 9, Nr. 1, e85139, 20.01.2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  19. Udgivet

    tqDist: A Library for Computing the Quartet and Triplet Distances Between Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens; Brodal, Gerth Stølting; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 30, Nr. 4, 2014, s. 2079-2080.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  20. 2013
  21. Udgivet

    zipHMMlib: a highly optimised HMM library exploiting repetitions in the input to speed up the forward algorithm. / Sand, Andreas; Kristiansen, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas.

    I: BMC Bioinformatics , Bind 14, Nr. 339, 12.2013, s. 339-348.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  22. Udgivet

    Algorithms for Hidden Markov Models Restricted to Occurrences of Regular Expressions. / Tataru, Paula; Sand, Andreas; Hobolth, Asger; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 08.11.2013, s. 1282-1295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  23. Udgivet

    Characterising RNA secondary structure space using information entropy. / Sükösd, Zsuzsanna; Knudsen, Bjarne; Anderson, James WJ; Novák, Adám; Kjems, Jørgen; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 14 , Nr. Suppl 2, S22, 21.01.2013, s. 1-9.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  24. Udgivet

    A practical O(n log2 n) time algorithm for computing the triplet distance on binary trees. / Sand, Andreas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 14, Nr. Suppl 2, 2013, s. S18.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  25. Udgivet

    Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distances for Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Brodal, Gerth Stølting; Mailund, Thomas.

    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 2013, s. 1189-1209.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  26. Udgivet

    Efficient Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degree. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Sand, Andreas.

    I: The Annual A C M - S I A M Symposium on Discrete Algorithms. Proceedings, Bind 24, 2013, s. 1814-1832.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  27. Udgivet

    GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution. / Simonsen, Martin; Christensen, Mikael Hvidtfelt; Thomsen, Rene; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    Massively Parallel Evolutionary Computation on GPGPUs. red. / Shigeyoshi tsutsui; Pierre Collet. Springer Publishing Company, 2013. (Natural Computing Series).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  28. Udgivet

    Methods for Similarity-Based Virtual Screening. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Computational and Structural Biotechnology Journal, Bind 5, Nr. 6, 2013.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  29. 2012
  30. Udgivet

    PPfold 3.0: fast RNA secondary structure prediction using phylogeny and auxiliary data. / Sükösd, Zsuzsanna; Knudsen, Bjarne; Kjems, Jørgen; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 20, 09.11.2012, s. 2691-2692.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  31. Udgivet

    shortran : A pipeline for small RNA-seq data analysis. / Gupta, Vikas; Markmann, Katharina; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Stougaard, Jens; Andersen, Stig Uggerhøj.

    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 20, 2012, s. 2698-2700.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  32. Udgivet

    Evolution of plant P-type ATPases. / Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Axelsen, Kristian B.; Harper, Jeffrey F.; Palmgren, Michael G.

    I: Frontiers in Plant Science, Bind 21, 2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  33. Udgivet

    UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based DCJ. / Hilker, Rolf; Sickinger, Corinna; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Stoye, Jens .

    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 19, 2012, s. 2509-2511.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  34. 2011
  35. Udgivet

    A sub-cubic time algorithm for computing the quartet distance between two general trees. / Nielsen, Jesper; Kristensen, Anders Kabell; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 6, Nr. 15, 03.06.2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  36. Udgivet

    Using Inverted Indices for Accelerating LINGO Calculations. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Journal of Chemical Information and Modeling, Bind 51, Nr. 3, 18.02.2011, s. 597-600.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  37. Udgivet

    GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution. / Simonsen, Martin; Thomsen, R.; Christensen, M. H.; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    GECCO'11 Proceedings of the 13th annual conference on Genetic and evolutionary computation. Association for Computing Machinery, 2011. s. 1803-1810.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  38. Udgivet

    Inference of Large Phylogenies Using Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bind 127, Nr. 5, 2011, s. 334-344.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  39. Udgivet

    Molecular Docking with Ligand Attached Water Molecules. / Lie, Mette Alstrup; Thomsen, Rene; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Schiøtt, Birgit; Christensen, Mikael Hvidtfeldt.

    I: Journal of Chemical Information and Modeling, Bind 51, Nr. 4, 2011, s. 909-917.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  40. Udgivet

    Rapid Computation of Distance Estimators from Nucleotide and Amino Acid Alignments. / Simonsen, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    Proceedings of the 26th Annual ACM Symposium on Applied Computing. Association for Computing Machinery, 2011.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  41. 2010
  42. Udgivet

    Using the Power of Modern Processors in Bioformatics. / Simonsen, Martin; Sand, Andreas; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    2010. Poster session præsenteret ved Conference on IT research at AU, Århus, Danmark.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  43. Udgivet

    A tree-based method for the rapid screening of chemical fingerprints. / Kristensen, Thomas G; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian N S.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 5, Nr. 9, 2010.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  44. Udgivet

    Building Very Large Neighbour-Joining Trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    BIOINFORMATICS 2010: Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics (part of the 3rd International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2010). red. / Ana Fred; Joaquim Filipe; Hugo Gamboa. Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication, 2010. s. 26.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  45. Udgivet

    Data Structures for Accelerating Tanimoto Queries on Real Valued Vectors. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    Algorithms in Bioinformatics: 10th International Workshop (WABI 2010). red. / Vincent Moulton; Mona Singh. Bind 6293 Springer, 2010. s. 28-39.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  46. Udgivet

    HMMlib: A C++ Library for General Hidden Markov Models Exploiting Modern CPUs. / Sand, Andreas; Brask, Asbjørn Tølbøl; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brask, Asbjørn Tølbøl.

    2010 Ninth International Workshop on Parallel and Distributed Methods in Verification and Second International Workshop on High Performance Computational Systems Biology. IEEE, 2010. s. 126 - 134 .

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  47. 2009
  48. Udgivet

    A Quadratic Time Algorithm for Computing the Quartet Distance between Two General Trees. / Mailund, Thomas; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Storm.

    Proceedings of IJCBS 2009. IEEE Computer Society Press, 2009. s. 565-568.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  49. Udgivet

    A fast algorithm for genome wide haplotype pattern mining. / Besenbacher, Søren; Pedersen, Christian Storm; Mailund, Thomas.

    I: B M C Bioinformatics, Nr. suppl. 1, 2009, s. 772.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  50. Udgivet

    A tree based method for the rapid screening of chemical fingerprints. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Lecture Notes in Computer Science, Bind 5724, 2009, s. 194-205.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Konferenceartikel › Forskning › peer review

  51. Udgivet

    Automatic classification of P-Type ATPases using SLR. / Liboriussen, Poul; Pedersen, Bjørn Panyella; Ifrim, Georgiana; Nissen, Poul; Pedersen, Christian Storm.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  52. Udgivet

    Building very large neighbour-joining trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  53. Udgivet

    Investigation of a simple heuristic improving the speed of statistical alignments. / Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Storm; Hein, Jotun.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  54. Udgivet

    Largest Common Chemical Feature Subtree as a Virtual Screening Method. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm; Thomsen, Rene; Christensen, Mikael Hvidtfeldt.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Bioligy (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  55. Udgivet

    Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm.

     Proceedings of the 2009 International Joint conferences on Bioinformatics, System biology and Intelligent Computing (IJCBS2009). red. / Joe Zhang; G.-Z. Li; J.Y. Yang. IEEE Computer Society Press, 2009. s. 331-334.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  56. Udgivet

    Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution. / Pedersen, Christian Storm; Kristensen, Thomas Greve.

    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Bioligy (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  57. 2008
  58. Udgivet

    Rapid neighbour-joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian N.S.

    Algorithms in Bioinformatics - 8th International Workshop, WABI 2008, Proceedings. 2008. s. 113-122 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 5251 LNBI).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  59. Udgivet

    All-to-all RF Distance Methods. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm.

    2008. Poster session præsenteret ved Bioinformatics 2008, Warszawa, Polen.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  60. Udgivet

    Computing the all-pairs quartet distance on a set of evolutionary trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    I: Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Bind 6, Nr. 1, 2008, s. 37-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  61. Udgivet

    Rapid Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.

    Proceedings of the 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2008. s. 113-122.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  62. 2007
  63. Udgivet

    Computing the All-Pairs Quartet Distance on a Set of Evolutionary Trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf.

    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 91-100.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  64. Udgivet

    Computing the Quartet Distance between Evolutionary Trees of Bounded Degree. / Stissing, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas; Brodal, Gerth Stølting.

    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 101-110.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  65. Udgivet

    Experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas; Vinter, Brian; Karlsen, Henrik.

    I: Future Generation Computer Systems - The International Journal of eScience, Bind 23, 2007, s. 580-586.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  66. 2006
  67. Udgivet

    Fast Calculation of the Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degrees. / Christiansen, Chris; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Randers, Martin; Stissing, Martin.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 1, Nr. 16, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  68. Udgivet

    GeneRecon—A coalescent based tool for fine-scale association mapping. / Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Madsen, Jesper Nymann; Hein, Jotun; Schauser, Leif.

    I: Bioinformatics, Bind 22, Nr. 18, 2006, s. 2317–2318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  69. Udgivet

    Recrafting the Neighbor-Joining Method. / Mailund, ; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Phillips, Derek.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 7, Nr. 29, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  70. 2005
  71. Udgivet

    CoaSim: A Flexible Environment for Simulating Genetic Data under Coalescent Models. / Mailund, ; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mechlenborg, Peter; Madsen, Jesper N; Schauser, Leif.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 6, Nr. 252, 2005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  72. Udgivet

    Computing the Quartet Distance between Trees of Arbitrary Degree. / Christiansen, Chris; Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Randers, Martin.

    Proceedings of the 5th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2005. s. 77-88.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  73. Udgivet

    Initial experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas; Vinter, Brian; Karlsen, Henrik H.

    Proceedings of The 2005 International Conference on Grid Computing and Applications (GCA). 2005.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  74. Udgivet

    Quartet Distance between General Trees. / Christiansen, Chris; Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Randers, Martin.

    Proceedings of International Conference on Numerical Analysis and Applied Mathematics (ICNAAM). 2005. s. 796-799.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  75. Udgivet

    RBT—A Tool for Building Refined Buneman Trees. / Besenbacher, Søren; Mailund; Westh-Nielsen, Lasse; Pedersen, Christian N. Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 21, Nr. 8, 2005, s. 1711-1712.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  76. 2004
  77. Udgivet

    QDist - Quartet Distance between Evolutionary Trees. / Mailund, T.; Pedersen, C.N.S.

    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 10, 2004, s. 1636-1637.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  78. Udgivet

    QDist—Quartet Distance Between Evolutionary Trees. / Mailund, ; Pedersen, Christian N. Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 10, 2004, s. 1636-1637.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  79. Udgivet

    QuickJoin - Fast Neighbour-Joining Tree Reconstruction. / Mailund, T.; Pedersen, C.N.S.

    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 17, 2004, s. 3261-3262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  80. Udgivet

    QuickJoin—Fast Neighbour-Joining Tree Reconstruction. / Mailund, ; Pedersen, Christian N. Storm.

    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 17, 2004, s. 3261-3262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  81. Udgivet

    RBT - A Tool for Building Refined Buneman Trees. / Besenbacher, S.; Mailund, T.; Westh-Nielsen, L.; Pedersen, C.N.S.

    I: Bioinformatics, Bind 21, Nr. 8, 2004, s. 1711-1712.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  82. Udgivet

    RBT -- A tool for building refined Buneman trees. / Besenbacher, Søren; Mailund, Thomas; Westh-Nielsen, L.; Pedersen, Christian Storm.

    I: Bioinformatics, Bind doi:10.1093/bti195, 2004, s. in press.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning

  83. 2003
  84. Udgivet

    Computing Refined Buneman Trees in Cubic Time. / Brodal, G.S.; Fagerberg, R.; Östlin, A.; Pedersen, C.N.S.; Rao, S.S.

    Algorithms in Bioinformatics: Third International Workshop, WABI 2003, Budapest, Hungary, September 15-20, 2003. Proceedings. red. / Gary Benson; Roderic Page. Springer, 2003. s. 259-270 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2812).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  85. Udgivet

    Computing the Quartet Distance Between Evolutionary Trees in Time O(n log n). / Brodal, Gerth Sølfting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Algorithmica, Bind 38, Nr. 2, 2003, s. 377-395.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  86. Udgivet

    Recursions for statistical multiple alignment. / Hein, Jotun; Jensen, J.L.; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 100, Nr. 25, 2003, s. 14960-14965.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  87. Udgivet

    Speeding Up Neighbour-Joining Tree Construction. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Phillips, Derek.

    Work package 5 udg. www.brics.dk : ALCOM-FT, 2003. 9 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning

  88. Udgivet

    Speeding Up Neighbour-Joining Tree Construction. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, T; Pedersen, Christian N. Storm; Phillips, Derek.

    2003.

    Publikation: Working paper › Forskning

  89. 2002
  90. Udgivet

    Bioinformatik ved Aarhus Universitet. / Pedersen, C.N.S.

    I: Biozoom, Nr. 3, 2002, s. 12-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Letter

  91. Udgivet

    Comparative Methods for Gene Structure Prediction in Homologous Sequences. / Pedersen, C.N.S.; Scharling, T.; Guigó, R. (Redaktør); Gusfield, D. (Redaktør).

    Ikke angivet. Bind 2452/2002 2452 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2002. s. 220-234.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  92. Udgivet

    Recursions for Statistical Multiple Alignment. / Hein, J.; Jensen, Jens Ledet; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    Århus : Department of Mathematical Sciences , University of Aarhus, 2002.

    Publikation: Working paper › Forskning

  93. Udgivet

    Recursions for Statistical Multiple Alignment. / Hein, Jotun; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Jensen, Jens Ledet.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 100, Nr. 25, 2002, s. 14960-14965.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  94. Udgivet

    Solving the String Statistics Problem in Time O(n log n). / Brodal, Gerth Stølting; Lyngsø, Rune B.; Östlin, Anna; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    Automata, Languages and Programming: 29th International Colloquium, ICALP 2002 Málaga, Spain, July 8–13, 2002 Proceedings. red. / Peter Widmayer; Stephan Eidenbenz; Francisco Triguero; Rafael Morales; Ricardo Conejo; Matthew Hennessy. Springer, 2002. s. 728-739 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2380).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  95. Udgivet

    The Consensus String Problem and the Complexity of Comparing Hidden Markov Models. / Lyngsø, Rune Bang; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Journal of Computer and System Sciences, Bind 65, Nr. 3, 2002, s. 545-569.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avis › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  96. 2001
  97. Udgivet

    Comparing Hidden Markov Model and a Stochastic Context-Free Grammer. / Jagota, A.; Lyngsø, R.B.; Pedersen, C.N.S.; Gascuel, O. (Redaktør); Moret, B.M.E. (Redaktør).

    Proceedings of the First International Workshop on Algorithms in Bioinformatics. Bind Volume 2149/2001 2149 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 69-94.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  98. Udgivet

    Complexity of Comparing Hidden Markov Models. / Lyngsø, R.B.; Pedersen, C.N.S.; Eades, P. (Redaktør); Takaoka, T. (Redaktør).

    Ikke angivet. 2223 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 416-428.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  99. Udgivet

    Computing the Quartet Distance Between Evolutionary Trees in Time O(n log² n). / Brodal, Gerth S.; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian N.S.; Eades, P. (Redaktør); Takaoka, T. (Redaktør).

    Proceedings of Algorithms and Computation : 12th International Symposium, ISAAC 2001. Bind 2223/2001 2223 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 731-742.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review

  100. Udgivet

    The Complexity of Constructing Evolutionary Trees Using Experiments. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian N.S.; Östlin, Anna.

    Automata, Languages and Programming: 28th International Colloquium, ICALP 2001 Crete, Greece, July 8–12, 2001 Proceedings. red. / Fernando Orejas; Paul G. Spirakis; Jan van Leeuwen. Springer, 2001. s. 140-151 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2076).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  101. Udgivet

    The Complexity of Constructing Evolutionary Trees Using Experiments. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Östlin, Anna; Orejas, Farnando (Redaktør); Spirakis, Poul G. (Redaktør); Leeuwen, Jan van (Redaktør).

    Lecture Notes In Computer Science; Vol. 2076: Proceedings of the 28th International Colloquium on Automata, Languages and Programming. Bind 2076/2001 2076 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 140-151.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceeding › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › peer review