Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

Charlotte Rohde Knudsen

  1. Udgivet

    E. coli elongation factor Tu bound to a GTP analogue displays an open conformation equivalent to the GDP-bound form. / Johansen, Jesper Sanderhoff; Kavaliauskas, Darius; Pfeil, Shawn; Blaise , Michael ; Cooperman, Barry; Goldman, Yale; Thirup, Søren Skou; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 46, Nr. 16, 19.09.2018, s. 8641-8650.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  2. Udgivet

    Structural dynamics of translation elongation factor Tu during aa-tRNA delivery to the ribosome. / Kavaliauskas, Darius; Chen, Chunlai; Liu, Wei; Cooperman, Barry; Goldman, Yale; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 46, Nr. 16, 19.09.2018, s. 8651-8661.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. Udgivet

    Dynamics of P-type ATPase transport cycle revealed by single-molecule FRET. / Dyla, Mateusz; Terry, Daniel; Kjærgaard, Magnus; Sørensen, Thomas Lykke-Møller; Andersen, Jacob Lauwring; Andersen, Jens Peter; Knudsen, Charlotte Rohde; Altman, Roger; Nissen, Poul; Blanchard, Scott.

    I: Nature, Bind 551, Nr. 7680, 16.11.2017, s. 346-351.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  4. Udgivet

    Engineering a prototypic P-type ATPase Listeria Monocytogenes Ca(2+)-ATPase 1 for single-molecule FRET studies. / Dyla, Mateusz; Andersen, Jacob; Kjaergaard, Magnus; Birkedal, Victoria; Terry, Daniel S.; Altman, Roger B.; Blanchard, Scott; Nissen, Poul; Knudsen, Charlotte R.

    I: Bioconjugate Chemistry, Bind 27, Nr. 9, 2016, s. 2176-2187.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. Udgivet

    Structural outline of the detailed mechanism for elongation factor Ts-mediated guanine nucleotide exchange on elongation factor Tu. / Thirup, Søren Skou; Van, Lan Bich; Nielsen, Tine K; Knudsen, Charlotte R.

    I: Journal of Structural Biology, Bind 191, Nr. 1, 11.06.2015, s. 10-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  6. Udgivet

    EF-Tu dynamics during pre-translocation complex formation : EF-Tu•GDP exits the ribosome via two different pathways. / Liu, Wei; Chen, Chunlai; Kavaliauskas, Darius; Knudsen, Charlotte R.; Goldman, Yale E.; Cooperman, Barry S.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 43, Nr. 19, 2015, s. 9519-9528.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  7. Udgivet

    Structural basis for RNA-genome recognition during bacteriophage Qβ replication. / Olesen, Heidi Gytz; Mohr, Durita; Seweryn, Paulina; Yoshimura, Yuichi; Kutlubaeva, Zarina; Dolman, Fleur; Chelchessa, Bosene; Chetverin, Alexander B; Mulder, Frans A A; Brodersen, Ditlev E; Knudsen, Charlotte R.

    I: Nucleic Acids Research, Bind 43, Nr. 22, 2015, s. 10893-10906.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  8. Udgivet

    An eEF1A1 truncation encoded by PTI-1 exerts its oncogenic effect inside the nucleus. / Dahl, Louise Dyhrman; Corydon, Thomas Juhl; Ränkel, Liina; Nielsen, Karen Margrethe; Füchtbauer, Ernst-Martin; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Cancer Cell International, Bind 14, Nr. 17, 26.02.2014, s. 1-11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  9. Udgivet

    Labeled EF-Tus for rapid kinetic studies of pretranslocation complex formation. / Liu, Wei; Kavaliauskas, Darius; Schrader, Jared; Poruri, Kiran; Birkedal, Victoria; Goldman, Emanuel; Jakubowski, Hieronim; Mandecki, Wlodek; Uhlenbeck, Olke; Knudsen, Charlotte Rohde; Goldman, Yale; Cooperman, Barry.

    I: A C S Chemical Biology, Bind 9, Nr. 10, 2014, s. 2421-2431.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  10. Udgivet

    The Busiest of All Ribosomal Assistants : Elongation Factor Tu. / Kavaliauskas, Darius; Nissen, Poul; Knudsen, Charlotte R.

    I: Biochemistry, Bind 51, Nr. 13, 03.2012, s. 2642-2651.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. Udgivet

    Aminoacyl-tRNA-charged eukaryotic elongation factor 1A is a bona fide substrate for Legionelle pneumophila effector glucosyltransferases. / Tzivelekidis, Tina; Jank, Thomas; Pohl, Corinna; Schlosser, Andreas; Rospert, Sabine; Knudsen, Charlotte Rohde; Rodnina, Marina; Belyi, Yuri; Aktories, Klaus.

    I: P L o S One, Bind 6, Nr. 12, 22.12.2011, s. e29525.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  12. Udgivet

    Idenfitication of an mRNP complex regulating tumorigenesis at the translational elongation step. / Hussey, George; Chaudhury, Arindam; Dawson, Andrea; Lindner, Daniel; Knudsen, Charlotte Rohde; Wilce, Matthew; Merrick, William; Howe, Philip.

    I: Molecular Cell, Bind 41, Nr. 4, 2011, s. 419.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. Udgivet

    Structure of the Qβ replicase, an RNA-dependent RNA polymerase consisting of viral and host proteins. / Kidmose, Rune Thomas; Vasiliev, Nikita; Chetverin, Alexander; Knudsen, Charlotte Rohde; Andersen, Gregers Rom.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 107, Nr. 24, 15.06.2010, s. 10884-10889.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  14. Udgivet

    Properties of Escherichia coli EF-Tu mutants designed for fluorescence resonance energy transfer from tRNA molecules. / Perla-Karjan, J.; Lin, X; Cooperma, B. S.; Goldman, E.; Jakubowski, H.; Knudsen, Charlotte Rohde; Mandecki, W.

    I: Protein Engineering Design and Selection (Print), Bind 23, Nr. 3, 2010, s. 129-136.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  15. Udgivet

    Translation elongation factor eEF1A binds to a novel myosin binding protein-C-like protein. / Mansilla, Francisco; Dominguez, C. A. G.; Yeadon, J. E.; Corydon, Thomas Juhl; Burden, S. J.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Molecular and Cellular Biology, Bind 105, Nr. 3, 2008, s. 847-858.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  16. Udgivet

    Characterization of human mucin (MUC15) and identification of ovine and caprine orthologs. / Pallesen, Lone Tjener; Pedersen, Lise Refstrup Linnebjerg; Petersen, Torben Ellebæk; Knudsen, Charlotte Rohde; Rasmussen, Jan Trige.

    I: Journal of Dairy Science, Bind 91, Nr. 12, 2008, s. 4477-83.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  17. Udgivet

    Fast in vitro translation system immobilized on a surface via specific biotinylation of the ribosome. / Stapulionis, Romualdas; Wang, Y.; Dempsey, G. T.; Khudaravalli, R.; Nielsen, Karen Margrethe; Cooperman, B. S.; Goldman, Y. E.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Biological Chemistry, Bind 389, Nr. 9, 2008, s. 1239-1249.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  18. Udgivet

    Kinetics of the interactions between yeast elongation factors 1A and 1Balpha, guanine nucleotides, and aminoacyl-tRNA. / Gromadski, Kirill B; Schümmer, Tobias; Strømgaard, Anne; Knudsen, Charlotte Rohde; Kinzy, Terri Goss; Rodnina, Marina V.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 282, Nr. 49, 2007, s. 35629-37.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  19. Udgivet

    The importance of P-loop and domain movements in EF-Tu for guanine nucleotide exchange. / Dahl, Louise Dyhrman; Wieden, Hans-Joachim; Rodnina, Marina; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 281, Nr. 30, 2006, s. 21139-21146.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  20. Udgivet

    Deconstructing PTI-1: PTI-1 is a truncated, but not mutated, form of translation elongation factor 1A1, eEF1A1. / Mansilla, Francisco; Hansen, LL; Jakobsen, Helle; Kjeldgaard, NO; Clark, Brian F. C.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Biochim. Biophys. Acta., Bind 1727, Nr. 2, 2005, s. 116-24.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  21. Udgivet

    Genbank accession number AY527403 Homo sapiens 10kDa eEF1A interacting protein. / Jensen, L.D.; Mansilla, Francisco; Knudsen, C.R.; Clark, B.F.C.

    2004.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  22. Udgivet

    Qβ-Phage resistance by deletion of the coiled-coil motif in elongation factor Ts. / Karring, H.; Mathu, S.G.J.; van Duin, J.; Clark, B.F.C.; Kraal, B.; Knudsen, C.R.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 279, 2004, s. 1878-1884.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  23. Udgivet

    Genbank accession numbers : AY745198, AY745199, AY745200, AY745201, AY745202, AY745203, AY745204, / Mansilla, F.; Knudsen, C.R.; Clark, B.F.C.

    2004.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportForskning

  24. Udgivet

    Functional effects of deleting the coiled-coil motif in Escherichia coli elongation factor Ts. / Karring, H.; Björnsson, A.; Thirup, S.; Clark, B.F.C.; Knudsen, C.R.

    I: F E B S Journal, Bind 270, 2003, s. 4294-4305.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  25. Udgivet

    Isolation of Qbeta polymerase complexes containing mutant species of elongation factor Tu. / Mathu, S.G.; Knudsen, C.R.; van Duin, J.; Kraal, B.

    I: J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci., Bind 786, 2003, s. 279-286.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  26. Udgivet

    Protein synthesis by single ribosomes. / Vanzi, F.; Vladimirov, S.; Knudsen, C.R.; Goldman, Y.E.; B.S., Cooperman.

    I: RNA, Bind 9, 2003, s. 1174-1179.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  27. Udgivet

    Application of the yeast two-hybrid system in molecular gerontology. / Knudsen, C.R.; Jadidi, M.; Friis, I.; Mansilla, Francisco.

    I: Biogerontology, Bind 3, Nr. 4, 2002, s. 243-256.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  28. Udgivet

    Mapping the human translation elongation factor eEF1H complex using the yeast two-hybrid system. / Mansilla, Francisco; Friis, Irene; Jadidi, Mandana; Nielsen, Karen Margrethe; Clark, Brian F. C.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Biochemical Journal, Bind 365, Nr. Pt 3, 2002, s. 669-76.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  29. Udgivet

    Novel interaction between the M4 muscarinic acetylcholine receptor and elongation factor 1A2. / McClatchy, D.B.; Knudsen, C.R.; Clark, Brian F. C.; Kahn, R.A.; Hall, R.A.; Levey, A.I.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 277, Nr. 32, 2002, s. 29268-29274.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  30. Udgivet

    Importance of structural transitions of the switch II region for the functions of elongation factor Tu on the ribosome. / Knudsen, C.; Wieden, H.J.; Rodnina, M.V.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 276, 2001, s. 22183-22190.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet

    Crystallization of the yeast elongation factor complex eEF1A-eEF1B alpha. / Pedersen, L.; Andersen, G.R.; Knudsen, C.R.; Kinzy, T.Goss; Nyborg, J.

    I: Acta Cryst. D Biol. Cryst., Bind 57, 2001, s. 159-161.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Crystallisation of the yeast elongation factor complex eEF1A:eEF1Bα. / Pedersen, Lise; Andersen, G.R.; Knudsen, C.R.; Kinzy, T.G.; Nyborg, J.

    I: Acta Cryst. D., Bind 57, 2000, s. 159-161.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    Point mutants of elongation factor Tu from E.coli impaired in binding aminoacyl-tRNA. / Knudsen, Charlotte Rohde; Mansilla, Francisco; Nautrup Pedersen, Gitte; Clark, Brian F.C.

    RNA Biochemistry and Biotechnology: Barciszewski, J., Clark, B.F.C. (ed.). NATO ASI Series, Kluwer Academic Publishers, 1999. s. 169-193.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskning

  34. Udgivet

    RNA biochemistry and biotechnology. / Knudsen, C.R.; Mansilla, F.; Pedersen, G.N.; Clark, B.F.C.; Barciszewski, J. (Redaktør); Clark, B.F.C. (Redaktør).

    Point mutants of elongation factor Tu from E. coli impaired in binding aminoacyl. NATO ASI Series, Kluwer Academic Publishers, 1999. s. 169-193.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskning

  35. Udgivet

    The elongation factor 1-alpha-2 isoform from rabbit: Cloning of the cDNA and characterisation of the protein. / Kahns, Søren; Lund, Ann; Kristensen, Peter; Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.; Cavallius, Jens; Merrick, William C.

    I: Nucl. Acids Res., Bind 245, 1998, s. 1884-1890.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  36. Udgivet

    Investigation of functional aspects of the N-terminal region of elongation factor Tu from Escherichia coli using a protein engineering approach. / Laurberg, M; Mansilla, Francisco; Clark, Brian F. C.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 273, Nr. 8, 1998, s. 4387-91.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  37. Udgivet

    Mutational analysis of Escherichia coli elongation factor Tu in search of a role for the N-terminal region. / Mansilla, Francisco; Knudsen, Charlotte Rohde; Laurberg, M; Clark, Brian F. C.

    I: Protein Engineering Design and Selection (Print), Bind 10, Nr. 8, 1998, s. 927-34.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  38. Udgivet

    Mutational analysis of Glu272 in elongation factor 1A of E. coli. / Mansilla, Francisco; Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.

    I: F E B S Letters, Bind 429, Nr. 3, 1998, s. 417-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  39. Udgivet

    The role of Glu259 in Escherichia coli elongation factor Tu in ternary complex formation. / Nautrup Pedersen, Gitte; Rattenborg, Thomas; Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.

    I: Protein Engineering Design and Selection (Print), Bind 11, Nr. 2, 1998, s. 101-8.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  40. Udgivet

    Hvad kan protein-engineering bruges til? Struktur-funktionsanalyse af elongeringsfaktor Tu ved anvendelse af protein engineering. / Knudsen, Charlotte Rohde.

    Carlsbergfondets årsskrift. 1997.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiFormidling

  41. Udgivet

    Mutational analysis of Escherichia coli elongation factor Tu in search of a role for the N-terminal region. / Mansilla, Francisco; Knudsen, Charlotte Rohde; Laurberg, M; Clark, BF.

    I: Protein Eng, Bind 10, Nr. 8, 1997, s. 927-34.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  42. Udgivet

    Structural requirements for the EF-Tu-directed kinase. / Plath, Thomas; Knudsen, Charlotte Rohde; Bilgin, Nese; Lindschau, Carsten; Erdmann, Volker A; Lippmann, Corinna.

    NATO ASI Series, Cell Biology. Bind 102 1997. s. 231.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskning

  43. Udgivet

    Contribution of Arg288 of Escherichia coli elongation factor Tu to translational functionality. / Rattenborg, Thomas; Nautrup-Pedersen, Gitte; Clark, Brian F. C.; Knudsen, Charlotte Rohde.

    I: F E B S Journal, Bind 249, Nr. 2, 1997, s. 408-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  44. Udgivet

    Site-directed mutagenesis of Arg58 and Asp86 of elongation factor Tu from Escherichia coli: effects on the GTPase reaction and aminoacyl-tRNA binding. / Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.

    I: Protein Engineering Design and Selection (Print), Bind 8, Nr. 12, 1996, s. 1267-73.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  45. Udgivet

    Mapping Escherichia coli elongation factor Tu residues involved in binding of aminoacyl-tRNA. / Wiborg, Ove; Andersen, C; Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.; Nyborg, Jens.

    I: Journal of Biological Chemistry, Bind 271, Nr. 34, 1996, s. 20406-11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  46. Udgivet

    Mutation of the conserved Gly83 and Gly94 in Escherichia coli elongation factor Tu. Indication of structural pivots. / Kjaersgård, I V; Knudsen, Charlotte Rohde; Wiborg, O.

    I: F E B S Journal, Bind 228, Nr. 1, 1995, s. 184-90.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  47. Udgivet

    Mutation of the conserved Gly94 and Gly126 in elongation factor Tu from Escherichia coli. Elucidation of their structural and functional roles. / Knudsen, Charlotte Rohde; Kjaersgård, I V; Wiborg, O; Clark, B F.

    I: F E B S Journal, Bind 228, Nr. 1, 1995, s. 176-83.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  48. Udgivet

    Towards an understanding of structure-function relationships of elongation factor Tu. / Wiborg, O; Andersen, C; Knudsen, Charlotte Rohde; Kristensen, T J; Clark, Brian F. C.

    I: Biotechnology and Applied Biochemistry, Bind 19 ( Pt 1), 1994, s. 3-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  49. Udgivet

    One-step purification of E. coli elongation factor Tu. / Knudsen, Charlotte Rohde; Clark, Brian F. C.; Degn, B; Wiborg, Ove.

    I: Biochemistry international, Bind 28, Nr. 2, 1993, s. 353-62.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review