Aarhus Universitets segl

Christian Nørgaard Storm Pedersen

  1. 2018
  2. Udgivet
    BS-virus-finder: virus integration calling using bisulfite sequencing data. / Gao, Shengjie; Hu, Xuesong; Xu, Fengping et al.
    I: GigaScience, Bind 7, Nr. 1, 2018, s. 1-7.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. 2017
  4. Udgivet
    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference. / Maretty, Lasse; Jensen, Jacob Malte; Petersen, Bent et al.
    I: Nature, Bind 548, Nr. 7665, 03.08.2017, s. 87-91.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. Udgivet
    Prediction of Primary Tumors in Cancers of Unknown Primary. / Søndergaard, Dan; Nielsen, Svend; Pedersen, Christian N S et al.
    I: Journal of integrative bioinformatics, Bind 14, Nr. 2, 07.07.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  6. Udgivet
    Discrete Structural Dynamics of Pseudo-Palindromic Motifs Control DNA Binding of Bacterial Toxin-Antitoxin Complexes. / Brodersen, Ditlev Egeskov; Bendtsen, Kirstine Louise; Xu, Kehan et al.
    I: F A S E B Journal, Bind 31, Nr. No. 1 supplement, 777.2, 04.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningpeer review

  7. Udgivet
    Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding. / Bendtsen, Kirstine L; Xu, Kehan; Luckmann, Majbritt et al.
    I: Nucleic Acids Research, Bind 45, Nr. 5, 17.03.2017, s. 2875-2886.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  8. 2016
  9. Udgivet
    Computational Classification of P-Type ATPases. / Søndergaard, Dan Ariel; Knudsen, Michael; Pedersen, Christian Storm.
    I: Methods in Molecular Biology, Bind 1377, 2016, s. 493-502.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  10. Udgivet
    Computational discovery of specificity-conferring sites in non-ribosomal peptide synthetases. / Knudsen, Michael; Søndergaard, Dan Ariel; Tofting-Olesen, Claus et al.
    I: Bioinformatics, Bind 32, Nr. 3, 2016, s. 325-329.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. 2015
  12. Udgivet
    Novel variation and de novo mutation rates in population-wide de novo assembled Danish trios. / Besenbacher, Søren; Liu, Siyang; Izarzugaza, José M G et al.
    I: Nature Communications, Bind 6, 5969, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. Udgivet
    PATBox: A Toolbox for Classification and Analysis of P-Type ATPases. / Søndergaard, Dan; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: PLOS ONE, Bind 10, Nr. 9, e0139571, 2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  14. 2014
  15. Udgivet
  16. Udgivet
  17. Udgivet
    Fungal NRPS-dependent siderophores: From function to prediction. / Sørensen, Jens Laurids; Knudsen, Michael; Hansen, Frederik Teilfeldt et al.
    Biosynthesis and Molecular Genetics of Fungal Secondary Metabolites. red. / Juan-Francisco Martin; Carlos Garcia-Estrada; Susanne Zeilinger. Springer, 2014. s. 317-339 (Fungal Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

  18. Udgivet
    Large Scale Identification and Categorization of Protein Sequences Using Structured Logistic Regression. / Pedersen, Bjørn Panella; Ifrim, Georgiana; Liboriussen, Poul et al.
    I: P L o S One, Bind 9, Nr. 1, e85139, 20.01.2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  19. Udgivet
    tqDist: A Library for Computing the Quartet and Triplet Distances Between Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens et al.
    I: Bioinformatics, Bind 30, Nr. 4, 2014, s. 2079-2080.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  20. 2013
  21. Udgivet
    zipHMMlib: a highly optimised HMM library exploiting repetitions in the input to speed up the forward algorithm. / Sand, Andreas; Kristiansen, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: BMC Bioinformatics , Bind 14, Nr. 339, 12.2013, s. 339-348.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  22. Udgivet
    Algorithms for Hidden Markov Models Restricted to Occurrences of Regular Expressions. / Tataru, Paula; Sand, Andreas; Hobolth, Asger et al.
    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 08.11.2013, s. 1282-1295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  23. Udgivet
    Characterising RNA secondary structure space using information entropy. / Sükösd, Zsuzsanna; Knudsen, Bjarne; Anderson, James WJ et al.
    I: B M C Bioinformatics, Bind 14 , Nr. Suppl 2, S22, 21.01.2013, s. 1-9.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  24. Udgivet
    Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distances for Binary and General Trees. / Sand, Andreas; Holt, Morten Kragelund; Johansen, Jens et al.
    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 2013, s. 1189-1209.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  25. Udgivet
    A practical O(n log2 n) time algorithm for computing the triplet distance on binary trees. / Sand, Andreas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas et al.
    I: B M C Bioinformatics, Bind 14, Nr. Suppl 2, 2013, s. S18.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  26. Udgivet
    Efficient Algorithms for Computing the Triplet and Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degree. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, Thomas et al.
    I: The Annual A C M - S I A M Symposium on Discrete Algorithms. Proceedings, Bind 24, 2013, s. 1814-1832.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  27. Udgivet
    GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution. / Simonsen, Martin; Christensen, Mikael Hvidtfelt; Thomsen, Rene et al.
    Massively Parallel Evolutionary Computation on GPGPUs. red. / Shigeyoshi tsutsui; Pierre Collet. Springer Publishing Company, 2013. (Natural Computing Series).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

  28. Udgivet
    Methods for Similarity-Based Virtual Screening. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Computational and Structural Biotechnology Journal, Bind 5, Nr. 6, 2013.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  29. 2012
  30. Udgivet
    PPfold 3.0: fast RNA secondary structure prediction using phylogeny and auxiliary data. / Sükösd, Zsuzsanna; Knudsen, Bjarne; Kjems, Jørgen et al.
    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 20, 09.11.2012, s. 2691-2692.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet
    shortran: A pipeline for small RNA-seq data analysis. / Gupta, Vikas; Markmann, Katharina; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 20, 2012, s. 2698-2700.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet
    Evolution of plant P-type ATPases. / Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Axelsen, Kristian B.; Harper, Jeffrey F. et al.
    I: Frontiers in Plant Science, Bind 21, 2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet
    UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based DCJ. / Hilker, Rolf; Sickinger, Corinna; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: Bioinformatics, Bind 28, Nr. 19, 2012, s. 2509-2511.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  34. 2011
  35. Udgivet
    A sub-cubic time algorithm for computing the quartet distance between two general trees. / Nielsen, Jesper; Kristensen, Anders Kabell; Mailund, Thomas et al.
    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 6, Nr. 15, 03.06.2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  36. Udgivet
    Using Inverted Indices for Accelerating LINGO Calculations. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Journal of Chemical Information and Modeling, Bind 51, Nr. 3, 18.02.2011, s. 597-600.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  37. Udgivet
    GPU-Accelerated High-Accuracy Molecular Docking using Guided Differential Evolution. / Simonsen, Martin; Thomsen, R.; Christensen, M. H. et al.
    GECCO'11 Proceedings of the 13th annual conference on Genetic and evolutionary computation. Association for Computing Machinery, 2011. s. 1803-1810.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  38. Udgivet
    Inference of Large Phylogenies Using Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Biomedical Engineering Systems and Technologies, Bind 127, Nr. 5, 2011, s. 334-344.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  39. Udgivet
    Molecular Docking with Ligand Attached Water Molecules. / Lie, Mette Alstrup; Thomsen, Rene; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: Journal of Chemical Information and Modeling, Bind 51, Nr. 4, 2011, s. 909-917.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  40. Udgivet
    Rapid Computation of Distance Estimators from Nucleotide and Amino Acid Alignments. / Simonsen, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    Proceedings of the 26th Annual ACM Symposium on Applied Computing. Association for Computing Machinery, 2011.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  41. 2010
  42. Udgivet
    Using the Power of Modern Processors in Bioformatics. / Simonsen, Martin; Sand, Andreas; Mailund, Thomas et al.
    2010. Poster session præsenteret ved Conference on IT research at AU, Århus, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  43. Udgivet
    A tree-based method for the rapid screening of chemical fingerprints. / Kristensen, Thomas G; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian N S.
    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 5, Nr. 9, 2010.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  44. Udgivet
    Building Very Large Neighbour-Joining Trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    BIOINFORMATICS 2010: Proceedings of the First International Conference on Bioinformatics (part of the 3rd International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, BIOSTEC 2010). red. / Ana Fred; Joaquim Filipe; Hugo Gamboa. Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication, 2010. s. 26.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  45. Udgivet
    Data Structures for Accelerating Tanimoto Queries on Real Valued Vectors. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    Algorithms in Bioinformatics: 10th International Workshop (WABI 2010). red. / Vincent Moulton; Mona Singh. Bind 6293 Springer, 2010. s. 28-39.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  46. Udgivet
    HMMlib: A C++ Library for General Hidden Markov Models Exploiting Modern CPUs. / Sand, Andreas; Brask, Asbjørn Tølbøl; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    2010 Ninth International Workshop on Parallel and Distributed Methods in Verification and Second International Workshop on High Performance Computational Systems Biology. IEEE, 2010. s. 126 - 134 .

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  47. 2009
  48. Udgivet
    A fast algorithm for genome wide haplotype pattern mining. / Besenbacher, Søren; Pedersen, Christian Storm; Mailund, Thomas.
    I: B M C Bioinformatics, Nr. suppl. 1, 2009, s. 772.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  49. Udgivet
    A Quadratic Time Algorithm for Computing the Quartet Distance between Two General Trees. / Mailund, Thomas; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Storm.
    Proceedings of IJCBS 2009. IEEE Computer Society Press, 2009. s. 565-568.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  50. Udgivet
    A tree based method for the rapid screening of chemical fingerprints. / Kristensen, Thomas Greve; Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Lecture Notes in Computer Science, Bind 5724, 2009, s. 194-205.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisKonferenceartikelForskningpeer review

  51. Udgivet
    Automatic classification of P-Type ATPases using SLR. / Liboriussen, Poul; Pedersen, Bjørn Panyella; Ifrim, Georgiana et al.
    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  52. Udgivet
    Building very large neighbour-joining trees. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.
    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  53. Udgivet
    Investigation of a simple heuristic improving the speed of statistical alignments. / Nielsen, Jesper; Pedersen, Christian Storm; Hein, Jotun.
    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  54. Udgivet
    Largest Common Chemical Feature Subtree as a Virtual Screening Method. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm; Thomsen, Rene et al.
    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Bioligy (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  55. Udgivet
    Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm.
     Proceedings of the 2009 International Joint conferences on Bioinformatics, System biology and Intelligent Computing (IJCBS2009). red. / Joe Zhang; G.-Z. Li; J.Y. Yang. IEEE Computer Society Press, 2009. s. 331-334.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  56. Udgivet
    Optimal Overlay of Ligands with Flexible Bonds Using Differential Evolution. / Pedersen, Christian Storm; Kristensen, Thomas Greve.
    2009. Poster session præsenteret ved 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Bioligy (ISMB) & 8th European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sverige.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  57. 2008
  58. Udgivet
    Rapid neighbour-joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian N.S.
    Algorithms in Bioinformatics - 8th International Workshop, WABI 2008, Proceedings. 2008. s. 113-122 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 5251 LNBI).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  59. Udgivet
    All-to-all RF Distance Methods. / Kristensen, Thomas Greve; Pedersen, Christian Storm.
    2008. Poster session præsenteret ved Bioinformatics 2008, Warszawa, Polen.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  60. Udgivet
    Computing the all-pairs quartet distance on a set of evolutionary trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm et al.
    I: Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Bind 6, Nr. 1, 2008, s. 37-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  61. Udgivet
    Rapid Neighbour-Joining. / Simonsen, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Storm.
    Proceedings of the 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2008. s. 113-122.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  62. 2007
  63. Udgivet
    Computing the All-Pairs Quartet Distance on a Set of Evolutionary Trees. / Stissing, Martin; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 91-100.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  64. Udgivet
    Computing the Quartet Distance between Evolutionary Trees of Bounded Degree. / Stissing, Martin; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Mailund, Thomas et al.
    Proceedings of the 5th Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC). 2007. s. 101-110.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  65. Udgivet
    Experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas et al.
    I: Future Generation Computer Systems - The International Journal of eScience, Bind 23, 2007, s. 580-586.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  66. 2006
  67. Udgivet
    Fast Calculation of the Quartet Distance Between Trees of Arbitrary Degrees. / Christiansen, Chris; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 1, Nr. 16, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  68. Udgivet
    GeneRecon—A coalescent based tool for fine-scale association mapping. / Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: Bioinformatics, Bind 22, Nr. 18, 2006, s. 2317–2318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  69. Udgivet
    Recrafting the Neighbor-Joining Method. / Mailund, ; Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf et al.
    I: B M C Bioinformatics, Bind 7, Nr. 29, 2006.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  70. 2005
  71. Udgivet
    CoaSim: A Flexible Environment for Simulating Genetic Data under Coalescent Models. / Mailund, ; Schierup, Mikkel Heide; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    I: B M C Bioinformatics, Bind 6, Nr. 252, 2005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  72. Udgivet
    Computing the Quartet Distance between Trees of Arbitrary Degree. / Christiansen, Chris; Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    Proceedings of the 5th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI). 2005. s. 77-88.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  73. Udgivet
    Initial experiences with GeneRecon on MiG. / Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Bardino, Jonas et al.
    Proceedings of The 2005 International Conference on Grid Computing and Applications (GCA). 2005.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  74. Udgivet
    Quartet Distance between General Trees. / Christiansen, Chris; Mailund, ; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    Proceedings of International Conference on Numerical Analysis and Applied Mathematics (ICNAAM). 2005. s. 796-799.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  75. Udgivet
    RBT—A Tool for Building Refined Buneman Trees. / Besenbacher, Søren; Mailund; Westh-Nielsen, Lasse et al.
    I: Bioinformatics, Bind 21, Nr. 8, 2005, s. 1711-1712.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  76. 2004
  77. Udgivet
    QDist - Quartet Distance between Evolutionary Trees. / Mailund, T.; Pedersen, C.N.S.
    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 10, 2004, s. 1636-1637.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  78. Udgivet
    QDist—Quartet Distance Between Evolutionary Trees. / Mailund, ; Pedersen, Christian N. Storm.
    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 10, 2004, s. 1636-1637.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  79. Udgivet
    QuickJoin - Fast Neighbour-Joining Tree Reconstruction. / Mailund, T.; Pedersen, C.N.S.
    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 17, 2004, s. 3261-3262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  80. Udgivet
    QuickJoin—Fast Neighbour-Joining Tree Reconstruction. / Mailund, ; Pedersen, Christian N. Storm.
    I: Bioinformatics, Bind 20, Nr. 17, 2004, s. 3261-3262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  81. Udgivet
    RBT -- A tool for building refined Buneman trees. / Besenbacher, Søren; Mailund, Thomas; Westh-Nielsen, L. et al.
    I: Bioinformatics, Bind doi:10.1093/bti195, 2004, s. in press.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskning

  82. Udgivet
    RBT - A Tool for Building Refined Buneman Trees. / Besenbacher, S.; Mailund, T.; Westh-Nielsen, L. et al.
    I: Bioinformatics, Bind 21, Nr. 8, 2004, s. 1711-1712.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  83. 2003
  84. Udgivet
    Computing Refined Buneman Trees in Cubic Time. / Brodal, G.S.; Fagerberg, R.; Östlin, A. et al.
    Algorithms in Bioinformatics: Third International Workshop, WABI 2003, Budapest, Hungary, September 15-20, 2003. Proceedings. red. / Gary Benson; Roderic Page. Springer, 2003. s. 259-270 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2812).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  85. Udgivet
    Computing the Quartet Distance Between Evolutionary Trees in Time O(n log n). / Brodal, Gerth Sølfting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Algorithmica, Bind 38, Nr. 2, 2003, s. 377-395.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  86. Udgivet
    Recursions for statistical multiple alignment. / Hein, Jotun; Jensen, J.L.; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Proceedings of the National Academy of Sciences, Bind 100, Nr. 25, 2003, s. 14960-14965.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  87. Udgivet
    Speeding Up Neighbour-Joining Tree Construction. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, Thomas et al.
    Work package 5 udg. www.brics.dk: ALCOM-FT, 2003. 9 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  88. Udgivet
    Speeding Up Neighbour-Joining Tree Construction. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Mailund, T et al.
    2003.

    Publikation: Working paper/Preprint Working paperForskning

  89. 2002
  90. Udgivet
    Bioinformatik ved Aarhus Universitet. / Pedersen, C.N.S.
    I: Biozoom, Nr. 3, 2002, s. 12-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisLetter

  91. Udgivet
    Comparative Methods for Gene Structure Prediction in Homologous Sequences. / Pedersen, C.N.S.; Scharling, T.; Guigó, R. (Redaktør) et al.
    Ikke angivet. Bind 2452/2002 2452 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2002. s. 220-234.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  92. Udgivet
    Recursions for Statistical Multiple Alignment. / Hein, J.; Jensen, Jens Ledet; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    Århus: Department of Mathematical Sciences , University of Aarhus, 2002.

    Publikation: Working paper/Preprint Working paperForskning

  93. Udgivet
    Recursions for Statistical Multiple Alignment. / Hein, Jotun; Pedersen, Christian Nørgaard Storm; Jensen, Jens Ledet.
    I: Proceedings of the National Academy of Sciences, Bind 100, Nr. 25, 2002, s. 14960-14965.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  94. Udgivet
    Solving the String Statistics Problem in Time O(n log n). / Brodal, Gerth Stølting; Lyngsø, Rune B.; Östlin, Anna et al.
    Automata, Languages and Programming: 29th International Colloquium, ICALP 2002 Málaga, Spain, July 8–13, 2002 Proceedings. red. / Peter Widmayer; Stephan Eidenbenz; Francisco Triguero; Rafael Morales; Ricardo Conejo; Matthew Hennessy. Springer, 2002. s. 728-739 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2380).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  95. Udgivet
    The Consensus String Problem and the Complexity of Comparing Hidden Markov Models. / Lyngsø, Rune Bang; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.
    I: Journal of Computer and System Sciences, Bind 65, Nr. 3, 2002, s. 545-569.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  96. 2001
  97. Udgivet
    Comparing Hidden Markov Model and a Stochastic Context-Free Grammer. / Jagota, A.; Lyngsø, R.B.; Pedersen, C.N.S. et al.
    Proceedings of the First International Workshop on Algorithms in Bioinformatics. Bind Volume 2149/2001 2149 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 69-94.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  98. Udgivet
    Complexity of Comparing Hidden Markov Models. / Lyngsø, R.B.; Pedersen, C.N.S.; Eades, P. (Redaktør) et al.
    Ikke angivet. 2223 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 416-428.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  99. Udgivet
    Computing the Quartet Distance Between Evolutionary Trees in Time O(n log² n). / Brodal, Gerth S.; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian N.S. et al.
    Proceedings of Algorithms and Computation : 12th International Symposium, ISAAC 2001. Bind 2223/2001 2223 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 731-742.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  100. Udgivet
    The Complexity of Constructing Evolutionary Trees Using Experiments. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian N.S. et al.
    Automata, Languages and Programming: 28th International Colloquium, ICALP 2001 Crete, Greece, July 8–12, 2001 Proceedings. red. / Fernando Orejas; Paul G. Spirakis; Jan van Leeuwen. Springer, 2001. s. 140-151 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 2076).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskning

  101. Udgivet
    The Complexity of Constructing Evolutionary Trees Using Experiments. / Brodal, Gerth Stølting; Fagerberg, Rolf; Pedersen, Christian Nørgaard Storm et al.
    Lecture Notes In Computer Science; Vol. 2076: Proceedings of the 28th International Colloquium on Automata, Languages and Programming. Bind 2076/2001 2076 of Lecture Notes in Computer Science. udg. Springer, 2001. s. 140-151.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review