Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

Asger Hobolth

  1. 2020
  2. Udgivet

    Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis. / PCAWG Drivers and Functional Interpretation Group; PCAWG Consortium.

    I: Communications Biology, Bind 3, Nr. 1, 56, 01.12.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  3. Udgivet

    Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower. / PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group; PCAWG Consortium.

    I: Nature Communications, Bind 11, Nr. 1, 734, 01.12.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  4. Udgivet

    Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data. / PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group; PCAWG Consortium.

    I: Nature Communications, Bind 11, Nr. 1, 735, 01.12.2020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  5. Udgivet

    Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes. / PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group; PCAWG Structural Variation Working Group; PCAWG Consortium.

    I: Nature, Bind 578, Nr. 7793, 06.02.2020, s. 102-111.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  6. 2019
  7. Udgivet

    ncdDetect2 : Improved models of the site-specific mutation rate in cancer and driver detection with robust significance evaluation. / Juul, Malene; Madsen, Tobias; Guo, Qianyun; Bertl, Johanna; Hobolth, Asger; Kellis, Manolis; Pedersen, Jakob Skou.

    I: Bioinformatics, Bind 35, Nr. 2, 15.01.2019, s. 189-199.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  8. Under udarbejdelse

    A Unifying Framework and Comparison of Algorithms for Non-negative Matrix Factorisation. / Hobolth, Asger; Guo, Qianyun; Kousholt, Astrid; Jensen, Jens Ledet.

    I: International Statistical Review, 2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  9. Udgivet

    A general framework for moment-based analysis of genetic data. / Speed, Maria; Balding, David Joseph; Hobolth, Asger.

    I: Journal of Mathematical Biology, Bind 78, Nr. 6, 2019, s. 1727-1769.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  10. Udgivet

    Phase-type distributions in population genetics. / Hobolth, Asger; Siri-Jegousse, Arno; Bladt, Mogens.

    I: Theoretical Population Biology, Bind 127, 2019, s. 16-32.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  11. 2018
  12. Udgivet

    Detecting archaic introgression using an unadmixed outgroup. / Skov, Laurits; Hui, Ruoyun; Shchur, Vladimir; Hobolth, Asger; Scally, Aylwyn; Schierup, Mikkel Heide; Durbin, Richard.

    I: PLOS Genetics, Bind 14, Nr. 9, e1007641, 01.09.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  13. Udgivet

    Non-parametric estimation of population size changes from the site frequency spectrum. / Waltoft, Berit Lindum; Hobolth, Asger.

    I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, Bind 17, Nr. 3, 11.06.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  14. Udgivet

    A site specific model and analysis of the neutral somatic mutation rate in whole-genome cancer data. / Bertl, Johanna; Guo, Qianyun; Juul, Malene; Besenbacher, Søren; Nielsen, Morten Muhlig; Hornshøj, Henrik; Pedersen, Jakob Skou; Hobolth, Asger.

    I: BMC Bioinformatics , Bind 19, Nr. 147, 19.04.2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  15. Udgivet

    Pan-cancer screen for mutations in non-coding elements with conservation and cancer specificity reveals correlations with expression and survival. / Hornshøj, Henrik; Nielsen, Morten Muhlig; Sinnott-Armstrong, Nicholas A; Świtnicki, Michał P; Juul, Malene; Madsen, Tobias; Sallari, Richard; Kellis, Manolis; Ørntoft, Torben; Hobolth, Asger; Pedersen, Jakob Skou.

    I: npj Genomic Medicine, Bind 3, 11.01.2018, s. 1.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  16. Udgivet

    Regmex : A statistical tool for exploring motifs in ranked sequence lists from genomics experiments. / Nielsen, Morten Muhlig; Tataru, Paula; Madsen, Tobias; Hobolth, Asger; Pedersen, Jakob Skou.

    I: Algorithms for Molecular Biology, Bind 13, Nr. 1, 17, 2018.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  17. 2017
  18. Udgivet

    A Site Specific Model And Analysis Of The Neutral Somatic Mutation Rate In Whole-Genome Cancer Data. / Bertl, Johanna; Guo, Qianyun; Rasmussen, Malene Juul; Besenbacher, Søren; Nielsen, Morten Muhlig; Hornshøj, Henrik; Pedersen, Jakob Skou; Hobolth, Asger.

    2017.

    Publikation: Working paperForskningpeer review

  19. Udgivet

    Non-coding cancer driver candidates identified with a sample- and position-specific model of the somatic mutation rate. / Rasmussen, Malene Juul; Bertl, Johanna; Guo, Qianyun; Nielsen, Morten Muhlig; Świtnicki, Michał; Hornshøj, Henrik; Madsen, Tobias; Hobolth, Asger; Pedersen, Jakob Skou.

    I: eLife, Bind 6, 31.03.2017.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  20. Udgivet

    Significance evaluation in factor graphs. / Madsen, Tobias; Hobolth, Asger; Jensen, Jens Ledet; Pedersen, Jakob Skou.

    I: BMC Bioinformatics , Bind 18, 31.03.2017, s. 199.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  21. Udgivet

    An alternative derivation of the stationary distribution of the multivariate neutral Wright–Fisher model for low mutation rates with a view to mutation rate estimation from site frequency data. / Schrempf, Dominik; Hobolth, Asger.

    I: Theoretical Population Biology, Bind 114, 2017, s. 88-94.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  22. 2016
  23. Udgivet

    Hvem er bedst? metoder til rangering i sport og videnskab. / Hobolth, Asger.

    I: Aktuel Naturvidenskab, Bind 5, 2016, s. 26-29.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelFormidling

  24. Udgivet

    Inferring Population Genetic Parameters: Particle Filtering, HMM, Ripley’s K-Function or Runs of Homozygosity? / Nielsen, Svend; Simonsen, Simon ; Hobolth, Asger.

    WABI 2016: 16th International Workshop. red. / Martin Frith; Christian Nørgaard Storm Pedersen. Bind 9838 Springer, 2016. s. 234-245 (Lecture Notes in Computer Science).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  25. Udgivet

    Motif discovery in ranked lists of sequences. / Nielsen, Morten Muhlig; Tataru, Paula; Madsen, Tobias; Hobolth, Asger; Pedersen, Jakob Skou.

    2016. s. 1-4.

    Publikation: Working paperForskning

  26. Udgivet

    Statistical Inference in the Wright–Fisher Model Using Allele Frequency Data. / Tataru, Paula; Simonsen, Maria; Bataillon, Thomas; Hobolth, Asger.

    I: Systematic Biology, 2016.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  27. Udgivet

    The multivariate Wright–Fisher process with mutation: Moment-based analysis and inference using a hierarchical Beta model. / Hobolth, Asger; Siren, Jukka.

    I: Theoretical Population Biology, Bind 108, 2016, s. 36-50.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  28. 2015
  29. Udgivet

    Inference Under a Wright-Fisher Model Using an Accurate Beta Approximation. / Tataru, Paula; Bataillon, Thomas; Hobolth, Asger.

    I: Genetics, Bind 201, Nr. 3, 11.2015, s. 1133-1141.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  30. Udgivet

    Extreme selective sweeps independently targeted the X chromosomes of the great apes. / Nam, Kiwoong; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Dutheil, Julien Yann; Veeramah, Krishna R; Woerner, August E; Hammer, Michael F; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide; Great Ape Genome Diversity Project.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Bind 112, Nr. 20, 04.05.2015.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  31. Udgivet

    The SMC' is a highly accurate approximation to the ancestral recombination graph. / Wilton, Peter R.; Carmi, Shai; Hobolth, Asger.

    I: Genetics (Print), Bind 200, Nr. 1, 1, 01.05.2015, s. 343-355.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  32. Udgivet

    Inference of purifying and positive selection in three subspecies of chimpanzees (Pan troglodytes) from exome sequencing. / Bataillon, Thomas; Duan, Jinjie; Hvilsom, Christina; Jin, Xin; Li, Yingrui; Skov, Laurits; Glemin, Sylvain; Munch, Kasper; Jiang, Tao; Qian, Yu; Hobolth, Asger; Wang, Jun; Mailund, Thomas; Siegismund, Hans R; Schierup, Mikkel H.

    I: Genome Biology and Evolution, Bind 7, Nr. 4, 04.2015, s. 1122-32.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  33. Udgivet

    The importance of distinguishing between the odds ratio and the incidence rate ratio in GWAS. / Waltoft, Berit Lindum; Pedersen, Carsten Bøcker; Nyegaard, Mette; Hobolth, Asger.

    I: B M C Medical Genetics, Bind 16, Nr. 1, 2015, s. 71.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  34. 2014
  35. Udgivet

    Strong selective sweeps associated with ampliconic regions in great ape X chromosomes. / Nam, Kiwoong; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Y. Dutheil, Julien; Veeramah, Krishna; Woerner, August; F. Hammer, Michael; Ape Genome Diversity Project, Great; Mailund, Thomas; H. Schierup, Mikkel.

    I: arXiv, 24.02.2014.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskning

  36. Udgivet

    Efficient computation in the IM model. / Andersen, Lars Nørvang; Mailund, Thomas; Hobolth, Asger.

    I: Journal of Mathematical Biology, Bind 68, Nr. 6, 2014, s. 1423-1451.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  37. Udgivet

    Markovian approximation to the finite loci coalescent with recombination along multiple sequences. / Hobolth, Asger; Jensen, Jens Ledet.

    I: Theoretical Population Biology, Bind 98, 2014, s. 48-58.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  38. Udgivet

    Sampling and summary statistics of endpoint-conditioned paths in DNA sequence evolution. / Hobolth, Asger; Jeff, Thorne.

    Bayesian Phylogenetics: Methods, Algorithms, and Applications. red. / Ming-Hui Chen; Lynn Kuo; Paul O. Lewis. Bind 1 1. udg. CRC Press, 2014.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

  39. 2013
  40. Udgivet

    Algorithms for Hidden Markov Models Restricted to Occurrences of Regular Expressions. / Tataru, Paula; Sand, Andreas; Hobolth, Asger; Mailund, Thomas; Pedersen, Christian Nørgaard Storm.

    I: Biology, Bind 2, Nr. 4, 08.11.2013, s. 1282-1295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  41. Udgivet

    Great ape genetic diversity and population history. / Prado-Martinez, Javier; Sudmant, Peter H; Kidd, Jeffrey M; Li, Heng; Kelley, Joanna L; Lorente-Galdos, Belen; Veeramah, Krishna R; Woerner, August E; O'Connor, Timothy D; Santpere, Gabriel; Cagan, Alexander; Theunert, Christoph; Casals, Ferran; Laayouni, Hafid; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Halager, Anders E; Malig, Maika; Hernandez-Rodriguez, Jessica; Hernando-Herraez, Irene; Prüfer, Kay; Pybus, Marc; Johnstone, Laurel; Lachmann, Michael; Alkan, Can; Twigg, Dorina; Petit, Natalia; Baker, Carl; Hormozdiari, Fereydoun; Fernandez-Callejo, Marcos; Dabad, Marc; Wilson, Michael L; Stevison, Laurie; Camprubí, Cristina; Carvalho, Tiago; Ruiz-Herrera, Aurora; Vives, Laura; Mele, Marta; Abello, Teresa; Kondova, Ivanela; Bontrop, Ronald E; Pusey, Anne; Lankester, Felix; Kiyang, John A; Bergl, Richard A; Lonsdorf, Elizabeth; Myers, Simon; Ventura, Mario; Gagneux, Pascal; Comas, David; Siegismund, Hans; Blanc, Julie; Agueda-Calpena, Lidia; Gut, Marta; Fulton, Lucinda; Tishkoff, Sarah A; Mullikin, James C; Wilson, Richard K; Gut, Ivo G; Gonder, Mary Katherine; Ryder, Oliver A; Hahn, Beatrice H; Navarro, Arcadi; Akey, Joshua M; Bertranpetit, Jaume; Reich, David; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H; Hvilsom, Christina; Andrés, Aida M; Wall, Jeffrey D; Bustamante, Carlos D; Hammer, Michael F; Eichler, Evan E; Marques-Bonet, Tomas.

    I: Nature, Bind 499, 2013, s. 471–475.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  42. 2012
  43. Udgivet

    A New Isolation with Migration Model along Complete Genomes Infers Very Different Divergence Processes among Closely Related Great Ape Species. / Mailund, Thomas; Halager, Anders E; Westergaard, Michael; Dutheil, Julien Y; Munch, Kasper; Andersen, Lars N; Lunter, Gerton; Prüfer, Kay; Scally, Aylwyn; Hobolth, Asger; Schierup, Mikkel H.

    I: P L o S Genetics, Bind 8, Nr. 12, 2012, s. e1003125.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  44. Udgivet

    Ancestral population genomics. / Hobolth, Asger.

    Evolutionary Genomics: Statistical and Computational Methods. red. / Maria Anisimova. Bind 856 Springer, 2012. s. 293-313.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

  45. Udgivet

    Extensive X-linked adaptive evolution in central chimpanzees. / Hvilsom, Christina; Qian, Yu; Bataillon, Thomas; Li, Yingrui; Mailund, Thomas; Sallé, Bettina; Carlsen, Frands; Li, Ruiqiang; Zheng, Hancheng; Jiang, Tao; Jiang, Hui; Jin, Xin; Munch, Kasper; Hobolth, Asger; Siegismund, Hans R; Wang, Jun; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  46. Udgivet

    Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence. / Scally, Aylwyn; Dutheil, Julien Y; Hillier, LaDeana W; Jordan, Gregory E; Goodhead, Ian; Herrero, Javier; Hobolth, Asger; Lappalainen, Tuuli; Mailund, Thomas; Marques-Bonet, Tomas; McCarthy, Shane; Montgomery, Stephen H; Schwalie, Petra C; Tang, Y Amy; Ward, Michelle C; Xue, Yali; Yngvadottir, Bryndis; Alkan, Can; Andersen, Lars N; Ayub, Qasim; Ball, Edward V; Beal, Kathryn; Bradley, Brenda J; Chen, Yuan; Clee, Chris M; Fitzgerald, Stephen; Graves, Tina A; Gu, Yong; Heath, Paul; Heger, Andreas; Karakoc, Emre; Kolb-Kokocinski, Anja; Laird, Gavin K; Lunter, Gerton; Meader, Stephen; Mort, Matthew; Mullikin, James C; Munch, Kasper; O'Connor, Timothy D; Phillips, Andrew D; Prado-Martinez, Javier; Rogers, Anthony S; Sajjadian, Saba; Schmidt, Dominic; Shaw, Katy; Simpson, Jared T; Stenson, Peter D; Turner, Daniel J; Vigilant, Linda; Vilella, Albert J; Whitener, Weldon; Zhu, Baoli; Cooper, David N; de Jong, Pieter; Dermitzakis, Emmanouil T; Eichler, Evan E; Flicek, Paul; Goldman, Nick; Mundy, Nicholas I; Ning, Zemin; Odom, Duncan T; Ponting, Chris P; Quail, Michael A; Ryder, Oliver A; Searle, Stephen M; Warren, Wesley C; Wilson, Richard K; Schierup, Mikkel H; Rogers, Jane; Tyler-Smith, Chris; Durbin, Richard.

    I: Nature, Bind 483, Nr. 7388, 2012, s. 169-75.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  47. Udgivet

    Markov bridges, bisection and variance reduction. / Asmussen, Søren; Hobolth, Asger.

    Monte Carlo and Quasi-Monte Carlo Methods 2010. red. / Leszek Plaskota; Henryk Wozniakowski. Springer, 2012. s. 3-22 (Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, Bind 23).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/proceedingKonferencebidrag i proceedingsForskningpeer review

  48. Udgivet

    The bonobo genome compared with the chimpanzee and human genomes. / Prüfer, Kay; Munch, Kasper; Hellmann, Ines; Akagi, Keiko; Miller, Jason R; Walenz, Brian; Koren, Sergey; Sutton, Granger; Kodira, Chinnappa; Winer, Roger; Knight, James R; Mullikin, James C; Meader, Stephen J; Ponting, Chris P; Lunter, Gerton; Higashino, Saneyuki; Hobolth, Asger; Dutheil, Julien; Karakoç, Emre; Alkan, Can; Sajjadian, Saba; Catacchio, Claudia Rita; Ventura, Mario; Marques-Bonet, Tomas; Eichler, Evan E; André, Claudine; Atencia, Rebeca; Mugisha, Lawrence; Junhold, Jörg; Patterson, Nick; Siebauer, Michael; Good, Jeffrey M; Fischer, Anne; Ptak, Susan E; Lachmann, Michael; Symer, David E; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel H; Andrés, Aida M; Kelso, Janet; Pääbo, Svante.

    I: Nature, Bind 486, Nr. 7404, 2012, s. 527-31.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  49. 2011
  50. Udgivet

    Comparison of methods for calculating conditional expectations of sufficient statistics for continuous time Markov chains. / Tataru, Paula Cristina; Hobolth, Asger.

    I: B M C Bioinformatics, Bind 12, Nr. 1, 05.12.2011, s. 465.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  51. Udgivet

    Markov bridges, bisection and variance reduction. / Asmussen, Søren; Hobolth, Asger.

    Thiele Centre, Institut for Matematiske Fag, Aarhus Universitet, 2011.

    Publikation: Working paperForskning

  52. Udgivet

    Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes. / Locke, Devin P.; Hillier, LaDeana W.; Warren, Wesley C.; Yang, Shiaw-Pyng; Wang, Zhengyuan; Chinwalla, Asif T.; Minx, Pat; Mitreva, Makedonka; Cook, Lisa; Delehaunty, Kim D.; Fronick, Catrina; Schmidt, Heather; Fulton, Lucinda A.; Fulton, Robert S.; Nelson, Joanne O.; Magrini, Vincent; Pohl, Craig; Graves, Tina A.; Markovic, Chris; Weinstock, George M.; Mardis, Elaine R.; Wilson, Richard K.; Worley, Kim C.; Nazareth, Lynne V.; Muzny, Donna M.; Cree, Andy; Dinh, Huyen H.; Hume, Jennifer; Kovar, Christie L.; Fowler, Gerald R.; Rogers, Jeffrey; Gibbs, Richard A.; Lunter, Gerton; Meader, Stephen; Heger, Andreas; Ponting, Chris P.; Marques-Bonet, Tomas; Alkan, Can; Cheng, Lin; Cheng, Ze; Kidd, Jeffrey M.; Eichler, Evan E.; Faria, Rui; Fernando, Olga; Darré, Fleur; Farré, Domèmec; Gazave, Elodie; Oliva, Meritxell; Navarro, Arcadi; White, Simon; Searle, Stephen; Vilella, Albert J.; Chen, Yuan; Flicek, Paul; Herrero, Javier; Ma, Jian; Raney, Brian; Suh, Bernard; Haussler, David; Burhans, Richard; Ratan, Aakrosh; Harris, Robert S.; Miller, Webb; Roberto, Roberta; Capozzi, Oronzo; Archidiacono, Nicoletta; Rocchi, Mariano; Della Valle, Giuliano; Purgato, Stefania; Konkel, Miriam K.; Walker, Jerilyn A.; Batzer, Mark A.; Ullmer, Brygg; Smit, Adrian F. A.; Hubley, Robert; Casola, Claudio; Schrider, Daniel R.; Hahn, Matthew W.; Quesada, Victor; Puente, Xose S.; Ordoñez, Gonzalo R.; López-Otín, Carlos; Vinar, Tomas; Brejova, Brona; Kosiol, Carolin; Lawson, Heather A.; Taliwal, Vikas; Martins, André L.; Siepel, Adam; Ma, Xin; Degenhardt, Jeremiah; RoyChoudhury, Arindam; Bustamante, Carlos D.; Gutenkunst, Ryan N.; Mailund, Thomas; Dutheil, Julien; Hobolth, Asger; Schierup, Mikkel Heide; Ryder, Oliver A.; Yoshinaga, Yuko; de Jong, Pieter J.

    I: Nature, Bind 469, 2011, s. 529-533.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  53. Udgivet

    Estimating Divergence Time and Ancestral Effective Population Size of Bornean and Sumatran Orangutan Subspecies Using a Coalescent Hidden Markov Model. / Mailund, Thomas; Dutheil, Julien; Hobolth, Asger; Lunter, Gerton; Schierup, Mikkel Heide.

    I: P L o S Genetics, Bind 7, Nr. 3, 2011.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  54. Udgivet

    Incomplete lineage sorting patterns among human, chimpanzee and orangutan suggest recent orangutan speciation and widespread selection. / Hobolth, Asger; Dutheil, Julien; Hawks, John; Schierup, Mikkel Heide; Mailund, Thomas.

    I: Genome Research, Bind 21, Nr. 3, 2011, s. 349-356.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  55. Udgivet

    On computing the coalescence time density in an isolation-with-migration model with few samples. / Hobolth, Asger; Andersen, Lars Nørvang; Mailund, Thomas.

    I: Genetics, Bind 187, 2011, s. 1242-1243.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisLetterForskningpeer review

  56. Udgivet

    Summary statistics for endpoint-conditioned continuous-time Markov chains. / Hobolth, Asger; Jensen, Jens Ledet.

    I: Journal of Applied Probability, Bind 48, Nr. 4, 2011, s. 911-924.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  57. 2010
  58. Udgivet

    Summary statistics for end-point conditioned continuous-time Markov chains. / Hobolth, Asger; Jensen, Jens Ledet.

    Århus : Thiele Centre, Institut for Matematiske Fag, Aarhus Universitet, 2010.

    Publikation: Working paperForskning

  59. 2009
  60. Udgivet

    Ancestral population genomics : the coalescent hidden Markov model approach. / Dutheil, Julien; Ganapathy, Ganesh; Hobolth, Asger; Mailund, Thomas; Uyenoyama, Marcy; Schierup, Mikkel Heide.

    I: Genetics, Bind 183, Nr. 1, 2009, s. 259–274.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  61. Udgivet

    Simulation from endpoint-conditioned, continuous-time Markov chains on a finite state space, with applications to molecular evolution. / Hobolth, Asger; Stone, Eric.

    I: Annals of Applied Statistics, Bind 3, Nr. 3, 2009, s. 1204-1231.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  62. Udgivet

    The genealogy, site frequency spectrum and ages of two nested mutant alleles. / Hobolth, Asger; Wiuf, Carsten Henrik.

    I: Theoretical Population Biology, Bind 75, Nr. 4, 2009, s. 260-265.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  63. 2008
  64. Udgivet

    A Markov chain Monte Carlo Expectation Maximization Algorithm for Statistical Analysis of DNA Sequence Evolution with Neighbor-Dependent Substitution Rates. / Hobolth, Asger.

    I: Journal of Computational and Graphical Statistics, Bind 17, Nr. 1, 2008, s. 138-162.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  65. Udgivet

    Importance sampling for the infinite sites model. / Hobolth, Asger; Uyenoyama, Marcy K; Wiuf, Carsten.

    I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, Bind 7, Nr. 1, 2008.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  66. 2007
  67. Udgivet

    Bayesian regularization of diffusion tensor images. / Frandsen, Jesper; Hobolth, Asger; Østergaard, Leif; Vestergaard-Poulsen, Peter; Jensen, Eva Bjørn Vedel.

    I: Biostatistics, Bind 8, Nr. 4, 2007, s. 784-799.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  68. Udgivet

    Genomic Relationships and Speciation Times of Human, Chimpanzee and Gorilla inferred from a Coalescent Hidden Markov Model. / Hobolth, Asger; Christensen, Ole Fredslund; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    2007. Poster session præsenteret ved Beyond the HapMap, Boston, USA.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  69. Udgivet

    Genomic relationships and speciation times of human, chimpanzee and gorilla inferred from a coalescent hidden Markov model. / Hobolth, Asger; Christensen, Ole Fredslund; Mailund, Thomas; Schierup, Mikkel Heide.

    I: P L o S Genetics, Bind 3, Nr. 2, 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  70. 2006
  71. Udgivet

    Regularization of Diffusion Tensor Fields in Axonal Fibre Tracking. / Frandsen, Jesper; Hobolth, Asger; Østergaard, Leif; Vestergaard-Poulsen, Peter; Vedel, Eva Bjørn.

    2006. Poster session præsenteret ved PhD Day 2006, The Faculty of Health Sciences, Aarhus, Danmark.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  72. 2005
  73. Udgivet

    Comparative analysis of protein coding sequences from Human, Mouse and the domesticated Pig. / Jørgensen, Frank Grønlund; Hobolth, Asger; Hornshøj, Henrik; Bendixen, Christian; Fredholm, Merete; Schierup, Mikkel Heide.

    I: B M C Biology, Bind 3, Nr. 2, 2005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  74. Udgivet

    Shape discrimination by total curvature, with a view to cancer diagnostics. / Gardner, R.J.; Hobolth, Asger; Jensen, Eva Bjørn Vedel; Sørensen, Flemming Brandt.

    I: J. Microsc., Bind 217, 2005, s. 49-59.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  75. 2004
  76. Udgivet

    Pseudo-likelihood analysis of context-dependent codon substitution models. / Christensen, O.F.; Hobolth, Asger; Jensen, J.L.

    2004. s. A-59.

    Publikation: Working paperForskning

  77. Udgivet

    Shape modelling of spatial particles from planar central sections - a case study. / Hannila, Marja-Leena; Jensen, Eva B. Vedel; Hobolth, Asger; Nyengaard, Jens Randel.

    I: Journal of Microscopy, Bind 215, Nr. 2, 2004, s. 183-190.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  78. 2002
  79. Udgivet

    A note on design-based versus model-based variance estimation in stereology. / Hobolth, Asger; Jensen, Eva B. Vedel.

    I: Advances in Applied Probability, Bind 34, 2002, s. 484-490.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  80. Udgivet

    Statistical shape analysis of featureless objects. / Hobolth, Asger.

    Department of Mathematical Sciences, Aarhus University, 2002. 143 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  81. Udgivet

    Stereological analysis of shape. / Hobolth, Asger; Jensen, Eva Bjørn Vedel.

    I: Image Analysis and Stereology, Bind 21, Nr. 4, 2002, s. S23-S29.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review

  82. 2000
  83. Udgivet

    Modelling stochastic chances in curve shape, with an application to cancer diagnostics. / Hobolth, A; Jensen, Eva B. Vedel.

    I: Advances in Applied Probability, Bind 32, Nr. 2, 2000, s. 344-362.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift/Konferencebidrag i tidsskrift /Bidrag til avisTidsskriftartikelForskningpeer review